Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Białka wielodomenowe i częściowo nieustrukturyzowane w procesach rozkładu celulozy i adhezji komórek

2016/21/B/NZ1/00006

Słowa kluczowe:

białka wielodomenowe białka pozbawione struktury trzeciorzędowej białka adhezyjne enzymy celuloza symulacje dynamiki molekularnej modele gruboziarniste

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • ST4_7: Fizyka chemiczna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Bartosz Różycki 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: OPUS 11 - ogłoszony 2016-03-15

Przyznana kwota: 278 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-01-01

Zakończenie projektu: 2020-10-11

Planowany czas trwania projektu: 45 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Serwer komputerowy. Za kwotę 60 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (15)
  • Publikacje książkowe (3)
  1. Capturing the Conformational Ensemble of the Mixed Folded Polyglutamine Protein Ataxin-3
    Autorzy:
    Alessandro Sicorello, Bartosz Różycki, Petr V. Konarev, Dmitri I. Svergun, Annalisa Pastore
    Czasopismo:
    Structure (rok: 2021, tom: 29, strony: 45303), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.str.2020.09.010 - link do publikacji
  2. Influence of lipid rafts on pattern formation during T-cell adhesion
    Autorzy:
    Long Li, Jinglei Hu, Bartosz, Różycki, Xiaohuan Wang, Helong Wu, Fan Song
    Czasopismo:
    New Journal of Physics (rok: 2021, tom: 23, strony: 43052), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/1367-2630/abeacb - link do publikacji
  3. Phosphatidylinositol 4-kinase IIIbeta (PI4KB) forms highly flexible heterocomplexes that include ACBD3, 14-3-3, and Rab11 proteins
    Autorzy:
    Dominika Chalupska, Bartosz Różycki, Jana Humpolickova, Lenka Faltova, Martin Klima, Evzen Boura
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 567), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-37158-6 - link do publikacji
  4. Structural analysis of phosphatidylinositol 4-kinase III beta (PI4KB)-14-3-3 protein complex reveals internal flexibility and explains 14-3-3 mediated protection from degradation in vitro
    Autorzy:
    Dominika Chalupska, Andrea Eisenreichova, Bartosz Różycki, Lenka Rezabkova, Jana Humpolickova, Martin Klima, Evzen Boura
    Czasopismo:
    Journal of Structural Biology (rok: 2017, tom: 200, strony: 36-44), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jsb.2017.08.006 - link do publikacji
  5. The length but not the sequence of peptide linker modules exerts the primary influence on the conformations of protein domains in cellulosome multi-enzyme complexes
    Autorzy:
    Bartosz Różycki, Pierre-André Cazade, Shane O'Mahony, Damien Thompson, Marek Cieplak
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2017, tom: 19, strony: 21414-21425), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7CP04114D - link do publikacji
  6. Convergent evolution in the mechanisms of ACBD3 recruitment to picornavirus replication sites
    Autorzy:
    Vladimira Horova, Heyrhyoung Lyoo, Bartosz Różycki, Dominika Chalupska, Miroslav Smola, Jana Humpolickova, Jeroen RPM Strating, Frank JM van Kuppeveld, Evzen Boura, Martin Klima
    Czasopismo:
    PLOS Pathogens (rok: 2019, tom: 15, strony: e1007962), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.ppat.1007962 - link do publikacji
  7. Dual binding in cohesin-dockerin complexes: the energy landscape and the role of short, terminal segments of the dockerin module
    Autorzy:
    Michał Wojciechowski, Bartosz Różycki, Pham Dinh Quoc Huy, Mai Suan Li, Edward Bayer, Marek Cieplak
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: 5051), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-23380-9 - link do publikacji
  8. Konformacje białek wielodomenowych i częściowo nieustrukturyzowanych - symulacje i eksperymenty
    Autorzy:
    Bartosz Różycki
    Czasopismo:
