Badania oddziaływań i dynamiki białek o istotnym stopniu nieuporządkowania strukturalnego w fundamentalnych procesach biologicznych metodami biofizyki molekularnej, w tym m. in. spektroskopii pojedynczych cząsteczek
2016/22/E/NZ1/00656
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_3: Biofizyka
- NZ1_2: Biochemia
- NZ1_5: Inżynieria genetyczna
Panel
NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca
Instytut Fizyki PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
dr hab. Anna Zofia Niedźwiecka
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs
SONATA BIS 6 – ogłoszony 2016-06-15
- Przyznana kwota
- 2 271 306 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2017-04-10
- Zakończenie projektu
- 2024-04-09
- Planowany czas trwania projektu
- 84 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (6)
-
The molecular properties of the bHLH TCF4 protein as an intrinsically disordered hub transcription factor
- Autorzy:
- Nikola Sozańska, Barbara P. Klepka, Anna Niedzwiecka, Lilia Zhukova, Michał Dadlez, Beata Greb-Markiewicz, Andrzej Ożyhar, Aneta Tarczewska
- Czasopismo:
- Cell Communication and Signaling (rok: 2025, tom: 1,06527777777778, strony: 46042), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s12964-025-02154-7 – link do publikacji
-
Exploring the CNOT1(800–999) HEAT Domain and Its Interactions with Tristetraprolin (TTP) as Revealed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry
- Autorzy:
- Maja K. Cieplak-Rotowska, Michał Dadlez, Anna Niedźwiecka
- Czasopismo:
- Biomolecules (rok: 2025, tom: 15(3), 403, strony: 46047), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/biom15030403 – link do publikacji
-
Hydrodynamic Radii of Intrinsically Disordered Proteins: Fast Prediction by Minimum Dissipation Approximation and Experimental Validation
- Autorzy:
- Radost Waszkiewicz, Agnieszka Michas, Michał K. Białobrzewski, Barbara P. Klepka, Maja K. Cieplak-Rotowska, Zuzanna Staszałek, Bogdan Cichocki, Maciej Lisicki, Piotr Szymczak, and Anna Niedzwiecka
- Czasopismo:
- The Journal of Physical Chemistry Letters (rok: 2024, tom: 15, strony: 5024-5033), Wydawca: American Chemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acs.jpclett.4c00312 – link do publikacji
-
Diffusion coefficients of elastic macromolecules
- Autorzy:
- Bogdan Cichocki, Marcin Rubin, Anna Niedźwiecka, Piotr Szymczak
- Czasopismo:
- Journal of Fluid Mechanics (rok: 2019, tom: 878, strony: R3), Wydawca: CAMBRIDGE UNIV PRESS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1017/jfm.2019.652 – link do publikacji
-
Diversity of hydrodynamic radii of intrinsically disordered proteins
- Autorzy:
- Michał K. Białobrzewski, Barbara P. Klepka, Agnieszka Michaś, Maja K. Cieplak-Rotowska, Zuzanna Staszałek, Anna Niedźwiecka
- Czasopismo:
- European Biophysics Journal (rok: 2023, tom: 52, strony: 607-618), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00249-023-01683-8 – link do publikacji
-
Structural Dynamics of the GW182 Silencing Domain Including its RNA Recognition motif (RRM) Revealed by Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry
- Autorzy:
- Cieplak-Rotowska Maja K., Tarnowski Krzysztof, Rubin Marcin, Fabian Marc R., Sonenberg Nahum, Dadlez Michał, Niedźwiecka Anna
- Czasopismo:
- Journal of The American Society for Mass Spectrometry (rok: 2018, tom: 29, strony: 158-173), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s13361-017-1830-9 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (13)
-
Coral acid-rich protein-mediated emergence of calcium carbonate spherulitic structures,
- Autorzy:
- B. Klepka, T. Wojciechowski, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- Biomolecules and Nanostructures 8 (rok: 2023, strony: 81), Wydawca: European Physical Society
- Data:
- konferencja 14-18 maja 2023
- Status:
- Opublikowana
-
FCS and confocal studies of early stages of biomineralization steered by intrinsically disordered coral acid-rich proteins
- Autorzy:
- Barbara Klepka, Anna Niedźwiecka
- Konferencja:
- 7th European Workshop on Advanced Fluorescence Methods 2022 (rok: 2022, strony: 10), Wydawca: LMU Munich
- Data:
- konferencja 5 - 9 grudnia 2022
- Status:
- Opublikowana
-
Formation of calcium carbonate spherulites driven by coral polyanionic protein
- Autorzy:
- B. Klepka, T. Wojciechowski, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- Zakopane School of Physics -Breaking Frontiers: Submicron Structures in Physics and Biology (rok: 2023, strony: 81), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
- Data:
- konferencja 23-27 maja 2023
- Status:
- Opublikowana
-
Expression and purification of intrinsically disordered C-terminal fragments of PARN in fusion with mCherry for FCS and SEC studies
- Autorzy:
- Z. Staszałek, M. K. Białobrzewski, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- Biomolecules and Nanostructures 8 (rok: 2023, strony: 111), Wydawca: European Physical Society
- Data:
- konferencja 14-18 czerwca 2023
- Status:
- Opublikowana
-
Fluorescence Correlation Spectroscopy Studies of Properties and Interactions of Intrinsically Disordered Proteins Involved in Regulation of Gene Expression
- Autorzy:
- K. Białobrzewski, A. M. Michaś, M. K. Cieplak-Rotowska, M. Duszka, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- 18th Congress of the Polish Biophysical Society (rok: 2022, strony: 10), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biofizyczne
- Data:
- konferencja 06-09.09.2022
- Status:
- Opublikowana
-
Intrinsically disordered proteins that regulate fundamental biological processes – challenging targets for biophysical studies
- Autorzy:
- A. Niedźwiecka, M. K. Cieplak-Rotowska, M. K. Białobrzewski, B. Klepka
- Konferencja:
- Zakopane School of Physics -Breaking Frontiers: Submicron Structures in Physics and Biology (rok: 2023, strony: 14), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
- Data:
- konferencja 23-27.05.2023
- Status:
- Opublikowana
-
Liquid-liquid phase separation of GW182 Silencing Domain
- Autorzy:
- M. K. Białobrzewski, Z. Staszałek, A. Michaś, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- Biomolecules and Nanostructures 8 (rok: 2023, strony: 65), Wydawca: European Physical Society
- Data:
- konferencja 14-18 June 2023
- Status:
- Opublikowana
-
Studies of interactions and conformational dynamics of intrinsically disordered proteins involved in miRNA-mediated gene silencing
- Autorzy:
- M. K. Białobrzewski, A. M. Michaś, M. K. Cieplak-Rotowska, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- Zakopane School of Physics, Breaking Frontiers: Submicron Structures in Physics and Biology (rok: 2023, strony: 83), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
- Data:
- konferencja 23-27.05.2023
- Status:
- Opublikowana
-
Interplay of protein interactions involved in miRNA-mediated gene silencing, as revealed by HDX MS
- Autorzy:
- M. K. Cieplak-Rotowska, K. Tarnowski, M. Dadlez, M. R. Fabian, N. Sonenberg, A. Niedźwiecka
- Konferencja:
- 19th IUPAB and 11th EBSA Congress (rok: 2017, strony: S344), Wydawca: European Biophysics Journal with Biophysics Letters; Springer w imieniu European Biophysics Societes' Association
- Data:
- konferencja 16-20 lipca 2017
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Identification of the GW182 silencing domain-binding site on CNOT1
- Autorzy:
- Agnieszka Stelmachowska, Maja Cieplak-Rotowska, Anna Niedźwiecka
- Konferencja:
- Biomolecules and Nanostructures 7 (rok: 2019, strony: 106), Wydawca: European Physical Society
- Data:
- konferencja 15-19 maja 2019
- Status:
- Opublikowana
-
Calcium-mediated aggregation of intrinsically disordered polyanionic proteins involved in early stages of coral biomineralization
- Autorzy:
- Barbara Klepka, Anna Niedźwiecka
- Konferencja:
- 18th Congress of the Polish Biophysical Society (PTBF) (rok: 2022, strony: 64), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biofizyczne
- Data:
- konferencja 6 – 9 września 2022
- Status:
- Opublikowana
-
Influence of aromatic substituents at mRNA 5' cap analogues on their interactions with human eIF4E protein
- Autorzy:
- Michał Białobrzewski, Karolina Piecyk, Marzena Jankowska-Anyszka, Janusz Stępiński, Edward Darżynkiewicz, Anna Niedźwiecka
- Konferencja:
- Biomolecules and Nanostructures 7 (rok: 2019, strony: 24), Wydawca: European Physical Society
- Data:
- konferencja 15-19 maja 2019
- Status:
- Opublikowana
-
Formation of coral acid-rich protein aggregates with calcium cations - is there a liquid-liquid phase separation out there?
- Autorzy:
- Barbara Klepka, Agnieszka Michaś, Anna Niedźwiecka
- Konferencja:
- Cellular mechanisms driven by phase separation (rok: 2022, strony: 123), Wydawca: EMBL/EMBO
- Data:
- konferencja 9 – 12 maja 2022
- Status:
- Opublikowana