Opracowanie bazy danych do identyfikacji bakterii z rodzaju Streptococcus i Enterococcus z użyciem nowatorskiej techniki opartej o sekwencjonowanie nowej generacji regionu 16S-23S rRNA.
2016/21/N/NZ6/00981
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ6_4: Bakteriologia
- NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel
NZ6 – Immunologia i choroby zakaźne ludzi i zwierząt: odporność, choroby immunologiczne, immunoterapia, choroby zakaźne i inwazyjne
Jednostka realizująca
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 11 – ogłoszony 2016-03-15
- Przyznana kwota
- 99 960 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2017-04-07
- Zakończenie projektu
- 2019-10-06
- Planowany czas trwania projektu
- 30 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (4)
-
New Insight into Genotypic and Phenotypic Relatedness of Staphylococcus aureus Strains from Human Infections or Animal Reservoirs
- Autorzy:
- Klaudia Lisowska-Łysiak*, Maja Kosecka-Strojek*, Joanna Białecka, Andrzej Kasprowicz, Katarzyna Garbacz, Lidia Piechowicz, Vladimir Kmet, Vincenzo Savini, Jacek Międzobrodzki * equal contribution
- Czasopismo:
- Polish Journal of Microbiology (rok: 2019, tom: Vol. 68, No 1, strony: 93-104), Wydawca: Polish Society of Microbiologists
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.21307/pjm-2019-011 – link do publikacji
-
Development and Validation of a Reference Data Set for Assigning Staphylococcus Species Based on Next-Generation Sequencing of the 16S-23S rRNA Region
- Autorzy:
- Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid and Alexander W. Friedrich
- Czasopismo:
- Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (rok: 2019, tom: 9, strony: Article 278), Wydawca: Frontiers Media S.A.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fcimb.2019.00278 – link do publikacji
-
Emergence of linezolid-resistant Staphylococcus epidermidis in the tertiary children's hospital in Cracow, Poland
- Autorzy:
- Maja Kosecka-Strojek, Ewa Sadowy, Iwona Gawryszewska, Joanna Klepacka, Tomasz Tomasik, Michal Michalik, Waleria Hryniewicz, Jacek Miedzobrodzki
- Czasopismo:
- European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2020, tom: Online ahead, strony: Online ahead of print), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s10096-020-03893-w – link do publikacji
-
Development of a reference data set for assigning Streptococcus and Enterococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA region
- Autorzy:
- Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid, Jacek Miedzobrodzki, Alexander W. Friedrich
- Czasopismo:
- Antimicrobial Resistance & Infection Control (rok: 2019, tom: 8, strony: Article 178), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s13756-019-0622-3 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (4)
-
Development and validation of a reference data set for assigning Staphylococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA region
- Autorzy:
- Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Mirjam Kooistra-Smid, Alexander W. Friedrich
- Konferencja:
- 8th Congress of European Microbiologists - FEMS2019 (rok: 2019, strony: 377), Wydawca: FEMS
- Data:
- konferencja 07.07-11.07
- Status:
- Opublikowana
-
Identyfikacja istotnych klinicznie bakterii z rodzajów Streptococcus i Enterococcus z użyciem sekwencjonowania genów 16S rRNA, sodA, rpoB oraz tuf
- Autorzy:
- Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-Strojek
- Konferencja:
- V Ogólnopolska Konferencja Doktorantów Nauk o Życiu – BioOpen (rok: 2019, strony: 32), Wydawca: Uniwersytet Łódzki
- Data:
- konferencja 30.05-31.05
- Status:
- Opublikowana
-
Comparison of phenotypic and genetic methods in species Identification of clinically relevant bacteria from Streptococcus and Enterococcus genera
- Autorzy:
- Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-Strojek
- Konferencja:
- XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, strony: 116), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie
- Data:
- konferencja 08-12.02
- Status:
- Opublikowana
-
The identification of Enterococcus spp. at the species level using rpoB and tuf genes sequencing
- Autorzy:
- Alicja Dziadowiec, Mariola Wolska, Maja Kosecka-Strojek
- Konferencja:
- XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, strony: 57), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie
- Data:
- konferencja 08-12.02
- Status:
- Opublikowana
Publikacje książkowe (1)
-
Staphylococcal Ecology and Epidemiology
- Autorzy:
- Maja Kosecka-Strojek, Aneta Buda, Jacek Miedzobrodzki
- Książka:
- Pet-to-Man Travelling Staphylococci A World in Progress (rok: 2018, tom: n/a, strony: 46350), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana