Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Algorytmy memetyczne do badania dyfuzji liganda w elektronowym stanie wzbudzonym w skondensowanej materii biologicznej

2015/19/N/ST3/02171

Słowa kluczowe:

dynamika molekularna nanofizyka modelowanie komputerowe optogenetyka kompleksy ligand-białko dynamika diabatyczna dyfuzja

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • ST4_7: Fizyka chemiczna
  • ST3_4: Transport w materii skondensowanej

Panel:

ST3 - Fizyka fazy skondensowanej: struktura, własności elektronowe, płyny, nano-nauka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Jakub Rydzewski 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 100 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-08-23

Zakończenie projektu: 2019-08-22

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  1. Photoinduced Transport in an H64Q Neuroglobin Antidote for Carbon Monoxide Poisoning IF: 2,965
    Autorzy:
    J. Rydzewski, W. Nowak
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Physics (rok: 2018, tom: 148, strony: 115101), Wydawca: AIP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5013659 - link do publikacji
  2. Rare-Event Sampling in Ligand Diffusion IF: 13,84
    Autorzy:
    J. Rydzewski, W. Nowak
    Czasopismo:
    Physics of Life Reviews (rok: 2017, tom: 22--23, strony: 85--87), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plrev.2017.08.011 - link do publikacji
  3. Thermodynamics of camphor migration in cytochrome P450cam by atomistic simulations IF: 4,847
    Autorzy:
    J. Rydzewski, W. Nowak
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 7736), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-017-07993-0 - link do publikacji
  4. Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics IF: 13,84
    Autorzy:
    J. Rydzewski, W. Nowak
    Czasopismo:
    Physics of Life Reviews (rok: 2017, tom: 22--23, strony: 58--74), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plrev.2017.03.003 - link do publikacji
  5. maze: Heterogeneous Ligand Unbinding along Transient Protein Tunnels IF: 4,403
    Autorzy:
    J. Rydzewski
    Czasopismo:
    Computer Physics Communications (rok: 2020, tom: 247, strony: 106865), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.cpc.2019.106865 - link do publikacji