Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Identyfikacja i strukturalne scharakteryzowanie pierwotnych cytotoksycznych konformerów kaskady amyloidogenicznej: idealne cele badań w prewencji, diagnostyce i terapeutyce neurodegeneracji.

2014/15/Z/NZ1/00037

Słowa kluczowe:

neurodegeneracja mikroskopia siły pojedyńczej molekuły dynamika molekularna białka neurotoksyczne amyloidogeneza

Deskryptory:

  • ST3_19: Inne zagadnienia pokrewne
  • ST3_17: Fizyka statystyczna (materii skondensowanej)
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Fizyki PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Marek Cieplak 

Liczba wykonawców projektu: 1

Konkurs: UNISONO

Przyznana kwota: 545 941 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-03-12

Zakończenie projektu: 2019-03-11

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (11)
  1. Stability of structurally entangled protein dimers IF: 2,41
    Autorzy:
    Y. Zhao, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Proteins: Structure, Function and Bioinformatics (rok: 2018, tom: 86, strony: 945-955), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/prot.25526 - link do publikacji
  2. Structural entanglements in protein complexes IF: 2,965
    Autorzy:
    Y. Zhao, M. Chwastyk, M. Cieplak
    Czasopismo:
    J. Chem. Phys. (rok: 2017, tom: 146, strony: 225102), Wydawca: AIP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.4985221 - link do publikacji
  3. Proteins at air-water and oil-water interfaces in an all-atom model IF: 4,123
    Autorzy:
    Y. Zhao, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Phys. Chem. Chem. Phyds. (rok: 2017, tom: 19, strony: 25197-25206), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7CP03829A - link do publikacji
  4. Criteria for folding in structure-based models of proteins IF: 2,89
    Autorzy:
    K. Wołek, M. Cieplak
    Czasopismo:
    J. Chem. Phys. (rok: 2016, tom: 144, strony: 185102), Wydawca: American Institute of Physics
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.4948783 - link do publikacji
  5. Elastic moduli of biological fibers in a coarse-grained model: crystalline cellulose and beta-amyloids IF: 4,123
    Autorzy:
    A. Poma, M. Chwastyk, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Phys. Chem. CVhem. Phys. (rok: 2017, tom: 19, strony: 28195-28206), Wydawca: Royal Society of Chemistyry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7CP05269C - link do publikacji
  6. Structural fluctuations and thermal stability of proteins in crowded environments: effects of the excluded volume IF: 1,84
    Autorzy:
    A. Starzyk, M. Wojciechowski, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Physical Biology (rok: 2016, tom: 13, strony: 66002), Wydawca: Institute of Physics (UK)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/1478-3975/13/6/066002 - link do publikacji
  7. Topological transformations in proteins: effects of heating and proximity of an interface IF: 5,23
    Autorzy:
    Y. Zhao, M. Chwastyk, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 39851), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep39851 - link do publikacji
  8. Disordered peptide chains in an alpha-C-based course-grained model IF: 4,123
    Autorzy:
    Ł. Mioduszewski, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Phys. Chem. Chem. Phys (rok: 2018, tom: 20, strony: 19057-19070), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8cp03309a - link do publikacji
  9. Dynamics of knotted and entangled proteins
    Autorzy:
    M. Cieplak
    Czasopismo:
    Postępy Fizyki (rok: 2018, tom: 69, strony: 44628), Wydawca: Polskie Towarzystwo Fizyczne
    Status:
    Opublikowana
  10. Multiple folding pathways of proteins with shallow knots and co-translational folding IF: 2,95
    Autorzy:
    M. Chwastyk, M. Cieplak
    Czasopismo:
    J. Chem. Phys. (rok: 2015, tom: 142, strony: 145102), Wydawca: American Institute of Physics
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.4927153 - link do publikacji
  11. Unfolding knots by the proteasomes: behavior of folded and neurotoxic proteins IF: 3,3
    Autorzy:
    M. Wojciechowski, A. Gomez-Sicilia, M. Carrion-Vazquez, M. Cieplak
    Czasopismo:
    Molecular Biosystems (rok: 2016, tom: 12, strony: 2700-2712), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6mb00214e - link do publikacji