Chemicznie modyfikowane mRNA do badań procesów komórkowych i zastosowań terapeutycznych
2016/21/B/ST5/02556
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST5_16: Chemia biologiczna
- ST5_11: Synteza biomateriałów
- NZ1_2: Biochemia
Panel
ST5 – Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 8
Konkurs
OPUS 11 – ogłoszony 2016-03-15
- Przyznana kwota
- 1 651 800 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2017-02-23
- Zakończenie projektu
- 2020-10-22
- Planowany czas trwania projektu
- 44 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Termoforeza mikroskalowa. Za kwotę 500 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (9)
-
Exploring the potential of phosphotriazole 5' mRNA cap analogues as efficient translation initiators
- Autorzy:
- Sylwia Walczak, Paweł J. Sikorski, Renata Kasprzyk, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2018, tom: 16, strony: 6741-6748), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/c8ob01720d – link do publikacji
-
mRNAs biotinylated within the 5′ cap and protected against decapping: new tools to capture RNA–protein complexes
- Autorzy:
- Sylwia Bednarek , Vanesa Madan , Pawel J. Sikorski , Ralf Bartenschlager , Joanna Kowalska , and Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Philosophical Transactions of The Royal Society B (rok: 2018, tom: 373, strony: 20180167), Wydawca: The Royal Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1098/rstb.2018.0167 – link do publikacji
-
mRNA cap analogues substituted in the tetraphosphate chain with CX2: identification of O-to-CCl2 as the first bridging modification that confers resistance to decapping without impairing translation
- Autorzy:
- Anna M. Rydzik Marcin Warminski Pawel J. Sikorski Marek R. Baranowski Sylwia Walczak Joanna Kowalska Joanna Zuberek Maciej Lukaszewicz Elzbieta Nowak Timothy D. W. Claridge Edward Darzynkiewicz Marcin Nowotny Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 8661-8675), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkx569 – link do publikacji
-
Synthesis of RNA 5′-Azides from 2′-O-Pivaloyloxymethyl-Protected RNAs and Their Reactivity in Azide–Alkyne Cycloaddition Reactions
- Autorzy:
- Marcin Warmiński, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Organic Letters (rok: 2017, tom: 19, strony: 3624-3627), Wydawca: American Chemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acs.orglett.7b01591 – link do publikacji
-
Azido-Functionalized 5′ Cap Analogues for the Preparation of Translationally Active mRNAs Suitable for Fluorescent Labeling in Living Cells
- Autorzy:
- Adam Mamot, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Angewandte Chemie International Edition (rok: 2017, tom: 56, strony: 15628 –15632), Wydawca: Wiley-VCH Verlag GmbH &Co. KGaA, Weinheim
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/anie.201709052 – link do publikacji
-
The identity and methylation status of the first transcribed nucleotide in eukaryotic mRNA 5′ cap modulates protein expression in living cells
- Autorzy:
- Paweł J. Sikorski, Marcin Warmiński, Dorota Kubacka, Tomasz Ratajczak, Dominika Nowis, Jonanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 1607-1626), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkaa032 – link do publikacji
-
Structural Insights into the Interaction of Clinically Relevant Phosphorothioate mRNA Cap Analogs with Translation Initiation Factor 4E Reveal Stabilization via Electrostatic Thio-Effect
- Autorzy:
- Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Elzbieta Nowak, Dorota Kubacka, Ryan Tibble, Renata Kasprzyk, Pawel J. Sikorski, John D. Gross, Marcin Nowotny, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- ACS Chemical Biology (rok: 2021, tom: 16, strony: 334-343), Wydawca: ACS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acschembio.0c00864 – link do publikacji
-
Phosphodiester modifications in mRNA polyA tail prevent deadenylation without compromising protein expression
- Autorzy:
- Dominika Strzelecka, Miroslaw Smietanski, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Czasopismo:
- RNA (rok: 2020, tom: 26 (12), strony: 1815-1837), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press for the RNA Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1261/rna.077099.120 – link do publikacji
-
5′-fluoro(di)phosphate-labeled oligonucleotides are versatile molecular probes for studying nucleic acid secondary structure and interactions by 19F NMR
- Autorzy:
- Marek R Baranowski, Marcin Warminski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48 (15), strony: 8209-8224), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkaa470 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
-
Kolorymetryczna sonda molekularna do monitorowania aktywności eIF4E - białka wiążącego strukturę końca 5' mRNA
- Autorzy:
- Perzanowska O., Majewski M., Kowalska J., Jemielity J.
- Konferencja:
- 62 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2019, strony: S15-13), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
- Data:
- konferencja 2-6.09.2019
- Status:
- Opublikowana
-
Site specific, sequence independent fluorescent labeling of mRNA in living cells
- Autorzy:
- Jacek Jemielity, Adam Mamot, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Joanna Kowalska
- Konferencja:
- XXIII International Roundtable On Nucleosides, Nucleotides And Nucleic Acids (rok: 2018, strony: P166), Wydawca: University of California
- Data:
- konferencja 26-30.08.2018
- Status:
- Opublikowana
Publikacje książkowe (1)
-
Solid-Phase Synthesis of RNA 5 -Azides and Their Application for Labeling, Ligation, and Cyclization Via Click Chemistry
- Autorzy:
- Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
- Książka:
- Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry (rok: 2020, tom: 82, strony: brak), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
- Status:
- Opublikowana