Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Określenie wpływu modyfikacji 5' końca RNA oraz sekwencji nukleotydowej i aminokwasowej na energię oddziaływań elektrostatycznych białek IFIT z RNA

2016/21/N/ST4/03722

Słowa kluczowe:

energia oddziaływań elektrostatycznych gęstość elektronowa białka IFIT RNA

Deskryptory:

  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST4_4: Struktura i architektura molekularna
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Urszula Budniak 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 11 - ogłoszony 2016-03-15

Przyznana kwota: 143 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-02-17

Zakończenie projektu: 2022-02-16

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw komputerowy. Za kwotę 13 000 PLN
  2. laptop.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
  1. The Role of Electrostatic Interactions in IFIT5-RNA Complexes Predicted by the UBDB+EPMM Method
    Autorzy:
    Urszula Anna Budniak, Natalia Katarzyna Karolak, Marta Kulik, Krzysztof Młynarczyk, Maria Wiktoria Górna* and Paulina Maria Dominiak*
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2022, tom: 126, strony: 9152-9167), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.2c04519 - link do publikacji
  2. Electrostatic interactions of IFIT1 proteins with RNA having various 5'ends
    Autorzy:
    Urszula Anna Budniak, Paulina Maria Dominiak*
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2023, ), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Złożona
  1. UBDB databank as a tool for investigating electrostatic interactions between proteins and RNA
    Autorzy:
    Urszula A. Budniak, Paulina M. Dominiak
    Konferencja:
    Prof. Krzysztof W. Szewczyk's VII Intercollegiate Biotechnology Symposium SYMBIOZA (rok: 2018, ), Wydawca: Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii
    Data:
    konferencja 11-13.05.2018
    Status:
    Opublikowana
  2. UBDB+EPMM approach as a tool for investigating electrostatic interactions between proteins and RNA
    Autorzy:
    U. Budniak , P. Dominiak
    Konferencja:
    33rd European Crystallographic Meeting, 23-27.08.2022, Versailles, Francja (rok: 2022, ), Wydawca: IUCr Journals
    Data:
    konferencja 23-27.08.2022
    Status:
    Opublikowana
  3. Analysis of electrostatic interaction energies in complexes of IFIT5 proteins with RNA via UBDB+EPMM method
    Autorzy:
    U. A. Budniak and P. M. Dominiak
    Konferencja:
    School on Electron Crystallography (rok: 2021, ), Wydawca: IUCr Journals
    Data:
    konferencja 11-13.08.2021
    Status:
    Opublikowana
  4. The influence of nucleotide sequence of RNA 5′ end on the electrostatic interaction energy of IFIT5 proteins with RNA
    Autorzy:
    U. Budniak and P. Dominiak
    Konferencja:
    31st European Crystallographic Meeting, 22-27.08.2018, Oviedo, Hiszpania (rok: 2018, ), Wydawca: IUCr Jurnals
    Data:
    konferencja 43334
    Status:
    Opublikowana
  5. The role of electrostatic interactions in IFIT proteins complexed with RNA with different 5′ end predicted by the UBDB+EPMM method
    Autorzy:
    U. Budniak and P. Dominiak
    Konferencja:
    32nd European Crystallographic Meeting, 18-23.08.2019, Wiedeń, Austria (rok: 2019, ), Wydawca: IUCr Jurnals
    Data:
    konferencja 18-23.09.2019
    Status:
    Opublikowana