Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Chemicznie modyfikowane mRNA do badań procesów komórkowych i zastosowań terapeutycznych

2016/21/B/ST5/02556

Słowa kluczowe:

synteza nukleotydów,analogi nukleotydów informacyjny RNA terapia przeciwnowotworowa degradacja mRNA

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_11: Synteza biomateriałów
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jacek Jemielity 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: OPUS 11 - ogłoszony 2016-03-15

Przyznana kwota: 1 651 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-02-23

Zakończenie projektu: 2020-10-22

Planowany czas trwania projektu: 44 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Termoforeza mikroskalowa. Za kwotę 500 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Exploring the potential of phosphotriazole 5' mRNA cap analogues as efficient translation initiators
    Autorzy:
    Sylwia Walczak, Paweł J. Sikorski, Renata Kasprzyk, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2018, tom: 16, strony: 6741-6748), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8ob01720d - link do publikacji
  2. Azido-Functionalized 5′ Cap Analogues for the Preparation of Translationally Active mRNAs Suitable for Fluorescent Labeling in Living Cells
    Autorzy:
    Adam Mamot, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Angewandte Chemie International Edition (rok: 2017, tom: 56, strony: 15628 –15632), Wydawca: Wiley-VCH Verlag GmbH &Co. KGaA, Weinheim
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/anie.201709052 - link do publikacji
  3. Phosphodiester modifications in mRNA polyA tail prevent deadenylation without compromising protein expression
    Autorzy:
    Dominika Strzelecka, Miroslaw Smietanski, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    RNA (rok: 2020, tom: 26 (12), strony: 1815-1837), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press for the RNA Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1261/rna.077099.120 - link do publikacji
  4. Structural Insights into the Interaction of Clinically Relevant Phosphorothioate mRNA Cap Analogs with Translation Initiation Factor 4E Reveal Stabilization via Electrostatic Thio-Effect
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Elzbieta Nowak, Dorota Kubacka, Ryan Tibble, Renata Kasprzyk, Pawel J. Sikorski, John D. Gross, Marcin Nowotny, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    ACS Chemical Biology (rok: 2021, tom: 16, strony: ‏ 334-343), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acschembio.0c00864 - link do publikacji
  5. Synthesis of RNA 5′-Azides from 2′-O-Pivaloyloxymethyl-Protected RNAs and Their Reactivity in Azide–Alkyne Cycloaddition Reactions
    Autorzy:
    Marcin Warmiński, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Organic Letters (rok: 2017, tom: 19, strony: 3624-3627), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.orglett.7b01591 - link do publikacji
  6. 5′-fluoro(di)phosphate-labeled oligonucleotides are versatile molecular probes for studying nucleic acid secondary structure and interactions by 19F NMR
    Autorzy:
    Marek R Baranowski, Marcin Warminski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48 (15), strony: 8209-8224), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa470 - link do publikacji
  7. The identity and methylation status of the first transcribed nucleotide in eukaryotic mRNA 5′ cap modulates protein expression in living cells
    Autorzy:
    Paweł J. Sikorski, Marcin Warmiński, Dorota Kubacka, Tomasz Ratajczak, Dominika Nowis, Jonanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 1607-1626), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa032 - link do publikacji
  8. mRNA cap analogues substituted in the tetraphosphate chain with CX2: identification of O-to-CCl2 as the first bridging modification that confers resistance to decapping without impairing translation
    Autorzy:
    Anna M. Rydzik Marcin Warminski Pawel J. Sikorski Marek R. Baranowski Sylwia Walczak Joanna Kowalska Joanna Zuberek Maciej Lukaszewicz Elzbieta Nowak Timothy D. W. Claridge Edward Darzynkiewicz Marcin Nowotny Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 8661-8675), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkx569 - link do publikacji
  9. mRNAs biotinylated within the 5′ cap and protected against decapping: new tools to capture RNA–protein complexes
    Autorzy:
    Sylwia Bednarek , Vanesa Madan , Pawel J. Sikorski , Ralf Bartenschlager , Joanna Kowalska , and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Philosophical Transactions of The Royal Society B (rok: 2018, tom: 373, strony: 20180167), Wydawca: The Royal Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1098/rstb.2018.0167 - link do publikacji
  1. Site specific, sequence independent fluorescent labeling of mRNA in living cells
    Autorzy:
    Jacek Jemielity, Adam Mamot, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska
    Konferencja:
    XXIII International Roundtable On Nucleosides, Nucleotides And Nucleic Acids (rok: 2018, ), Wydawca: University of California
    Data:
    konferencja 26-30.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  2. Kolorymetryczna sonda molekularna do monitorowania aktywności eIF4E - białka wiążącego strukturę końca 5' mRNA
    Autorzy:
    Perzanowska O., Majewski M., Kowalska J., Jemielity J.
    Konferencja:
    62 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 2-6.09.2019
    Status:
    Opublikowana
  1. Solid-Phase Synthesis of RNA 5 -Azides and Their Application for Labeling, Ligation, and Cyclization Via Click Chemistry
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Książka:
    Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry (rok: 2020, tom: 82, strony: brak), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
    Status:
    Opublikowana