Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza transkryptomów plemników knura i ich wpływ na jakość nasienia po kriokonserwacji

2015/19/B/NZ9/01333

Słowa kluczowe:

plemniki knur kriokonserwacja transkrytom RNA-seq

Deskryptory:

  • NZ9_2: Naukowe podstawy zootechniki

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Wydział Bioinżynierii Zwierząt

woj. warmińsko-mazurskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Leyland Fraser 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 538 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-06-15

Zakończenie projektu: 2020-06-14

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (12)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Regulatory potential of long non-coding RNAs (lncRNAs) in boar spermatozoa with good and poor freezability IF: 3,817
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Łukasz Paukszto, Anna Mańkowska, Paweł Brym, Przemysław Gilun, Jan P. Jastrzębski, Chandra S. Pareek, Dibyendu Kumar, Mariusz Pierzchała
    Czasopismo:
    Life (rok: 2020, tom: 10, strony: 300), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/life10110300 - link do publikacji
  2. Gene promoter polymorphisms in boar spermatozoa differing in freezability IF: 2,74
    Autorzy:
    Paweł Brym, Karolina Wasilewska-Sakowska, Marzena Mogielnicka-Brzozowska, Anna Mańkowska, Łukasz Paukszto, Chandra S. Pareek, Władysław Kordan, Stanisław Kondracki, Leyland Fraser
    Czasopismo:
    Theriogenology (rok: 2021, tom: 166, strony: 112-123), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.theriogenology.2021.02.018 - link do publikacji
  3. Isolation of total ribonucleic acid from fresh and frozen-thawed boar semen and its relevance in transcriptome studies IF: 0,678
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Paweł Brym, Chandra S. Pareek
    Czasopismo:
    South African Journal of Animal Science (rok: 2017, tom: 47, strony: 56-60), Wydawca: South African Society for Animal Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4314/sajas.v47i1.9 - link do publikacji
  4. Sperm DNA damage in relation to lipid peroxidation following freezing-thawing of boar semen IF: 0,678
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Jerzy Strzeżek, Karolina Wasilewska, Chandra S. Pareek
    Czasopismo:
    South African Journal of Animal Science (rok: 2017, tom: 47, strony: 213-218), Wydawca: South African Society for Animal Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4314/sajas.v47i2.13 - link do publikacji
  5. Total RNA quality in boar spermatozoa with different freezability IF: 0,802
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Paweł Brym, Marzena Mogielnicka-Brzozowska, Karolina Wasilewska
    Czasopismo:
    Polish Journal of Veterinary Sciences (rok: 2019, tom: 20, strony: 181-185), Wydawca: Polish Academy of Sciences Committee of Veterinary Sciences, University of Warmia and Mazury in Olsztyn
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.24425/pjvs.2019.127085 - link do publikacji
  6. Transcriptome analysis of boar spermatozoa with different freezability using RNA-Seq IF: 2,299
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Paweł Brym, Chandra S. Pareek, Marzena Mogielnicka-Brzozowska, Łukasz Paukszto, Jan P. Jastrzębski, Karolina Wasilewska-Sakowska, Anna Mańkowska, Przemysław Sobiech, Kacper Żukowski
    Czasopismo:
    Theriogenology (rok: 2020, tom: 142, strony: 400-413), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.theriogenology.2019.11.001 - link do publikacji
  7. Gene polymorphisms in boar spermatozoa and their associations with post-thaw semen quality IF: 4,556
    Autorzy:
    Anna Mańkowska, Paweł Brym, Łukasz Paukszto , Jan P. Jastrzębski, Leyland Fraser
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1902), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21051902 - link do publikacji
  1. An improved protocol for total RNA extraction and QC of boar spermatozoa for RNA-Seq studies
    Autorzy:
    Paweł Brym, Karolina Wasilewska, Leyland Fraser
    Konferencja:
    Conference on Animal Genetics and Genomics (rok: 2018, ), Wydawca: University of Warmia and Mazury in Olsztyn; Polish Society of Genetics (Olsztyn Division)
    Data:
    konferencja 2-4th July
    Status:
    Opublikowana
  2. Differentially expressed gene transcripts in boar spermatozoa analyzed by RNA-Seq
    Autorzy:
    Leyland Fraser,Paweł Brym, Karolina Wasilewska
    Konferencja:
    51st Meeting of the Polish Biochemical Society, 14th Conference of the Polish Society for Cell Biology (Congress BIO2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Polish Biochemical Society, Polish Society for Cell Biology
    Data:
    konferencja 18-21st September
    Status:
    Opublikowana
  3. Profile białek błonowych plemników knura o dobrej i słabej przydatności do kriokonserwacji (ang. Membrane protein profiles of boar spermatozoa with good and poor freezability).
    Autorzy:
    Anna Mańkowska, Leyland Fraser
    Konferencja:
    Ogólnopolska Konferencja Naukowa KrakWet"– postępy w naukach weterynaryjnych i biotechnologii zwierząt (rok: 2020, ), Wydawca: Fundacja na rzecz promocji nauki i rozwoju TYGIEL
    Data:
    konferencja 43888
    Status:
    Opublikowana
  4. Gene expression profiling of boar spermatozoa with differences in freezability
    Autorzy:
    Chandra S. Pareek, Leyland Fraser
    Konferencja:
    18th Annual Conference in Bioinformatics (18th BioInformatics – BIT18) (rok: 2018, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
    Data:
    konferencja 28-30th June
    Status:
    Opublikowana
  5. Variations in expression of boar sperm transcripts analyzed by RNA-Seq
    Autorzy:
    Karolina Wasilewska-Sakowska, Leyland Fraser, Paweł Brym, Anna Mańkowska
    Konferencja:
    Proceedings of the 23rd Annual Conference of the European Society for Domestic Animal Reproduction (ESDAR), Reproduction in Domestic Animals (rok: 2019, ), Wydawca: Wiley Blackwell
    Data:
    konferencja 19-22 września
    Status:
    Opublikowana
  6. Analysis of gene transcript expression in boar spermatozoa differed in freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Anna Mańkowska, Paweł Brym, Marzena Mogielnicka-Brzozowska
    Konferencja:
    The 5th Winter Workshop of the Society for Biology of Reproduction "Central and Local Regulations of Reproductive Processes" (rok: 2019, ), Wydawca: Krakowski Oddział Towarzystwa Biologii Rozrodu
    Data:
    konferencja 13-15 lutego 2019
    Status:
    Opublikowana
  7. Big data analysis of porcine spermatozoa transcriptome by RNA-seq
    Autorzy:
    Chandra S. Pareek, Leyland Fraser
    Konferencja:
    Proceedings of the 17th Annual Conference in Bioinformatics (17th BioInformatics – BIT17) (rok: 2017, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne (PTBI), Toruń
    Data:
    konferencja 22-24 czerwca
    Status:
    Opublikowana
  8. Motion characteristics and membrane integrity of boar spermatozoa differing in freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Łukasz Zasiadczyk, Karolina Wasilewska, Krystyna Filipowicz, Krzysztof Karpiesiuk
    Konferencja:
    Program and Streszczenia, VIII Zjazd Towarzystwa Biologii Rozrodu (rok: 2017, ), Wydawca: Towarzystwa Biologii Rozrodu, Olsztyn
    Data:
    konferencja 7-9 września
    Status:
    Opublikowana
  9. Post-thaw characteristics of boar spermatozoa with different freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Karolina Wasilewska, Łukasz Zasiadczyk
    Konferencja:
    Research in pig breeding : Workshop Proceedings of Abstracts (rok: 2017, ), Wydawca: Institue of Animal Science Prague Uhrineves, Department of Pig Breeding , Czech Academy of Agricultural Sciences
    Data:
    konferencja 17-18 października
    Status:
    Opublikowana
  10. Gene expression profiles of boar spermatozoa differed in semen freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Paweł Brym, Karolina Wasilewska, Łukasz Paukszto, Jan P. Jastrzębski, Chandra S. Pareek
    Konferencja:
    Conference on Animal Genetics and Genomics (rok: 2018, ), Wydawca: University of Warmia and Mazury in Olsztyn; Polish Society of Genetics (Olsztyn Division)
    Data:
    konferencja 2-4th July
    Status:
    Opublikowana
  11. Quality of total RNA isolated from spermatozoa of boars with different semen freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Chandra S. Pareek, Karolina Wasilewska, Marzena Mogielnicka-Brzozowska
    Konferencja:
    Reproduction in Domestic Animals, Proceedings of the 21st Annual Conference of the European Society for Domestic Animal Reproduction (ESDAR); Publikacja indeksowana w bazie Web of Science (rok: 2017, ), Wydawca: Wiley Blackwell
    Data:
    konferencja 24-26 sierpnia
    Status:
    Opublikowana
  12. A preliminary study on transcriptome analysis of boar spermatozoa differed in freezability
    Autorzy:
    Leyland Fraser, Chandra S. Pareek, Paweł Brym, Karolina Wasilewska, Min Tu,Yaping Feng, Dibyendu Kumar
    Konferencja:
    Proceedings of the 22nd Annual Conference on the European Society for Domestic Animal Reproduction (ESDAR) (rok: 2018, ), Wydawca: Wiley Blackwell
    Data:
    konferencja 27-29th September
    Status:
    Opublikowana
  1. Markers for Sperm Freezability and Relevance of Transcriptome Studies in Semen Cryopreservation: A Review
    Autorzy:
    Leyland Fraser
    Książka:
    Theriogenology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (rok: 2017, ), Wydawca: InTech Europe
    Status:
    Opublikowana