Identyfikacja białek wiążących się do powtórzeń CAG i badanie interakcji RNA-białko w komórkach

2015/19/B/NZ2/02453

Słowa kluczowe

Deskryptory

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ2_3: Proteomika
  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka

Panel

NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki »

Kierownik projektu (z jednostki realizującej)

dr Adam Kazimierz Ciesiołka

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs

OPUS 10 – ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota
1 899 440 PLN
Rozpoczęcie projektu
2016-06-20
Zakończenie projektu
2021-12-19
Planowany czas trwania projektu
66 miesięcy (z wniosku)
Status projektu
Projekt rozliczony

Opis projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. aparat do elektroforezy i transferu białek. Za kwotę 11 000 PLN
  2. dewar. Za kwotę 10 000 PLN
  3. koncentrator próżniowy. Za kwotę 28 000 PLN
  4. licencja Corel Draw.
  5. mikrowirówka. Za kwotę 5 000 PLN
  6. nukleofektor. Za kwotę 83 000 PLN
  7. orbitalna wytrząsarka laboratoryjna. Za kwotę 5 000 PLN
  8. serwer do przechowywania danych proteomicznych i zdjęć mikroskopowych. Za kwotę 12 000 PLN
  9. sprzęt komputerowy z oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  10. termocykler. Za kwotę 30 000 PLN
  11. wysokoprzepustowy sonikator. Za kwotę 72 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

Publikacje w czasopismach (12)

  1. RAN Translation of the Expanded CAG Repeats in the SCA3 Disease Context

    Autorzy:
    Jazurek-Ciesiolka, M., Ciesiolka, A., Komur, A. A., Urbanek-Trzeciak, M. O., Krzyzosiak, W. J., Fiszer A.
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Biology (rok: 2020, tom: 432, strony: 166699), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.jmb.2020.10.033 – link do publikacji
  2. miRNAmotif—A Tool for the Prediction of Pre-miRNA–Protein Interactions

    Autorzy:
    Martyna O. Urbanek-Trzeciak, Edyta Jaworska, Wlodzimierz J. Krzyzosiak
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 4075), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.3390/ijms19124075 – link do publikacji
  3. Implications of Poly(A) Tail Processing in Repeat Expansion Diseases

    Autorzy:
    Joachimiak P., Ciesiolka A., Figura G., Fiszer A.
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2022, tom: 11, strony: 677), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.3390/cells11040677 – link do publikacji
  4. Artificial miRNAs targeting CAG repeat expansion in ORFs cause rapid deadenylation and translation inhibition of mutant transcripts

    Autorzy:
    Ciesiolka, A., Stroynowska-Czerwinska, A., Joachimiak, P., Ciolak, A., Kozlowska, E., Michalak, M., Dabrowska, M., Olejniczak, M., Raczynska, K. D., Zielinska, D., Wozna-Wysocka, M., Krzyzosiak, W. J., Fiszer, A.
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2021, tom: 78, strony: 1577-1596), Wydawca: Springer Science+Business Media
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s00018-020-03596-7 – link do publikacji
  5. Generation of New Isogenic Models of Huntington's Disease Using CRISPR-Cas9 Technology

    Autorzy:
    Dabrowska, M., Ciolak, A., Kozlowska, E., Fiszer, A., Olejniczak, M.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1854), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.3390/ijms21051854 – link do publikacji
  6. Generation of human iPS cell line IBCHi002-A from spinocerebellar ataxia type 3/Machado-Joseph disease patient's fibroblasts

    Autorzy:
    Ciolak, A., Krzyzosiak, W. J., Kozlowska, E., Fiszer, A.
    Czasopismo:
    Stem Cell Research (rok: 2020, tom: 45, strony: 101796), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.scr.2020.101796 – link do publikacji
  7. Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents

    Autorzy:
    Urbanek M.O., Fiszer A., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.3389/fncel.2017.00082 – link do publikacji
  8. Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases

    Autorzy:
    Jazurek M., Ciesiolka A., Starega-Roslan J., Bilinska K., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050 – 9070), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1093/nar/gkw803 – link do publikacji
  9. Nuclear speckles: molecular organization, biological function and role in Disease

    Autorzy:
    Galganski L., Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 10350-10368), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1093/nar/gkx759 – link do publikacji
  10. Structural Characteristics of Simple RNA Repeats Associated with Disease and their Deleterious Protein Interactions

    Autorzy:
    Ciesiolka A., Jazurek M., Drazkowska K., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 97), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.3389/fncel.2017.00097 – link do publikacji
  11. 2D and 3D FISH of expanded repeat RNAs in human lymphoblasts

    Autorzy:
    Urbanek M.O., Michalak M., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2017, tom: 120, strony: 49-57), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.ymeth.2017.04.002 – link do publikacji
  12. Discriminating RNA variants with single-molecule allele-specific FISH

    Autorzy:
    Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J.
    Czasopismo:
    Mutation Research – Reviews in Mutation Research (rok: 2017, tom: 773, strony: 230-241), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.mrrev.2016.09.003 – link do publikacji

Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)

  1. Ribosome meets RISC at expanded CAG repeat tract - allele-selective RNAi approach for therapy of polyglutamine diseases

    Autorzy:
    P. Joachimiak, A. Ciesiolka, A. Luzna, E. Kozlowska, M. Michalak, W.J. Krzyzosiak, A. Fiszer
    Konferencja:
    The 44th FEBS Congress: From molecules to living systems (rok: 2019, strony: 50-51), Wydawca: John Wiley & Sons on behalf of the Federation of European Biochemical Societies
    Data:
    konferencja 43622
    Status:
    Opublikowana

« Nowe wyszukiwanie

Projekt graficzny i wykonanie: Jakub Piotrowski