Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Numerycznie zaawansowana demodulacja fazy i amplitudy na potrzeby interferencyjnej mikroskopii optycznej z elementami tomografii

2017/25/B/ST7/02049

Słowa kluczowe:

obrazowanie fazy i amplitudy mikroskopia interferencyjna transformacja Hilberta-Huanga tomografia interferencyjna mikroskopia biologiczna bez znaczników

Deskryptory:

  • ST7_5: Mikro- i nanoelektronika, optoelektronika

Panel:

ST7 - Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika

Jednostka realizująca:

Politechnika Warszawska, Wydział Mechatroniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Maciej Trusiak 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 1 265 602 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-01-01

Zakończenie projektu: 2021-07-18

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Laser (2 szt.). Za kwotę 11 000 PLN
  2. Obiektyw mikroskopowy wysokiej jakości (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
  3. Komputer do obliczeń naukowych (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
  4. Stolik sterowany piezoelektrycznie i kontroler. Za kwotę 25 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (24)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (20)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Full volume super-resolution imaging of thick mitotic spindle using 3D AO STED microscope
    Autorzy:
    Piotr Zdankowski, David McGloin, Jason Swedlow
    Czasopismo:
    Biomedical Optics Express (rok: 2019, tom: 10, strony: 45306), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  2. Hilbert–Huang transform based advanced Bessel fringe generation and demodulation for full-field vibration studies of specular reflection micro-objects
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Adam Styk, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2018, tom: 110, strony: 100-112), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2018.05.021 - link do publikacji
  3. Off-axis digital holographic multiplexing for rapid wavefront acquisition and processing
    Autorzy:
    Natan T. Shaked, Vicente Micó, Maciej Trusiak, Arkadiusz Kuś, and Simcha K. Mirsky
    Czasopismo:
    Advances in Optics and Photonics (rok: 2020, tom: 12(3), strony: 556-611), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/AOP.384612 - link do publikacji
  4. Single-shot isotropic quantitative phase microscopy based on color-multiplexed differential phase contrast
    Autorzy:
    Y Fan, J Sun, Q Chen, X Pan, M Trusiak, C Zuo
    Czasopismo:
    APL Photonics (rok: 2019, tom: 4 (12), strony: 121301-1 : 121301:12), Wydawca: AIP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5124535 - link do publikacji
  5. Single-shot two-frame π-shifted spatially multiplexed interference phase microscopy
    Autorzy:
    M Trusiak, JA Picazo-Bueno, K Patorski, P Zdankowski, V Mico
    Czasopismo:
    Journal of Biomedical Optics (rok: 2019, tom: 24(9), strony: 096004-1 : 096004-8), Wydawca: SPIE
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/1.JBO.24.9.096004 - link do publikacji
  6. Automatic fringe pattern enhancement using truly adaptive period-guided bidimensional empirical mode decomposition
    Autorzy:
    Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak, Azeem Ahmad, Adam Styk, Vicente Mico, Balpreet S. Ahluwalia, and Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6277-6293), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.382543 - link do publikacji
  7. Automatized fringe pattern preprocessing using unsupervised variational image decomposition
    Autorzy:
    M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 16/27, strony: 22542-22562), Wydawca: OSA - The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.022542 - link do publikacji
  8. DarkFocus: numerical autofocusing in digital in-line holographic microscopy using variance of computational dark-field gradient
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Piotr Zdańkowski, Vicente Mico
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 134, strony: 106195), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2020.106195 - link do publikacji
  9. FPM app: an open-source MATLAB application for simple and intuitive Fourier ptychographic reconstruction
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2021, tom: btab237, strony: btab237), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btab237 - link do publikacji
  10. Grating deployed total-shear 3-beam interference microscopy with reduced temporal coherence
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6893-6908), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.383201 - link do publikacji
  11. Moiré microstructure generated binary amplitude gratings for suppression of high diffraction orders
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, MaciejTrusiak
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 147, strony: 106731), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2021.106731 - link do publikacji
  12. Single-shot slightly off-axis digital holographic microscopy with add-on module based on beamsplitter cube
    Autorzy:
    J. A. Picazo-Bueno, M. Trusiak, V. Micó
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 5655-5669), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.005655 - link do publikacji
  13. Spatially multiplexed interferometric microscopy: principles and applications to biomedical imaging
    Autorzy:
    José Ángel Picazo-Bueno, Maciej Trusiak, Javier García, Vicente Micó
    Czasopismo:
    Journal of Physics: Photonics (rok: 2021, tom: 3(3), strony: 34005), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2515-7647/abfc59 - link do publikacji
  14. Three-level transmittance 2D grating with reduced spectrum and its self-imaging
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 1854-1868), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.001854 - link do publikacji
  15. Variable zoom digital in-line holographic microscopy
    Autorzy:
    M Sanz, M Trusiak, J García, V Micó
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 127, strony: 105939), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2019.105939 - link do publikacji
  16. DeepDensity: Convolutional neural network based estimation of local fringe pattern density
    Autorzy:
    M. Cywińska, F. Brzeski, W. Krajnik, K. Patorski, C. Zuo, M. Trusiak
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 145, strony: 106675), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2021.106675 - link do publikacji
  17. Variational Hilbert Quantitative Phase Imaging
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Chao Zuo, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 13955), Wydawca: Nature Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-020-69717-1 - link do publikacji
  18. 5-beam grating interferometry for extended phase gradient sensing
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2018, tom: 26, strony: 26872-26887), Wydawca: Optical society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.26.026872 - link do publikacji
  19. Common-path intrinsically achromatic optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Krzysztof Patorski, Paweł Gocłowski, Michał Ziemczonok, Michał Józwik, Małgorzata Kujawińska, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Biomedical Optics Express (rok: 2021, tom: 12(7), strony: 4219-4234), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/BOE.428828 - link do publikacji
  20. Numerically Enhanced Stimulated Emission Depletion Microscopy with Adaptive Optics for Deep-Tissue Super-Resolved Imaging
    Autorzy:
    P Zdankowski, M Trusiak, D McGloin, JR Swedlow
    Czasopismo:
    ACS Nano (rok: 2020, tom: 14, strony: 9b05891), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsnano.9b05891 - link do publikacji
  21. Enhancing single-shot fringe pattern phase demodulation using advanced variational image decomposition
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Chao Zuo, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Journal of Optics (rok: 2019, tom: 21(4), strony: 45702), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2040-8986/ab078e - link do publikacji
  22. Full-field vibration profilometry using time-averaged interference microscopy aided by variational analysis
    Autorzy:
    M Cywińska, M Trusiak, A Styk, K Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(1), strony: 435-450), Wydawca: OSA - The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.28.000435 - link do publikacji
  23. High-speed 3D shape measurement using the optimized composite fringe patterns and stereo-assisted structured light system
    Autorzy:
    W. Yin, S. Feng, T. Tao, L. Huang, M. Trusiak, Q. Chen, C. Zuo
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 45378, strony: 2411-2431), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.002411 - link do publikacji
  24. Temporal phase unwrapping using deep learning
    Autorzy:
    W Yin, Q Chen, S Feng, T Tao, L Huang, M Trusiak, A Asundi, C Zuo
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9 (1), strony: 20175, 1-12), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-56222-3 - link do publikacji
  1. Variational approach in time-averaged interference microscopy for full-field vibration profilometry
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Adam Styk, and Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 19-23 . 05
    Status:
    Opublikowana
  2. Analysis of fringe patterns with variable density using modified variational image decomposition aided by the Hilbert Transform
    Autorzy:
    M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
    Konferencja:
    21st Czech-Polish-Slovak Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics, 2018, Lednice, Czech Republic (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 03-07.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  3. High space-bandwidth product phase imaging using VHQPI numerical add-on
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Krzysztof Patorski, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  4. Modified variational image decomposition algorithm aided by the Hilbert transform as an alternative to 2D Hilbert-Huang transform for fringe pattern phase retrieval
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Jose Angel Picazo-Bueno, Vicente Mico
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  5. Variational Hilbert Phase Imaging for Prostate Cell Analysis
    Autorzy:
    M. Cywinska, M. Trusiak, K. Patorski, P. Zdankowski, J.A. Picazo-Bueno, V. Mico
    Konferencja:
    Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FOM2019
    Data:
    konferencja 14-17 . 04
    Status:
    Opublikowana
  6. Adaptive information retrieval in automated fringe based full-field optical metrology
    Autorzy:
    K. Patorski, M. Trusiak
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  7. Upgrading a brightfield optical microscope into a robust numerically advanced interference-based phase imager
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose-Angel Picazo-Bueno, and Javier Garcia
    Konferencja:
    Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 24-27 . 06
    Status:
    Opublikowana
  8. 3D STED Deep Tissue Imaging Using Adaptive Optics
    Autorzy:
    P. Zdankowski, M. Trusiak, D. Mcgloin, J.R. Swedlow
    Konferencja:
    Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FOM2019
    Data:
    konferencja 14-17 . 04
    Status:
    Opublikowana
  9. Amplitude checker grating-based multichannel lateral shear interferometry for extended aberration sensing
    Autorzy:
    Łukasz Służewski, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 18-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  10. An adaptive optics 3D STED microscope for super-resolution imaging of thick samples with background noise suppression using digital image processing
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Jason R. Swedlow
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  11. Biological phase sample study using variational Hilbert imaging technique
    Autorzy:
    Maria Cywińska; Maciej Trusiak; Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Photonics West BiOS, 2019, San Francisco, California, United States (rok: 2019, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 2-7 . 02
    Status:
    Opublikowana
  12. Moiré effect-based interference microscopy for biospecimen characterization
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 18-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  13. Quasi-noise-free stimulated emission depletion microscopy imaging of thick samples using adaptive optics and block-matching 3D filtering
    Autorzy:
    Piotr Zdankowski, Maciej Trusiak, David McGloin, and Jason R. Swedlow
    Konferencja:
    Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 24-27 . 06
    Status:
    Opublikowana
  14. Total-shear grating based optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  15. Common-path two-shot binary checker grating based interference microscope for quantitative bio-phase imaging
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 19-23 . 05
    Status:
    Opublikowana
  16. Machine-learning based fast unsupervised variational image decomposition for fringe pattern analysis
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications - Interferometry XX (rok: 2020, ), Wydawca: SPIE Proceedings
    Data:
    konferencja 24-28.08.2020
    Status:
    Opublikowana
  17. Multi-beam spatially multiplexed interference microscopy for phase objects examination
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 19-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  18. Practical Improvements Into the Fourier Ptychographic Microscopy Reconstruction Path
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  19. Single-frame fringe pattern analysis using modified variational image decomposition aided by the Hilbert transform for fast full-field quantitative phase imaging
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Vicente Mico, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Photonics Europe, 2018, Strasbourg, France (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 22-26.04.2018
    Status:
    Opublikowana
  20. Single-shot two-frame interference microscopy for robust quantitative phase imaging of fixed and dynamic samples
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Mikołaj Rogalski, Maria Cywinska, Piotr Zdańkowski, Vicente Micó
    Konferencja:
    SPIE Optical Metrology (rok: 2021, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 21-26.06.2021
    Status:
    Opublikowana
  1. Interferometric Methods in NDE
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Książka:
    Handbook of Advanced Non-Destructive Evaluation (rok: 2018, tom: 1, strony: 45313), Wydawca: Springer, Cham
    Status:
    Opublikowana