Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowe, nieograniczone rozdzielczością, metody i zastosowania spektroskopii NMR.

2015/18/A/ST4/00270

Słowa kluczowe:

spektroskopia NMR białka niezwinięte duże białka zwijanie-rozwijanie białek interferencja mechanizmów relaksacji

Deskryptory:

  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Wiktor Koźmiński 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: MAESTRO 7 - ogłoszony 2015-06-15

Przyznana kwota: 3 252 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-05-13

Zakończenie projektu: 2023-05-12

Planowany czas trwania projektu: 84 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Serwer obliczeniowy.. Za kwotę 30 000 PLN
  2. Chromatograf.
  3. Komputer stacjonarny. (5 szt.). Za kwotę 30 000 PLN
  4. Zestaw do spektroskopii NMR pod wysokim ciśnieniem. Za kwotę 330 000 PLN
  5. Waga precyzyjna.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (11)
  1. Mechanism of Atg9 recruitment by Atg11 in the cytoplasm-to-vacuole targeting pathway
    Autorzy:
    Nicolas Coudevylle, Bartłomiej Banaś , Verena Baumann, Martina Schuschnig, Anna Zawadzka-Kazimierczuk, Wiktor Koźmiński, Sascha Martens
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2022, tom: 298, strony: 101573), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jbc.2022.101573 - link do publikacji
  2. Reconstruction of non-uniformly sampled five-dimensional NMR spectra by signal separation algorithm
    Autorzy:
    Krzysztof Kosiński, Jan Stanek, Michał J. Górka, Szymon Żerko, Wiktor Koźmiński
    Czasopismo:
    Journal of Biomolecular NMR (rok: 2017, tom: 68, strony: 129–138), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10858-017-0095-8 - link do publikacji
  3. 1H, 13C and 15N backbone resonance assignment of BRCA1 fragment 219–504
    Autorzy:
    Michał Górka, Szymon Żerko, Robert Konrat, Wiktor Koźmiński, Dennis Kurzbach
    Czasopismo:
    Biomolecular NMR Assignments (rok: 2020, tom: 14, strony: 289–293), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12104-020-09963-6 - link do publikacji
  4. High-dimensional NMR methods for intrinsically disordered proteins studies
    Autorzy:
    Katarzyna Grudziąż, Anna Zawadzka-Kazimierczuk, Wiktor Koźmiński
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2019, tom: 148, strony: 81-87), Wydawca: elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ymeth.2018.04.031 - link do publikacji
  5. Order from disorder in the sarcomere: FATZ forms a fuzzy but tight complex and phase-separated condensates with α-actinin
    Autorzy:
    A. Sponga, J.L. Arolas, T.C. Schwarz, Cy M. Jeffries, A. Rodriguez Chamorro, J. Kostan, A. Ghisleni, F. Drepper, A. Polyansky, E. De Almeida Ribeiro, M. Pedron, A. Zawadzka-Kazimierczuk, G. Mlynek, T. Peterbauer, P. Doto, C. Schreiner, E. Holler, B. Mateos, L. Geist, G. Faulkner, W. Koźmiński, D. I. Svergun, B. Warscheid, B. Zagrović, M. Gautel, R. Konrat, K. Djinović-Carugo
    Czasopismo:
    Science Advances (rok: 2021, tom: 7, strony: 1), Wydawca: American Association for the Advancement of Science.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1126/sciadv.abg7653 - link do publikacji
  6. Structure, dynamics, and function of SrnR, a transcription factor for nickel-dependent gene expression
    Autorzy:
    L. Mazzei, F. Musiani, S. Żerko, W. Koźmiński, M. Cianci, Y. Beniamino, S. Ciurli, B. Zambelli
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2021, tom: 13, strony: 1), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/mtomcs/mfab069 - link do publikacji
  7. Coupled MD simulations and NMR reveal that the intrinsically disordered domain of the breast-cancer susceptibility 1 protein (BRCA1) binds head-on to DNA double-strand ends
    Autorzy:
    Kateryna Che, Thomas Kress, Michał Górka, Szymon Żerko, Wiktor Kozminski, Dennis Kurzbach
    Czasopismo:
    Journal of Magnetic Resonance Open (rok: 2022, tom: 45639, strony: 45297), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jmro.2022.100069 - link do publikacji
  8. Hyperphosphorylation of Human Osteopontin and Its Impact on Structural Dynamics and Molecular Recognition
    Autorzy:
    B. Mateos, J. Holzinger, C. Conrad-Billroth, G. Platzer, S. Żerko, M. Sealey-Cardona, D. Anrather, W. Koźmiński, R. Konrat
    Czasopismo:
    Biochemistry (rok: 2021, tom: 60, strony: 1347−1355), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.biochem.1c00050 - link do publikacji
  9. Structural analysis of 25-hydroxycholesterol stereoisomers differing in configuration in position 17 and 20, by three-dimensional NMR spectra
    Autorzy:
    MariaMisiak, WiktorKoźmiński, JacekWójcik, Rafał R.Siciński, Jerzy Wicha
    Czasopismo:
    Steroids (rok: 2019, tom: 143, strony: 49-52), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.steroids.2018.12.005 - link do publikacji
  10. Structure and dynamics of Helicobacter pylori nickel-chaperone HypA: an integrated approach using NMR spectroscopy, functional assays and computational tools
    Autorzy:
    Chris A. E. M. Spronk, Szymon Żerko, Michał Górka, Wiktor Koźmiński, Benjamin Bardiaux, Barbara Zambelli, Francesco Musiani, Mario Piccioli, Priyanka Basak, Faith C. Blum, Ryan C. Johnson, Heidi Hu, D. Scott Merrell, Michael Maroney, Stefano Ciurli
    Czasopismo:
    Journal of Biological Inorganic Chemistry (rok: 2018, tom: 23, strony: 1309–1330), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00775-018-1616-y - link do publikacji
  11. The Two Isoforms of Lyn Display Different Intramolecular Fuzzy Complexes with the SH3 Domain
    Autorzy:
    João M. C. Teixeira, Héctor Fuentes, Stase Bielskute, Margarida Gairi, Szymon Żerko, Wiktor Koźmiński and Miquel Pons
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2018, tom: 23, strony: 2731-2741), Wydawca: MDPI AG, Basel, Switzerland
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules23112731 - link do publikacji