Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Opracowanie bazy danych do identyfikacji bakterii z rodzaju Streptococcus i Enterococcus z użyciem nowatorskiej techniki opartej o sekwencjonowanie nowej generacji regionu 16S-23S rRNA.

2016/21/N/NZ6/00981

Słowa kluczowe:

Streptococcus Entercoccus sekwencjonowanie nowej generacji region 16S-23S rRNA

Deskryptory:

  • NZ6_4: Bakteriologia
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ6 - Immunologia i choroby zakaźne ludzi i zwierząt: odporność, choroby immunologiczne, immunoterapia, choroby zakaźne i inwazyjne

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Maja Kosecka-Strojek 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 11 - ogłoszony 2016-03-15

Przyznana kwota: 99 960 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-04-07

Zakończenie projektu: 2019-10-06

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Development and Validation of a Reference Data Set for Assigning Staphylococcus Species Based on Next-Generation Sequencing of the 16S-23S rRNA Region IF: 3,518
    Autorzy:
    Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid and Alexander W. Friedrich
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (rok: 2019, tom: 9, strony: Article 278), Wydawca: Frontiers Media S.A.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fcimb.2019.00278 - link do publikacji
  2. New Insight into Genotypic and Phenotypic Relatedness of Staphylococcus aureus Strains from Human Infections or Animal Reservoirs IF: 0,951
    Autorzy:
    Klaudia Lisowska-Łysiak*, Maja Kosecka-Strojek*, Joanna Białecka, Andrzej Kasprowicz, Katarzyna Garbacz, Lidia Piechowicz, Vladimir Kmet, Vincenzo Savini, Jacek Międzobrodzki * equal contribution
    Czasopismo:
    Polish Journal of Microbiology (rok: 2019, tom: Vol. 68, No 1, strony: 93-104), Wydawca: Polish Society of Microbiologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.21307/pjm-2019-011 - link do publikacji
  3. Development of a reference data set for assigning Streptococcus and Enterococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA region IF: 3,68
    Autorzy:
    Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid, Jacek Miedzobrodzki, Alexander W. Friedrich
    Czasopismo:
    Antimicrobial Resistance & Infection Control (rok: 2019, tom: 8, strony: Article 178), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13756-019-0622-3 - link do publikacji
  4. Emergence of linezolid-resistant Staphylococcus epidermidis in the tertiary children's hospital in Cracow, Poland IF: 2,914
    Autorzy:
    Maja Kosecka-Strojek, Ewa Sadowy, Iwona Gawryszewska, Joanna Klepacka, Tomasz Tomasik, Michal Michalik, Waleria Hryniewicz, Jacek Miedzobrodzki
    Czasopismo:
    European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2020, tom: Online ahead, strony: Online ahead of print), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10096-020-03893-w - link do publikacji
  1. The identification of Enterococcus spp. at the species level using rpoB and tuf genes sequencing
    Autorzy:
    Alicja Dziadowiec, Mariola Wolska, Maja Kosecka-Strojek
    Konferencja:
    XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, ), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie
    Data:
    konferencja 08-12.02
    Status:
    Opublikowana
  2. Development and validation of a reference data set for assigning Staphylococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA region
    Autorzy:
    Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Mirjam Kooistra-Smid, Alexander W. Friedrich
    Konferencja:
    8th Congress of European Microbiologists - FEMS2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FEMS
    Data:
    konferencja 07.07-11.07
    Status:
    Opublikowana
  3. Identyfikacja istotnych klinicznie bakterii z rodzajów Streptococcus i Enterococcus z użyciem sekwencjonowania genów 16S rRNA, sodA, rpoB oraz tuf
    Autorzy:
    Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-Strojek
    Konferencja:
    V Ogólnopolska Konferencja Doktorantów Nauk o Życiu – BioOpen (rok: 2019, ), Wydawca: Uniwersytet Łódzki
    Data:
    konferencja 30.05-31.05
    Status:
    Opublikowana
  4. Comparison of phenotypic and genetic methods in species Identification of clinically relevant bacteria from Streptococcus and Enterococcus genera
    Autorzy:
    Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-Strojek
    Konferencja:
    XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, ), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie
    Data:
    konferencja 08-12.02
    Status:
    Opublikowana
  5. Application and comparison of Sanger sequencing and Vitek 2 systems for identification of clinically relevant species from Streptococcus and Enterococcus genera
    Autorzy:
    Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Vincenzo Savini, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-Strojek
    Konferencja:
    FEMS ONLINE CONFERENCE ON MICROBIOLOGY 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: Federation of European Microbiological Societies
    Data:
    konferencja 28 – 31.10
    Status:
    Złożona
  1. Staphylococcal Ecology and Epidemiology
    Autorzy:
    Maja Kosecka-Strojek, Aneta Buda, Jacek Miedzobrodzki
    Książka:
    Pet-to-Man Travelling Staphylococci A World in Progress (rok: 2018, tom: n/a, strony: 44889), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana