Projekty finansowane przez NCN
Bioinformatyczna analiza cech opisujących jakość nóg i racic bydła ze szczególnym uwzględnieniem epistazy
2015/19/B/NZ9/03725
Słowa kluczowe:
analiza asocjacyjna bydło epistaza nogi i racice mikromacierz SNP
Deskryptory:
- NZ9_2: Naukowe podstawy zootechniki
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
Panel:
NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt
woj. dolnośląskie
Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15
Przyznana kwota: 362 900 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2016-06-01
Zakończenie projektu: 2019-11-14
Planowany czas trwania projektu: 41 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- wymiana procesorów serwera obliczeniowego (minimalne paramtery procesora: Intel Xeon E5-2440, 2.4GHz, 6 rdzeni, 15 MB). Za kwotę 12 000 PLN
- Komputer przenośny. Za kwotę 5 890 PLN
- komputer przenośny. Za kwotę 6 000 PLN
- rozbudowa pamięci serwera obliczeniowego (minimalne paramtery modułu 16 GB, 1600MHz). Za kwotę 8 500 PLN
- uzupełnienie przestrzeni dyskowej serwera obliczeniowego (minimalne paramtery dysku 1TB). Za kwotę 10 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
- Two-stage GWAS for the identification of causal variants underlying hoof disorders in cattleAutorzy:Tomasz Suchockil, Christa Egger-Danner, Herman Schwarzenbacher, Joanna SzydaCzasopismo:Journal of Dairy Science (rok: 2020, tom: 103, strony: 4483-4494), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE INCStatus:OpublikowanaDoi:10.3168/jds.2019-17542 - link do publikacji
- Exploring the Potential Genetic Heterogeneity in the Incidence of Hoof Disorders in Austrian Fleckvieh and Braunvieh CattleAutorzy:Barbara Kosinska-Selbi, Tomasz Suchocki, Christa Egger-Danner, Hermann Schwarzenbacher, Magdalena Fraszczak, Joanna SzydaCzasopismo:Frontiers in Genetics (rok: 2020, tom: 11, strony: 1423), Wydawca: FrontiersStatus:OpublikowanaDoi:10.3389/fgene.2020.577116 - link do publikacji
- Genome-wide association study for leg disorders in Austrian Braunvieh and FleckviehAutorzy:B. Kosińska-Selbi, T. Suchocki, M. Frąszczak, C.H. Egger-Danner, H. Schwarzenbacher and J. SzydaKonferencja:Book of Abstracts of the 70th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (rok: 2019, ), Wydawca: Wageningen Academic PublishersData:konferencja 26.08. – 30.08.2019Status:Opublikowana
- Combining SNP-chip and whole genome sequence data towards the identification of causal mutations underlying feet and leg disorders in cattleAutorzy:T. Suchocki, Ch. Egger-Danner, H. Schwarzenbacher, M. Mielczarek, J. SzydaKonferencja:World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (rok: 2018, ), Wydawca: Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production,Data:konferencja 11-16.02.2018Status:Opublikowana