Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i ewaluacja nowego zestawu narzędzi dla biologii i biotechnologii opartego na analogach nukleotydów adeninowych

2015/18/E/ST5/00555

Słowa kluczowe:

nukleotydy synteza chemiczna sulfotransferazy pirofosfatazy kinazy bakteryjny kap analogi nukleotydów modyfikacje fosforanów PAPS ATP NAD sulfurylacja fosforylacja hydroliza enzymatyczna chemia bioorganiczna chemia biologiczna

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Joanna Kowalska 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: SONATA BIS 5 - ogłoszony 2015-06-15

Przyznana kwota: 1 993 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-04-12

Zakończenie projektu: 2021-10-11

Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. System do chromatografii cieczowej (flash). Za kwotę 260 000 PLN
  2. Termocykler. Za kwotę 30 000 PLN
  3. Termomikser. Za kwotę 15 000 PLN
  4. System FPLC do oczyszczania białek. Za kwotę 280 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
  1. Purine and pyrimidine dinucleoside polyphosphates differentially affect the phenylpropanoid pathway in Vitis vinifera L. cv. Monastrell suspension cultured cells
    Autorzy:
    Małgorzata Pietrowska-Borek, Anna Wojdyła-Mamoń, Jędrzej Dobrogojski, Agnieszka Młynarska-Cieślak, Marek R Baranowski, Jakub M. Dąbrowski, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Sławomir Borek, Maria Angeles Pedreño, Andrzej Guranowski
    Czasopismo:
    Plant Physiology and Biochemistry (rok: 2020, tom: 147, strony: 125-132), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plaphy.2019.12.015 - link do publikacji
  2. Nicotinamide-Containing Di- and Trinucleotides as Chemical Tools for Studies of NAD-Capped RNAs
    Autorzy:
    Agnieszka Mlynarska-Cieslak, Anais Depaix, Ewa Grudzien-Nogalska, Pawel J. Sikorski, Marcin Warminski, Megerditch Kiledjian, Jacek Jemielity, and Joanna Kowalska*
    Czasopismo:
    Organic Letters (rok: 2018, tom: 20, strony: 7650–7655), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.orglett.8b03386 - link do publikacji
  3. Preparation of RNAs with non-canonical 5′ ends using novel di- and trinucleotide reagents for co-transcriptional capping
    Autorzy:
    Anaïs Depaix, Ewa Grudzien-Nogalska, Bartlomiej Fedorczyk, Megerditch Kiledjian, Jacek Jemielity,* Joanna Kowalska *
    Czasopismo:
    Frontiers in Molecular Biosciences , Wydawca: Frontiers
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  4. Direct High-Throughput Screening Assay for mRNA Cap Guanine-N7 Methyltransferase Activity
    Autorzy:
    Renata Kasprzyk, Mateusz Fido, Adam Mamot, Przemysław Wanat, Mirosław Śmietański, Michał Kopciał, Victoria Cowling, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2020, tom: 26, strony: 11266-11275), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202001036 - link do publikacji
  5. NAD Analogs in Aid of Chemical Biology and Medicinal Chemistry
    Autorzy:
    Anais Depaix, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2019, tom: 24, strony: 4187), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules24224187 - link do publikacji
  6. RNA Ligation for Mono and Dually Labeled RNAs
    Autorzy:
    Anaïs Depaix, Agnieszka Mlynarska-Cieslak, Marcin Warminski, Pawel J. Sikorski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 12190-12197), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202101909 - link do publikacji
  7. DXO/Rai1 enzymes remove 5′-end FAD and dephospho-CoA caps on RNAs
    Autorzy:
    Selom K. Doamekpor, Ewa Grudzień-Nogalska, Agnieszka Młynarska-Cieślak, Joanna Kowalska, Megerditch Kiledjian, Liang Tong
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 6136–6148), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa297 - link do publikacji
  8. ExciTides: NTP-derived probes for monitoring pyrophosphatase activity based on excimer-to-monomer transitions
    Autorzy:
    Przemyslaw Wanat, Renata Kasprzyk, Michal Kopcial, Pawel J. Sikorski, Dominika Strzelecka, Jacek Jemielity and Joanna Kowalska*
    Czasopismo:
    Chemical Communications (rok: 2018, tom: 54, strony: 9773-9776), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C8CC04968H - link do publikacji
  9. Fluorinated PAPS analogs for continuous sulfotransferase activity monitoring and inhibitor screening by 19F NMR spectroscopy
    Autorzy:
    Agnieszka Mlynarska-Cieslak, Mikolaj Chrominski, Tomasz Spiewla, Marek R. Baranowski, Marcelina Bednarczyk, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska*
    Czasopismo:
    ACS Chemical Biology (rok: 2022, tom: 17, strony: 661–669), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acschembio.1c00978 - link do publikacji
  1. Synteza analogów PAPS jako inhibitorów sulfotransferaz i ich ewaluacja przy użyciu metody MST
    Autorzy:
    Młynarska-Cieślak A., Baranowski M., Kubacka D., Warmiński M., Magda M., Jemielity J., Kowalska J.
    Konferencja:
    62 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2019, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 02-06.09.2019
    Status:
    Opublikowana
  2. A chemical toolbox to study NAD-capped RNAs
    Autorzy:
    Mlynarska-Cieslak A., Depaix A., Grudzien-Nogalska E., Sikorski P., Warminski M., Kiledjian M., Jemielity J., Kowalska J.
    Konferencja:
    24th Annual Meeting of the RNA Society (rok: 2019, ), Wydawca: RNA Society
    Data:
    konferencja 11-16.06.2019
    Status:
    Opublikowana
  3. Phosphate-modified nucleotides as molecular tools for probing and modulating protein activity
    Autorzy:
    Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Konferencja:
    XXIII INTERNATIONAL ROUNDTABLE ON NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS (rok: 2018, ), Wydawca: University of California San Diego
    Data:
    konferencja 26-30.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  4. Exploring fragmentation pathways for dinucleotides using tandem mass spectrometry
    Autorzy:
    Agnieszka Brzezińska, Dominika Strzelecka, Sebastian Chmieliński, Sylwia Bednarek, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Konferencja:
    6th Conference of Polish Mass Spectrometry Society (rok: 2018, ), Wydawca: Institute of Organic Chemistry, Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 23-26.04.2018
    Status:
    Opublikowana
  5. Phosphate modified PAPS analogs as tools to study sulfotransferases
    Autorzy:
    Agnieszka Młynarska-Cieślak, Marek R. Baranowski, Dorota Kubacka, Marcin Warmiński, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Konferencja:
    XXIII INTERNATIONAL ROUNDTABLE ON NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS (rok: 2018, ), Wydawca: University of California San Diego
    Data:
    konferencja 26-30.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  6. Synteza nowych analogów PAPS jako inhibitorów dla sulfotransferaz
    Autorzy:
    Agnieszka Młynarska-Cieślak, Dorota Kubacka, Marek Baranowski, Marcin Warmiński, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Konferencja:
    61. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2018, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 17-21.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  7. New NAD-capped RNA analogs as chemical tools to study RNA deNADing
    Autorzy:
    Anais Depaix, Agnieszka Młynarska, Paweł Sikorski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Konferencja:
    61. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2018, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 17-21.09.2018
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy