Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Zastosowanie nowego typu adsorbentów oraz chromatografii cieczowej sprzężonej ze spektrometrią mas w badaniu in vitro metabolizmu oligonukleotydów antysensownych dla potrzeb terapii antysensowej

2016/22/E/ST4/00478

Słowa kluczowe:

oligonukleotydy antysensowe metabolizm chromatografia cieczowa przygotowanie próbki spektrometria mas

Deskryptory:

  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • ST4_6: Chemia analityczna
  • ST4_8: Metody instrumentalne w chemii

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Chemii

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Sylwia Studzińska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 6 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 1 321 149 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-06-02

Zakończenie projektu: 2020-12-01

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. ultra wysokosprawny chromatograf cieczowy. Za kwotę 300 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (21)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Analysis of Antisense Oligonucleotides and Their Metabolites with the Use of Ion Pair ReversedPhase Liquid Chromatography Coupled with Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Critical Review in Analytical Chemistry (rok: 2019, tom: 49, strony: 256-270), Wydawca: Taylor and Francis
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/10408347.2018.1517034 - link do publikacji
  2. Application of ion pair chromatography coupled with mass spectrometry to assess antisense oligonucleotide concentrations in living cells
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Krzysztof Sobczak, Piotr Cywoniuk
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2019, tom: 144, strony: 622-633), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8an01603h - link do publikacji
  3. Poly(ionic liquid)s as new adsorbents in dispersive micro-solid phase extraction of unmodified and modified oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Ewa Zalesińska, Krzysztof Dzieszkowski, Zbigniew Rafiński, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Talanta (rok: 2021, tom: 221, strony: 121662), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.talanta.2020.121662 - link do publikacji
  4. Studying in vitro metabolism of the first and second generation of antisense oligonucleotides with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska,
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2020, tom: 412, strony: 7453–7467), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00216-020-02878-0 - link do publikacji
  5. Analysis of microRNA and modified oligonucleotides with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography A (rok: 2018, tom: 1554, strony: 71-80), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.chroma.2018.04.037 - link do publikacji
  6. Analysis of the first and second generation of antisense oligonucleotides in serum samples with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Talanta (rok: 2019, tom: 196, strony: 54-63), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.talanta.2018.12.023 - link do publikacji
  7. Hydrophilic interaction in solid phase extraction of antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kilanowska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatographic Science (rok: 2020, tom: 58, strony: 383–387), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/chromsci/bmz114 - link do publikacji
  8. In vivo and in vitro studies of antisense oligonucleotides - a review
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 34501-34516), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0ra04978f - link do publikacji
  9. Synthesis and application of stationary phase for DNA affinity chromatographic analysis of unmodified and antisense oligonucleotide
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Ewelina Zawadzka, Szymon Bocian, Michał Szumski
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2021, tom: 413, strony: 5109–5119), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00216-021-03473-7 - link do publikacji
  10. Analiza oligonukleotydów antysensownych pierwszej i drugiej generacji za pomocą chromatografii par jonowych
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Analityka (rok: 2019, tom: 2, strony: 45393), Wydawca: Malamut
    Status:
    Opublikowana
  11. Analysis of antisense oligonucleotides with the use of ionic liquids as the mobile phase modifiers
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Judyta Zielak, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2019, tom: 9, strony: 39100-39110), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c9ra06483d - link do publikacji
  12. Application of Magnetic Nanoparticles Coated with Crosslinked Zwitterionic Poly(ionic liquid)s for the Extraction of Oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Krzysztof Dzieszkowski, Zbigniew Rafiński, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Materials (rok: 2021, tom: 14 (12), strony: 3146), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ma14123146 - link do publikacji
  13. Klasyczne i nowe metody przygotowania próbek oligonukleotydów antysensownych przed analizą chromatograficzną
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Analityka (rok: 2020, tom: 1, strony: 45393), Wydawca: Malamut
    Status:
    Opublikowana
  14. Zastosowanie cieczy jonowych jako modyfikatorów fazy ruchomej w chromatografii cieczowej
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Judyta Zielak, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Wiadomości Chemiczne (rok: 2020, tom: 74 (7-8), strony: 507-525), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Status:
    Opublikowana
  15. Adsorbenty ze związanymi cieczami jonowymi i ich wykorzystanie w przygotowaniu próbek oligonukleotydów
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Ewa Zalesińska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Wiadomości Chemiczne (rok: 2020, tom: 74 (7-8), strony: 545-565), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Status:
    Opublikowana
  16. Application of hydrophilic interaction liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry for the retention and sensitivity studies of antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Bogusław Buszewski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography A (rok: 2020, tom: 1622, strony: 461100), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.chroma.2020.461100 - link do publikacji
  17. Attachment of hybridizable oligonucleotide to silica support and its application for selective extraction of unmodified and antisense oligonucleotides from serum samples
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Magdalena Skoczylas, Szymon Bocian, Anna Dembska, Bogusław Buszewski,
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 16221-16230), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0ra01620a - link do publikacji
  18. Ultra high performance reversed phase liquid chromatography hyphenated with ESI-Q-TOF-MS for the analysis of unmodified and antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Łukasz Nuckowski, Anna Kilanowska
    Czasopismo:
    Chromatographia (rok: 2020, tom: 83, strony: 349–360), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10337-019-03844-4 - link do publikacji
  19. A new approach to preparation of antisense oligonucleotide samples with microextraction by packed sorbent
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2019, tom: 144, strony: 4622-4632), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c9an00740g - link do publikacji
  20. Development of SPE method for the extraction of phosphorothioate oligonucleotides from serum samples
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Bioanalysis (rok: 2018, tom: 10 (20), strony: 1757-6180), Wydawca: Future Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4155/bio-2018-0166 - link do publikacji
  21. Review on sample preparation methods for oligonucleotides analysis by liquid chromatography
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography B (rok: 2018, tom: 1090, strony: 90-100), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jchromb.2018.05.025 - link do publikacji
  1. Analityka oligonukleotydów antysensownych
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Anna Kilanowska, Łukasz Nuckowski, Bogusław Buszewski
    Książka:
    Bioanalityka w nauce i życiu (rok: 2020, tom: 1, strony: 57-71), Wydawca: PWN
    Status:
    Opublikowana