    Postępy Biochemii (rok: 2017, tom: 63, strony: 132-136), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    brak - link do publikacji
  9. Pseudo-Improper-Dihedral Model for Intrinsically Disordered Proteins
    Autorzy:
    Łukasz Mioduszewski, Bartosz Różycki, Marek Cieplak
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2020, tom: 16, strony: 4726-4733), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.0c00338 - link do publikacji
  10. Disordered peptide chains in an alpha-C-based coarse-grained model
    Autorzy:
    Łukasz Mioduszewski, Marek Cieplak
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2018, tom: 20, strony: 19057-19070), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C8CP03309A - link do publikacji
  11. Intercellular Receptor-Ligand Binding and Thermal Fluctuations Facilitate Receptor Aggregation in Adhering Membranes
    Autorzy:
    Long Li, Jinglei Hu, Bartosz Różycki, Fan Song
    Czasopismo:
    Nano Letters (rok: 2020, tom: 20, strony: 722-728), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.nanolett.9b04596 - link do publikacji
  12. Cohesin-dockerin code in cellulosomal dual binding modes and its allosteric regulation by proline isomerization
    Autorzy:
    Andrés M. Vera, Albert Galera-Prat, Michał Wojciechowski, Bartosz Różycki, Douglas V. Laurents, Mariano Carrión-Vázquez, Marek Cieplak and Philip Tinnefeld
    Czasopismo:
    Structure (rok: 2021, tom: 29, strony: 587-597), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.str.2021.01.006 - link do publikacji
  13. Membrane fluctuations and acidosis regulate cooperative binding of 'marker of self' protein CD47 with the macrophage checkpoint receptor SIRPalpha
    Autorzy:
    Jan Steinkühler, Bartosz Różycki, Cory Alvey, Reinhard Lipowsky, Thomas R. Weikl, Rumiana Dimova, Dennis E. Discher
    Czasopismo:
    Journal of Cell Science (rok: 2019, tom: 132, strony: 216770), Wydawca: Company of Biologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1242/jcs.216770 - link do publikacji
  14. Interplay between cooperativity of intercellular receptor-ligand binding and coalescence of nanoscale lipid clusters in adhering membranes
    Autorzy:
    Long Li, Jinglei Hu, Xinghua Shi, Bartosz Różycki, Fan Song
    Czasopismo:
    Soft Matter (rok: 2021, tom: 17, strony: 1912-1920), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0SM01904F - link do publikacji
  15. Structural insights into Acyl-coenzyme A binding domain containing 3 (ACBD3) protein hijacking by picornaviruses
    Autorzy:
    Dominika Chalupska, Bartosz Różycki, Martin Klima, Evzen Boura
    Czasopismo:
    Protein Science (rok: 2019, tom: 28, strony: 2073-2079), Wydawca: Wiley-Blackwell
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/pro.3738 - link do publikacji
  1. Inferring structural ensembles of flexible and dynamic macromolecules using Bayesian, maximum entropy, and minimal-ensemble refinement methods
    Autorzy:
    Jürgen Köfinger, Bartosz Różycki, Gerhard Hummer
    Książka:
    Biomolecular Simulations: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. (rok: 2019, tom: 2022, strony: 341-352), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. Binding and segregation of proteins in membrane adhesion: Theory, modelling, and simulations
    Autorzy:
    Thomas R. Weikl, Jinglei Hu, Batuhan Kav, Bartosz Różycki
    Książka:
    Multiresponsive Behavior of Biomembranes and Giant Vesicles. Advances in Biomembranes and Lipid Self-Assembly. (rok: 2019, tom: 30, strony: 159-194), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
  3. Structures of Dynamic Protein Complexes: Hybrid Techniques to Study MAP Kinase Complexes and the ESCRT System
    Autorzy:
    Wolfgang Peti, Rebecca Page, Evzen Boura, and Bartosz Różycki
    Książka:
    Protein NMR: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. (rok: 2018, tom: 1688, strony: 375-389), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy