Identyfikacja białek wiążących się do powtórzeń CAG i badanie interakcji RNA-białko w komórkach
2015/19/B/NZ2/02453
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ2_3: Proteomika
- NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Instytut Chemii Bioorganicznej PAN
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 7
Konkurs
OPUS 10 – ogłoszony 2015-09-15
- Przyznana kwota
- 1 899 440 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2016-06-20
- Zakończenie projektu
- 2021-12-19
- Planowany czas trwania projektu
- 66 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- aparat do elektroforezy i transferu białek. Za kwotę 11 000 PLN
- dewar. Za kwotę 10 000 PLN
- koncentrator próżniowy. Za kwotę 28 000 PLN
- licencja Corel Draw.
- mikrowirówka. Za kwotę 5 000 PLN
- nukleofektor. Za kwotę 83 000 PLN
- orbitalna wytrząsarka laboratoryjna. Za kwotę 5 000 PLN
- serwer do przechowywania danych proteomicznych i zdjęć mikroskopowych. Za kwotę 12 000 PLN
- sprzęt komputerowy z oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
- termocykler. Za kwotę 30 000 PLN
- wysokoprzepustowy sonikator. Za kwotę 72 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (12)
-
RAN Translation of the Expanded CAG Repeats in the SCA3 Disease Context
- Autorzy:
- Jazurek-Ciesiolka, M., Ciesiolka, A., Komur, A. A., Urbanek-Trzeciak, M. O., Krzyzosiak, W. J., Fiszer A.
- Czasopismo:
- Journal of Molecular Biology (rok: 2020, tom: 432, strony: 166699), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.jmb.2020.10.033 – link do publikacji
-
miRNAmotif—A Tool for the Prediction of Pre-miRNA–Protein Interactions
- Autorzy:
- Martyna O. Urbanek-Trzeciak, Edyta Jaworska, Wlodzimierz J. Krzyzosiak
- Czasopismo:
- International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 4075), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms19124075 – link do publikacji
-
Implications of Poly(A) Tail Processing in Repeat Expansion Diseases
- Autorzy:
- Joachimiak P., Ciesiolka A., Figura G., Fiszer A.
- Czasopismo:
- Cells (rok: 2022, tom: 11, strony: 677), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/cells11040677 – link do publikacji
-
Artificial miRNAs targeting CAG repeat expansion in ORFs cause rapid deadenylation and translation inhibition of mutant transcripts
- Autorzy:
- Ciesiolka, A., Stroynowska-Czerwinska, A., Joachimiak, P., Ciolak, A., Kozlowska, E., Michalak, M., Dabrowska, M., Olejniczak, M., Raczynska, K. D., Zielinska, D., Wozna-Wysocka, M., Krzyzosiak, W. J., Fiszer, A.
- Czasopismo:
- Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2021, tom: 78, strony: 1577-1596), Wydawca: Springer Science+Business Media
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00018-020-03596-7 – link do publikacji
-
Generation of New Isogenic Models of Huntington's Disease Using CRISPR-Cas9 Technology
- Autorzy:
- Dabrowska, M., Ciolak, A., Kozlowska, E., Fiszer, A., Olejniczak, M.
- Czasopismo:
- International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1854), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms21051854 – link do publikacji
-
Generation of human iPS cell line IBCHi002-A from spinocerebellar ataxia type 3/Machado-Joseph disease patient's fibroblasts
- Autorzy:
- Ciolak, A., Krzyzosiak, W. J., Kozlowska, E., Fiszer, A.
- Czasopismo:
- Stem Cell Research (rok: 2020, tom: 45, strony: 101796), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.scr.2020.101796 – link do publikacji
-
Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents
- Autorzy:
- Urbanek M.O., Fiszer A., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: Frontiers Media SA
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fncel.2017.00082 – link do publikacji
-
Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases
- Autorzy:
- Jazurek M., Ciesiolka A., Starega-Roslan J., Bilinska K., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050 – 9070), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkw803 – link do publikacji
-
Nuclear speckles: molecular organization, biological function and role in Disease
- Autorzy:
- Galganski L., Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 10350-10368), Wydawca: Oxford University Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkx759 – link do publikacji
-
Structural Characteristics of Simple RNA Repeats Associated with Disease and their Deleterious Protein Interactions
- Autorzy:
- Ciesiolka A., Jazurek M., Drazkowska K., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 97), Wydawca: Frontiers Media SA
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fncel.2017.00097 – link do publikacji
-
2D and 3D FISH of expanded repeat RNAs in human lymphoblasts
- Autorzy:
- Urbanek M.O., Michalak M., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Methods (rok: 2017, tom: 120, strony: 49-57), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.ymeth.2017.04.002 – link do publikacji
-
Discriminating RNA variants with single-molecule allele-specific FISH
- Autorzy:
- Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
- Czasopismo:
- Mutation Research – Reviews in Mutation Research (rok: 2017, tom: 773, strony: 230-241), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.mrrev.2016.09.003 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
-
Ribosome meets RISC at expanded CAG repeat tract - allele-selective RNAi approach for therapy of polyglutamine diseases
- Autorzy:
- P. Joachimiak, A. Ciesiolka, A. Luzna, E. Kozlowska, M. Michalak, W.J. Krzyzosiak, A. Fiszer
- Konferencja:
- The 44th FEBS Congress: From molecules to living systems (rok: 2019, strony: 50-51), Wydawca: John Wiley & Sons on behalf of the Federation of European Biochemical Societies
- Data:
- konferencja 43622
- Status:
- Opublikowana