Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wpływ zatłoczonego środowiska na aktywność katalityczną i dynamikę proteaz wirusowych

2016/23/B/NZ1/03198

Słowa kluczowe:

reakcje enzymatyczne proteazy wirusowe makrocząsteczki środowisko komórki izotermiczna kalorymetria miareczkowa spektroskopia fluorescencyjna symulacje dynamiki molekularnej

Deskryptory:

  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Trylska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 12 - ogłoszony 2016-09-15

Przyznana kwota: 938 733 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-08-01

Zakończenie projektu: 2021-07-03

Planowany czas trwania projektu: 47 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw komputer z monitorem i podstawowym oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 8 000 PLN
  2. komputer przenośny (laptop).
  3. Homogenizator laboratoryjny. Za kwotę 3 000 PLN
  4. Miniwytrząsarka. Za kwotę 1 845 PLN
  5. Sonifikator. Za kwotę 31 000 PLN
  6. komputer plus monitor plus licencja.
  7. Miniwirówka. Za kwotę 615 PLN
  8. Oprogramowanie specjalistyczne (GraphPad Prism). Za kwotę 3 500 PLN
  9. transiluminator UV. Za kwotę 5 707 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Peptidomimetic inhibitors targeting the membrane-binding site of the T neutrophil proteinase 3
    Autorzy:
    Ksenia Maximova, Nathalie Reuter, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes (rok: 2019, tom: 1861, strony: 1502-1509), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbamem.2019.06.009 - link do publikacji
  2. Crowding affects structural dynamics and contributes to membrane association of the NS3/4A complex
    Autorzy:
    Natalia Ostrowska, Michael Feig, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biophysical Journal (rok: 2021, tom: 120, strony: 45312), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bpj.2021.07.008 - link do publikacji
  3. Enzyme kinetics in crowded solutions from isothermal titration calorimetry
    Autorzy:
    Ksenia Maximova, Jakub Wojtczak, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Analytical Biochemistry (rok: 2019, tom: 567, strony: 96-105), Wydawca: Elsevier Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ab.2018.11.006 - link do publikacji
  4. Conformational Changes of Anoplin, W-MreB1–9, and (KFF)3K Peptides near the Membranes
    Autorzy:
    Monika Wojciechowska, Joanna Miszkiewicz, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Int. J. Mol. Sci. (rok: 2020, tom: 21, strony: 9672), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21249672 - link do publikacji
  5. Antibacterial Peptide Nucleic Acids—Facts and Perspectives
    Autorzy:
    Monika Wojciechowska, Marcin Równicki, Adam Mieczkowski, Joanna Miszkiewicz, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2020, tom: 25(3), strony: 559), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules25030559 - link do publikacji
  6. Crowded environment affects the activity and inhibition of the NS3/4A protease
    Autorzy:
    Agnieszka Popielec, Natalia Ostrowska, Monika Wojciechowska, Michael Feig, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biochimie (rok: 2020, tom: 176, strony: 169-180), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.biochi.2020.07.009 - link do publikacji
  7. Enzymatic activity of human immunodeficiency virus type 1 protease in crowded solutions
    Autorzy:
    Ksenia Maximova, Jakub Wojtczak, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    European Biophysics Journal (rok: 2019, tom: 48, strony: 685-689), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00249-019-01392-1 - link do publikacji
  8. Modeling Crowded Environment in Molecular Simulations
    Autorzy:
    Natalia Ostrowska, Michael Feig, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Frontiers in Molecular Biosciences (rok: 2019, tom: 6, strony: 86), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmolb.2019.00086 - link do publikacji
  9. Targeting type II toxin-antitoxin systems as antibacterial strategies
    Autorzy:
    Marcin Równicki, Robert Lasek, Joanna Trylska, Dariusz Bartosik
    Czasopismo:
    Toxins (rok: 2020, tom: 12, strony: 568), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/toxins12090568 - link do publikacji
  10. Thermodynamics of the pseudo-knot in helix 18 of 16S ribosomal RNA
    Autorzy:
    Monika Wojciechowska, Marta Dudek, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Biopolymers (rok: 2018, tom: 109, strony: e23116), Wydawca: Wiley Periodicals Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/bip.23116 - link do publikacji
  1. Modeling Nucleic Acids at the Residue–Level Resolution
    Autorzy:
    Filip Leonarski, Joanna Trylska
    Książka:
    Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes (rok: 2019, tom: 8, strony: 117-161), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy