Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kotranskrypcyjne fałdowanie vRNA wirusa grypy w obecności antysensowych oligonukleotydów w zainfekowanych wirusem komórkach MDCK. Nowa metoda chemicznego mapowania struktury RNA w oparciu o metodę głębokiego sekwencjonowania.

2017/25/B/NZ1/02269

Słowa kluczowe:

RNA wirus grypy terapeutyczne oligonukleotydy mapowanie RNA z użyciem PVP głębokie sekwencjonowanie kotranskrypcyjne fałdowanie RNA struktura drugorzędowa RNA

Deskryptory:

  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Ryszard Kierzek 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 2 068 520 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-01-01

Zakończenie projektu: 2022-01-29

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Aspirator próżniowy. Za kwotę 12 000 PLN
  2. Spektrofotometr UV/VIS z termoprogramatorem i kuwetami kwarcowymi. Za kwotę 142 000 PLN
  3. Aparat Real-Time PCR.
  4. Komora laminarna II klasa bezpieczeństwa. Za kwotę 45 000 PLN
  5. Oprogramowanie do komputera.
  6. Aparat do elektroforezy poliakrylamidowej. Za kwotę 16 000 PLN
  7. Inkubator z dwutlenkiem węgla. Za kwotę 35 000 PLN
  8. Pompa olejowa wysokiej próżni. Za kwotę 10 000 PLN
  9. Wysokiej sprawności komputer, monitor i drukarka laserowa. Za kwotę 12 000 PLN
  10. Zasilacz wysokonapięciowy. Za kwotę 9 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  1. Computational and NMR studies of RNA duplexes with an internal pseudouridine-adenosine base pair
    Autorzy:
    I. Deb, L. Popenda, J. Sarzynska, M. Malgowska, A. Lahiri, Z. Gdaniec, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 16278), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-52637-0 - link do publikacji
  2. RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets for siRNA-Mediated RNA Interference.
    Autorzy:
    J. Piasecka, E. Lenartowicz, M. Soszynska-Jozwiak, B. Szutkowska, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Molecular Therapy-Nucleic Acids (rok: 2020, tom: 19, strony: 627-642), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.omtn.2019.12.018 - link do publikacji
  3. RNA Secondary Structure as a First Step for Rational Design of the Oligonucleotides towards Inhibition of Influenza A Virus Replication.
    Autorzy:
    M. Szabat, D. Lorent, T. Czapik, M. Tomaszewska, E. Kierzek, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Pathogenes (rok: 2020, tom: 9, strony: 925), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pathogens9110925 - link do publikacji
  4. Secondary Structure of Influenza A Virus Genomic Segment 8 RNA Folded in a Cellular Environment
    Autorzy:
    B. Szutkowska, K. Wieczorek, R. Kierzek, P. Zmora, J. M. Peterson, W. N. Moss, D. H. Mathews, E. Kierzek
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2022, tom: 23, strony: 2452), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms23052452 - link do publikacji
  5. Universal and strain specific structure features of segment 8 genomic RNA of influenza A virus - application of 4-thiouridine photocrosslinking
    Autorzy:
    M. Soszynska-Jozwiak, M. Pszczola, J. Piasecka, J.M. Peterson, W.N. Moss, K. Taras-Goslinska, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2021, tom: 297, strony: 101245), Wydawca: ASBMB
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jbc.2021.101245 - link do publikacji
  6. Structural variants and modifications of hammerhead ribozymes targeting influenza A virus conserved structural motifs
    Autorzy:
    T. Czapik, J. Piasecka, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Molecular Therapy - Nucleic Acids (tom: brak, strony: brak), Wydawca: Elsevier Inc
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  7. Secondary structure of the segment 5 genomic RNA of influenza A virus and its application for designing antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    P. Michalak, M. Soszynska-Jozwiak, E. Biala, W.N. Moss, J. Kesy, B. Szutkowska, E. Lenartowicz, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 3801), Wydawca: Nuture Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-40443-7 - link do publikacji
  8. Conserved Structural Motifs of Two Distant IAV Subtypes in Genomic Segment 5 RNA
    Autorzy:
    P. Michalak, J. Piasecka, B. Szutkowska, R. Kierzek, E. Biala, W.N. Moss, E. Kierzek
    Czasopismo:
    VIRUSES-BASEL (rok: 2021, tom: 13, strony: 2000-2016), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/v13030525 - link do publikacji
  9. The regulation properties of RNA secondary structure in alternative splicing
    Autorzy:
    N. Bartys, R. Kierzek, J. Lisowiec-Wachnicka
    Czasopismo:
    Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms (rok: 2019, tom: 1862, strony: 194401), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2019.07.002 - link do publikacji
  10. Thermodynamic and structural contributions of the 6-thioguanosine residue to helical properties of RNA
    Autorzy:
    M. Gladysz, W. Andralojc, T. Czapik, Z. Gdaniec, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4385), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-40715-2 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy