Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Struktura RNA i jego oddziaływania z białkiem Gag warunkujące funkcje RNA Ty1 na różnych etapach replikacji retrotranspozonu

2016/22/E/NZ3/00426

Słowa kluczowe:

drugo- i trzeciorzędowa struktura RNA funkcja RNA retrotranspozon Ty1 Ty1 Gag

Deskryptory:

  • NZ3_1: Biologia komórki

Panel:

NZ3 - Biologia na poziomie komórki: biologia komórkowa, biologia rozwoju i starzenia, neurobiologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Katarzyna Pachulska-Wieczorek 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA BIS 6 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 1 152 060 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-05-08

Zakończenie projektu: 2022-12-07

Planowany czas trwania projektu: 67 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. System do elektrotransferu. Za kwotę 16 000 PLN
  2. Zestaw komputerowy wraz z oprogramowaniem (Office, Corel, EndNote, PyMol). Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (6)
  1. In vivo structure of the Ty1 retrotransposon RNA genome
    Autorzy:
    Andrzejewska A., Zawadzka M., Gumna J., Garfinkel D.J., Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 49(5), strony: 2878-2893), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkab090 - link do publikacji
  2. RNAthor - fast, accurate normalization, visualization and statistical analysis of RNA probing data resolved by capillary electrophoresis
    Autorzy:
    Gumna J., Zok T., Figurski K., Pachulska-Wieczorek K., Szachniuk M.
    Czasopismo:
    Plos One (rok: 2020, tom: 15 (10), strony: 01.gru), Wydawca: Plos
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0239287 - link do publikacji
  3. Na dobre i na złe: rola endogennych retroelementów u człowieka
    Autorzy:
    Zawadzka M., Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    Postępy Biochemii (rok: 2019, tom: 65(3), strony: 217-223), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/pb.2019_272 - link do publikacji
  4. On the Way to Understanding the Interplay between the RNA Structure and Functions in Cells: A Genome-Wide Perspective
    Autorzy:
    Andrzejewska A., Zawadzka M., Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21(18), strony: 15), Wydawca: MPDI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21186770 - link do publikacji
  5. Cell Compartment-Specific Folding of Ty1 Long Terminal Repeat Retrotransposon RNA Genome
    Autorzy:
    Zawadzka M, Andrzejewska-Romanowska A, Gumna J, Garfinkel DJ, Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    Viruses (rok: 2022, tom: 14(9), strony: 45306), Wydawca: MPDI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/v14092007 - link do publikacji
  6. Retroviral-like determinants and functions required for dimerization of Ty1 retrotransposon RNA
    Autorzy:
    Gumna J., Purzycka K. J., Ahn H.W., Garfinkel D.J., Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2019, tom: 16(12), strony: 1749-1763), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/15476286.2019.1657370 - link do publikacji
  7. Evolutionary plasticity of the NHL domain underlies distinct solutions to RNA recognition
    Autorzy:
    Kumari, P., Aeschimann, F., Gaidatzis, D., Keusch, J.J., Ghosh, P., Neagu, A., Pachulska-Wieczorek, K., Bujnicki, J.M., Gut, H., Grosshans, Ciosk, R.
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2018, tom: 9, strony: 45306), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-018-03920-7 - link do publikacji
  8. RNA Binding Properties of the Ty1 LTR-Retrotransposon Gag Protein
    Autorzy:
    Gumna J, Andrzejewska-Romanowska A, Garfinkel DJ, Pachulska-Wieczorek K.
    Czasopismo:
    Int J Mol Sci (rok: 2021, tom: 22(16), strony: 9103), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22169103 - link do publikacji
  1. Structural determinants of genomic RNA dimerization and packaging in the LTR-retrotransposon Ty1
    Autorzy:
    Julita Gumna, Katarzyna J. Purzycka, Małgorzata Zawadzka, David Garfinkel, Katarzyna Pachulska-Wieczorek
    Konferencja:
    BIO 2018 Congress (rok: 2018, ), Wydawca: Polish Biochemical Society & Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 18-21.09.2018
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  2. Determinants of genomic RNA dimerization and packaging in the Saccharomyces cerevisiae LTR-retrotransposon Ty1
    Autorzy:
    Julita Gumna, Katarzyna J. Purzycka, David J. Garfinkel, Katarzyna Pachulska-Wieczorek
    Konferencja:
    RNAtion (rok: 2017, ), Wydawca: UAM w Poznaniu
    Data:
    konferencja 18-19.09.2017
    Status:
    Opublikowana
  3. From retrotransposon genome structure to function: Probing the structure of Ty1 genomic RNA in distinct biological states using SHAPE
    Autorzy:
    Andrzejewska A., Zawadzka M., Gumna J., Garfinkel D.J., Pachulska-Wieczorek K.
    Konferencja:
    RNA 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: RNA Society
    Data:
    konferencja 43627
    Status:
    Opublikowana
  4. Regulation of LTR-retrotransposons life cycle
    Autorzy:
    Julita Gumna, Katarzyna J. Purzycka, Agniva Saha, Małgorzata Zawadzka, David Garfinkel, Katarzyna Pachulska-Wieczorek
    Konferencja:
    BIO 2018 Congress (rok: 2018, ), Wydawca: Polish Biochemical Society & Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 18-21.09.2018
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji
  5. Retrovirus-like transposons genome packaging: Gag function and structural determinants of Ty1 RNA dimerization
    Autorzy:
    Gumna J., Purzycka K. J., Ahn H.W., Garfinkel D.J., Pachulska-Wieczorek K.
    Konferencja:
    RNA 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: RNA Society
    Data:
    konferencja 43627
    Status:
    Opublikowana
  6. Structural determinants of Ty1 genomic RNA dimerization: the role of Gag and p22 restriction factor
    Autorzy:
    Julita Gumna, Katarzyna J. Purzycka, Agniva Saha, David Garfinkel, Katarzyna Pachulska-Wieczorek
    Konferencja:
    6th Central European Congress of Life Science Eurobiotech (rok: 2017, ), Wydawca: Targi w Krakowie Ltd.
    Data:
    konferencja 11-14.09.2017
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy