Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Identyfikacja białek wiążących się do powtórzeń CAG i badanie interakcji RNA-białko w komórkach

2015/19/B/NZ2/02453

Słowa kluczowe:

choroby poliglutaminowe toksyczność RNA oddziaływania RNA-białko ilościowa proteomika wizualizacja RNA

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ2_3: Proteomika
  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Adam Ciesiołka 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 1 899 440 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-06-20

Zakończenie projektu: 2021-12-19

Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. termocykler. Za kwotę 30 000 PLN
  2. orbitalna wytrząsarka laboratoryjna. Za kwotę 5 000 PLN
  3. aparat do elektroforezy i transferu białek. Za kwotę 11 000 PLN
  4. dewar. Za kwotę 10 000 PLN
  5. mikrowirówka. Za kwotę 5 000 PLN
  6. serwer do przechowywania danych proteomicznych i zdjęć mikroskopowych. Za kwotę 12 000 PLN
  7. sprzęt komputerowy z oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  8. koncentrator próżniowy. Za kwotę 28 000 PLN
  9. licencja Corel Draw.
  10. nukleofektor. Za kwotę 83 000 PLN
  11. wysokoprzepustowy sonikator. Za kwotę 72 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (12)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Artificial miRNAs targeting CAG repeat expansion in ORFs cause rapid deadenylation and translation inhibition of mutant transcripts
    Autorzy:
    Ciesiolka, A., Stroynowska-Czerwinska, A., Joachimiak, P., Ciolak, A., Kozlowska, E., Michalak, M., Dabrowska, M., Olejniczak, M., Raczynska, K. D., Zielinska, D., Wozna-Wysocka, M., Krzyzosiak, W. J., Fiszer, A.
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2021, tom: 78, strony: 1577-1596), Wydawca: Springer Science+Business Media
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-020-03596-7 - link do publikacji
  2. Generation of human iPS cell line IBCHi002-A from spinocerebellar ataxia type 3/Machado-Joseph disease patient's fibroblasts
    Autorzy:
    Ciolak, A., Krzyzosiak, W. J., Kozlowska, E., Fiszer, A.
    Czasopismo:
    Stem Cell Research (rok: 2020, tom: 45, strony: 101796), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.scr.2020.101796 - link do publikacji
  3. Nuclear speckles: molecular organization, biological function and role in Disease
    Autorzy:
    Galganski L., Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 10350-10368), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkx759 - link do publikacji
  4. RAN Translation of the Expanded CAG Repeats in the SCA3 Disease Context
    Autorzy:
    Jazurek-Ciesiolka, M., Ciesiolka, A., Komur, A. A., Urbanek-Trzeciak, M. O., Krzyzosiak, W. J., Fiszer A.
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Biology (rok: 2020, tom: 432, strony: 166699), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  5. Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents
    Autorzy:
    Urbanek M.O., Fiszer A., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fncel.2017.00082 - link do publikacji
  6. 2D and 3D FISH of expanded repeat RNAs in human lymphoblasts
    Autorzy:
    Urbanek M.O., Michalak M., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2017, tom: 120, strony: 49-57), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ymeth.2017.04.002 - link do publikacji
  7. Structural Characteristics of Simple RNA Repeats Associated with Disease and their Deleterious Protein Interactions
    Autorzy:
    Ciesiolka A., Jazurek M., Drazkowska K., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 97), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fncel.2017.00097 - link do publikacji
  8. Discriminating RNA variants with single-molecule allele-specific FISH
    Autorzy:
    Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Mutation Research – Reviews in Mutation Research (rok: 2017, tom: 773, strony: 230-241), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.mrrev.2016.09.003 - link do publikacji
  9. Generation of New Isogenic Models of Huntington's Disease Using CRISPR-Cas9 Technology
    Autorzy:
    Dabrowska, M., Ciolak, A., Kozlowska, E., Fiszer, A., Olejniczak, M.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1854), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21051854 - link do publikacji
  10. miRNAmotif—A Tool for the Prediction of Pre-miRNA–Protein Interactions
    Autorzy:
    Martyna O. Urbanek-Trzeciak, Edyta Jaworska, Wlodzimierz J. Krzyzosiak
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 4075), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19124075 - link do publikacji
  11. Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases
    Autorzy:
    Jazurek M., Ciesiolka A., Starega-Roslan J., Bilinska K., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050 – 9070), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw803 - link do publikacji
  12. Implications of Poly(A) Tail Processing in Repeat Expansion Diseases
    Autorzy:
    Joachimiak P., Ciesiolka A., Figura G., Fiszer A.
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2022, tom: 11, strony: 677), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cells11040677 - link do publikacji
  1. Ribosome meets RISC at expanded CAG repeat tract - allele-selective RNAi approach for therapy of polyglutamine diseases
    Autorzy:
    P. Joachimiak, A. Ciesiolka, A. Luzna, E. Kozlowska, M. Michalak, W.J. Krzyzosiak, A. Fiszer
    Konferencja:
    The 44th FEBS Congress: From molecules to living systems (rok: 2019, ), Wydawca: John Wiley & Sons on behalf of the Federation of European Biochemical Societies
    Data:
    konferencja 43622
    Status:
    Opublikowana