Numerycznie zaawansowana demodulacja fazy i amplitudy na potrzeby interferencyjnej mikroskopii optycznej z elementami tomografii
2017/25/B/ST7/02049
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST7_5: Mikro- i nanoelektronika, optoelektronika
Panel
ST7 – Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika
Jednostka realizująca
Politechnika Warszawska, Wydział Mechatroniki
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs
OPUS 13 – ogłoszony 2017-03-15
- Przyznana kwota
- 1 265 602 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2018-01-19
- Zakończenie projektu
- 2021-07-18
- Planowany czas trwania projektu
- 42 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Komputer do obliczeń naukowych (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
- Laser (2 szt.). Za kwotę 11 000 PLN
- Obiektyw mikroskopowy wysokiej jakości (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
- Stolik sterowany piezoelektrycznie i kontroler. Za kwotę 25 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (24)
-
Spatially multiplexed interferometric microscopy: principles and applications to biomedical imaging
- Autorzy:
- José Ángel Picazo-Bueno, Maciej Trusiak, Javier García, Vicente Micó
- Czasopismo:
- Journal of Physics: Photonics (rok: 2021, tom: 3(3), strony: 34005), Wydawca: IOP Publishing
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1088/2515-7647/abfc59 – link do publikacji
-
FPM app: an open-source MATLAB application for simple and intuitive Fourier ptychographic reconstruction
- Autorzy:
- Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
- Czasopismo:
- Bioinformatics (rok: 2021, tom: btab237, strony: btab237), Wydawca: Oxford Academic
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/bioinformatics/btab237 – link do publikacji
-
Common-path intrinsically achromatic optical diffraction tomography
- Autorzy:
- Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Krzysztof Patorski, Paweł Gocłowski, Michał Ziemczonok, Michał Józwik, Małgorzata Kujawińska, and Maciej Trusiak
- Czasopismo:
- Biomedical Optics Express (rok: 2021, tom: 12(7), strony: 4219-4234), Wydawca: OSA The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/BOE.428828 – link do publikacji
-
DarkFocus: numerical autofocusing in digital in-line holographic microscopy using variance of computational dark-field gradient
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Piotr Zdańkowski, Vicente Mico
- Czasopismo:
- Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 134, strony: 106195), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.optlaseng.2020.106195 – link do publikacji
-
Single-shot two-frame π-shifted spatially multiplexed interference phase microscopy
- Autorzy:
- M Trusiak, JA Picazo-Bueno, K Patorski, P Zdankowski, V Mico
- Czasopismo:
- Journal of Biomedical Optics (rok: 2019, tom: 24(9), strony: 096004-1 : 096004-8), Wydawca: SPIE
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1117/1.JBO.24.9.096004 – link do publikacji
-
Single-shot isotropic quantitative phase microscopy based on color-multiplexed differential phase contrast
- Autorzy:
- Y Fan, J Sun, Q Chen, X Pan, M Trusiak, C Zuo
- Czasopismo:
- APL Photonics (rok: 2019, tom: 4 (12), strony: 121301-1 : 121301:12), Wydawca: AIP Publishing
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1063/1.5124535 – link do publikacji
-
DeepDensity: Convolutional neural network based estimation of local fringe pattern density
- Autorzy:
- M. Cywińska, F. Brzeski, W. Krajnik, K. Patorski, C. Zuo, M. Trusiak
- Czasopismo:
- Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 145, strony: 106675), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.optlaseng.2021.106675 – link do publikacji
-
Automatized fringe pattern preprocessing using unsupervised variational image decomposition
- Autorzy:
- M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2019, tom: 16/27, strony: 22542-22562), Wydawca: OSA - The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.27.022542 – link do publikacji
-
High-speed 3D shape measurement using the optimized composite fringe patterns and stereo-assisted structured light system
- Autorzy:
- W. Yin, S. Feng, T. Tao, L. Huang, M. Trusiak, Q. Chen, C. Zuo
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2019, tom: 46108, strony: 2411-2431), Wydawca: OSA The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.27.002411 – link do publikacji
-
Hilbert–Huang transform based advanced Bessel fringe generation and demodulation for full-field vibration studies of specular reflection micro-objects
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Adam Styk, Krzysztof Patorski
- Czasopismo:
- Optics and Lasers in Engineering (rok: 2018, tom: 110, strony: 100-112), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.optlaseng.2018.05.021 – link do publikacji
-
Full-field vibration profilometry using time-averaged interference microscopy aided by variational analysis
- Autorzy:
- M Cywińska, M Trusiak, A Styk, K Patorski
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2020, tom: 28(1), strony: 435-450), Wydawca: OSA - The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.28.000435 – link do publikacji
-
Temporal phase unwrapping using deep learning
- Autorzy:
- W Yin, Q Chen, S Feng, T Tao, L Huang, M Trusiak, A Asundi, C Zuo
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9 (1), strony: 20175, 1-12), Wydawca: Nature Publishing Group
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-019-56222-3 – link do publikacji
-
Enhancing single-shot fringe pattern phase demodulation using advanced variational image decomposition
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Chao Zuo, Krzysztof Patorski
- Czasopismo:
- Journal of Optics (rok: 2019, tom: 21(4), strony: 45702), Wydawca: IOP Publishing
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1088/2040-8986/ab078e – link do publikacji
-
Full volume super-resolution imaging of thick mitotic spindle using 3D AO STED microscope
- Autorzy:
- Piotr Zdankowski, David McGloin, Jason Swedlow
- Czasopismo:
- Biomedical Optics Express (rok: 2019, tom: 10, strony: 46037), Wydawca: Optical Society of America
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/BOE.10.001999 – link do publikacji
-
Three-level transmittance 2D grating with reduced spectrum and its self-imaging
- Autorzy:
- Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Maciej Trusiak
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 1854-1868), Wydawca: Optical Society of America
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.27.001854 – link do publikacji
-
Single-shot slightly off-axis digital holographic microscopy with add-on module based on beamsplitter cube
- Autorzy:
- J. A. Picazo-Bueno, M. Trusiak, V. Micó
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 5655-5669), Wydawca: Optical Society of America
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.27.005655 – link do publikacji
-
Moiré microstructure generated binary amplitude gratings for suppression of high diffraction orders
- Autorzy:
- Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, MaciejTrusiak
- Czasopismo:
- Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 147, strony: 106731), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.optlaseng.2021.106731 – link do publikacji
-
Variational Hilbert Quantitative Phase Imaging
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Chao Zuo, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 13955), Wydawca: Nature Publishing
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-020-69717-1 – link do publikacji
-
Off-axis digital holographic multiplexing for rapid wavefront acquisition and processing
- Autorzy:
- Natan T. Shaked, Vicente Micó, Maciej Trusiak, Arkadiusz Kuś, and Simcha K. Mirsky
- Czasopismo:
- Advances in Optics and Photonics (rok: 2020, tom: 12(3), strony: 556-611), Wydawca: OSA The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/AOP.384612 – link do publikacji
-
Automatic fringe pattern enhancement using truly adaptive period-guided bidimensional empirical mode decomposition
- Autorzy:
- Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak, Azeem Ahmad, Adam Styk, Vicente Mico, Balpreet S. Ahluwalia, and Krzysztof Patorski
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6277-6293), Wydawca: OSA The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.382543 – link do publikacji
-
Grating deployed total-shear 3-beam interference microscopy with reduced temporal coherence
- Autorzy:
- Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, and Maciej Trusiak
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6893-6908), Wydawca: OSA The Optical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.383201 – link do publikacji
-
Variable zoom digital in-line holographic microscopy
- Autorzy:
- M Sanz, M Trusiak, J García, V Micó
- Czasopismo:
- Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 127, strony: 105939), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.optlaseng.2019.105939 – link do publikacji
-
5-beam grating interferometry for extended phase gradient sensing
- Autorzy:
- Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Maciej Trusiak
- Czasopismo:
- Optics Express (rok: 2018, tom: 26, strony: 26872-26887), Wydawca: Optical society of America
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1364/OE.26.026872 – link do publikacji
-
Numerically Enhanced Stimulated Emission Depletion Microscopy with Adaptive Optics for Deep-Tissue Super-Resolved Imaging
- Autorzy:
- P Zdankowski, M Trusiak, D McGloin, JR Swedlow
- Czasopismo:
- ACS Nano (rok: 2020, tom: 14, strony: 9b05891), Wydawca: American Chemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acsnano.9b05891 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (20)
-
Single-frame fringe pattern analysis using modified variational image decomposition aided by the Hilbert transform for fast full-field quantitative phase imaging
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Vicente Mico, Krzysztof Patorski
- Konferencja:
- SPIE Photonics Europe, 2018, Strasbourg, France (rok: 2018, strony: 106772B), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 22-26.04.2018
- Status:
- Opublikowana
-
Quasi-noise-free stimulated emission depletion microscopy imaging of thick samples using adaptive optics and block-matching 3D filtering
- Autorzy:
- Piotr Zdankowski, Maciej Trusiak, David McGloin, and Jason R. Swedlow
- Konferencja:
- Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, strony: ITh1C.4), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
- Data:
- konferencja 24-27 . 06
- Status:
- Opublikowana
-
High space-bandwidth product phase imaging using VHQPI numerical add-on
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Krzysztof Patorski, and Maciej Trusiak
- Konferencja:
- Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, strony: NTu1C.3), Wydawca: OSA The Optical Society
- Data:
- konferencja 12-16.04.2021
- Status:
- Opublikowana
-
Practical Improvements Into the Fourier Ptychographic Microscopy Reconstruction Path
- Autorzy:
- Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
- Konferencja:
- Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, strony: NF2C.6), Wydawca: OSA The Optical Society
- Data:
- konferencja 12-16.04.2021
- Status:
- Opublikowana
-
Total-shear grating based optical diffraction tomography
- Autorzy:
- Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak
- Konferencja:
- Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, strony: DM1A.5), Wydawca: OSA The Optical Society
- Data:
- konferencja 12-16.04.2021
- Status:
- Opublikowana
-
Single-shot two-frame interference microscopy for robust quantitative phase imaging of fixed and dynamic samples
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Mikołaj Rogalski, Maria Cywinska, Piotr Zdańkowski, Vicente Micó
- Konferencja:
- SPIE Optical Metrology (rok: 2021, strony: 1178614), Wydawca: SPIE
- Data:
- konferencja 21-26.06.2021
- Status:
- Opublikowana
-
Modified variational image decomposition algorithm aided by the Hilbert transform as an alternative to 2D Hilbert-Huang transform for fringe pattern phase retrieval
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Jose Angel Picazo-Bueno, Vicente Mico
- Konferencja:
- SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, strony: 1083422), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 10-12.09.2018
- Status:
- Opublikowana
-
An adaptive optics 3D STED microscope for super-resolution imaging of thick samples with background noise suppression using digital image processing
- Autorzy:
- Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Jason R. Swedlow
- Konferencja:
- SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, strony: 108342G), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 10-12.09.2018
- Status:
- Opublikowana
-
Multi-beam spatially multiplexed interference microscopy for phase objects examination
- Autorzy:
- Piotr Zdańkowski, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
- Konferencja:
- SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, strony: 107490J), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 19-23.08.2018
- Status:
- Opublikowana
-
Variational approach in time-averaged interference microscopy for full-field vibration profilometry
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Adam Styk, and Krzysztof Patorski
- Konferencja:
- Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, strony: M3B.5), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
- Data:
- konferencja 19-23 . 05
- Status:
- Opublikowana
-
Amplitude checker grating-based multichannel lateral shear interferometry for extended aberration sensing
- Autorzy:
- Łukasz Służewski, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
- Konferencja:
- SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, strony: 107490N), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 18-23.08.2018
- Status:
- Opublikowana
-
Biological phase sample study using variational Hilbert imaging technique
- Autorzy:
- Maria Cywińska; Maciej Trusiak; Krzysztof Patorski
- Konferencja:
- SPIE Photonics West BiOS, 2019, San Francisco, California, United States (rok: 2019, strony: 108872F), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 2-7 . 02
- Status:
- Opublikowana
-
Common-path two-shot binary checker grating based interference microscope for quantitative bio-phase imaging
- Autorzy:
- Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, and Maciej Trusiak
- Konferencja:
- Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, strony: W1B.5), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
- Data:
- konferencja 19-23 . 05
- Status:
- Opublikowana
-
Variational Hilbert Phase Imaging for Prostate Cell Analysis
- Autorzy:
- M. Cywinska, M. Trusiak, K. Patorski, P. Zdankowski, J.A. Picazo-Bueno, V. Mico
- Konferencja:
- Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, strony: http://www.focusonmicroscopy.org/2019/index.html), Wydawca: FOM2019
- Data:
- konferencja 14-17 . 04
- Status:
- Opublikowana
-
Machine-learning based fast unsupervised variational image decomposition for fringe pattern analysis
- Autorzy:
- Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski
- Konferencja:
- SPIE Optical Engineering + Applications - Interferometry XX (rok: 2020, strony: 114900D), Wydawca: SPIE Proceedings
- Data:
- konferencja 24-28.08.2020
- Status:
- Opublikowana
-
Moiré effect-based interference microscopy for biospecimen characterization
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
- Konferencja:
- SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, strony: 107490H), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 18-23.08.2018
- Status:
- Opublikowana
-
3D STED Deep Tissue Imaging Using Adaptive Optics
- Autorzy:
- P. Zdankowski, M. Trusiak, D. Mcgloin, J.R. Swedlow
- Konferencja:
- Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, strony: http://www.focusonmicroscopy.org/2019/index.html), Wydawca: FOM2019
- Data:
- konferencja 14-17 . 04
- Status:
- Opublikowana
-
Upgrading a brightfield optical microscope into a robust numerically advanced interference-based phase imager
- Autorzy:
- Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose-Angel Picazo-Bueno, and Javier Garcia
- Konferencja:
- Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, strony: CW4A.5), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
- Data:
- konferencja 24-27 . 06
- Status:
- Opublikowana
-
Analysis of fringe patterns with variable density using modified variational image decomposition aided by the Hilbert Transform
- Autorzy:
- M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
- Konferencja:
- 21st Czech-Polish-Slovak Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics, 2018, Lednice, Czech Republic (rok: 2018, strony: 1097609), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 03-07.09.2018
- Status:
- Opublikowana
-
Adaptive information retrieval in automated fringe based full-field optical metrology
- Autorzy:
- K. Patorski, M. Trusiak
- Konferencja:
- SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, strony: 1083404), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
- Data:
- konferencja 10-12.09.2018
- Status:
- Opublikowana
Publikacje książkowe (1)
-
Interferometric Methods in NDE
- Autorzy:
- Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
- Książka:
- Handbook of Advanced Non-Destructive Evaluation (rok: 2018, tom: 1, strony: 46044), Wydawca: Springer, Cham
- Status:
- Opublikowana