Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Mechanizmy selektywnego wyciszania genów chorób poliglutaminowych przez nietypowe siRNA

2014/15/B/NZ1/01880

Słowa kluczowe:

choroby poliglutaminowe celowanie w powtórzenia CAG mechanizm wyciszania miRNA HITS-CLIP profilowanie rybosomów,

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ2_3: Proteomika
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Agnieszka Fiszer 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 8 - ogłoszony 2014-09-15

Przyznana kwota: 1 476 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-07-15

Zakończenie projektu: 2019-07-14

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Kolektor frakcji. Za kwotę 15 000 PLN
  2. Komputer z oprogramowaniem (3 szt.). Za kwotę 15 000 PLN
  3. Licznik komórek. Za kwotę 15 000 PLN
  4. Aparat do elektroforezy i transferu białek. Za kwotę 10 000 PLN
  5. Zamrażarka niskotemperaturowa -80st.C. Za kwotę 35 000 PLN
  6. Analizator RNA, DNA i białek.. Za kwotę 100 000 PLN
  7. Mini wirówki 2 sztuki.
  8. Pompa do odsysania płynów przy hodowlach komórkowych. Za kwotę 5 000 PLN
  9. Termomikser. Za kwotę 5 000 PLN
  10. Sonikator.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Silencing of genes responsible for polyQ diseases using chemically modified single-stranded siRNAs.
    Autorzy:
    Fiszer A, Ellison-Klimontowicz ME, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63, strony: 759-764), Wydawca: Polish Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/abp.2016_1336 - link do publikacji
  2. Nucleotide sequence of miRNA precursor contributes to cleavage site selection by Dicer.
    Autorzy:
    Starega-Roslan J, Galka-Marciniak P, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 10939-51), Wydawca: OXFORD UNIVERSITY PRESS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkv968 - link do publikacji
  3. siRNA release from pri-miRNA scaffolds is controlled by the sequence and structure of RNA.
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Olejniczak M, Starega-Roslan J, Szczesniak MW, Makalowska I, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms (rok: 2016, tom: 1859, strony: 639-49), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE BV
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2016.02.014 - link do publikacji
  4. A potential role of extended simple sequence repeats in competing endogenous RNA crosstalk
    Autorzy:
    Tomasz M. Witkoś, Włodzimierz J. Krzyżosiak, Agnieszka Fiszer, Edyta Kościańska
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2018, tom: 15, strony: 1399-1409), Wydawca: Talor&Francis
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/15476286.2018.1536593 - link do publikacji
  5. Mutant CAG Repeats Effectively Targeted by RNA Interference in SCA7 Cells.
    Autorzy:
    Fiszer A, Wroblewska JP, Nowak BM, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Genes (Basel) (rok: 2016, tom: 7, strony: 132), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/genes7120132 - link do publikacji
  6. RNA FISH for detecting expanded repeats in human diseases.
    Autorzy:
    Urbanek MO, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2016, tom: 98, strony: 115-23), Wydawca: ELSEVIER- Academic Press INC Elsevier Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ymeth.2015.11.017 - link do publikacji
  7. Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents
    Autorzy:
    Martyna O. Urbanek, Agnieszka Fiszer, Wlodzimierz J. Krzyzosiak
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: FRONTIERS MEDIA SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fncel.2017.00082 - link do publikacji
  8. Artificial miRNAs targeting CAG repeat expansion in ORFs cause rapid deadenylation and translation inhibition of mutant transcripts
    Autorzy:
    Adam Ciesiolka, Anna Stroynowska-Czerwinska, Paweł Joachimiak, Agata Ciolak, Emilia Kozlowska, Michal Michalak, Magdalena Dabrowska, Marta Olejniczak, Katarzyna D Raczynska, Dominika Zielinska, Magdalena Wozna-Wysocka, Wlodzimierz J Krzyzosiak, Agnieszka Fiszer
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2021, tom: 78, strony: 1577-1596), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-020-03596-7 - link do publikacji
  9. Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases.
    Autorzy:
    Jazurek M, Ciesiolka A, Starega-Roslan J, Bilinska K, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050-9070), Wydawca: OXFORD UNIVERSITY PRESS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw803 - link do publikacji
  1. Mutant HTT mRNA as therapeutic target in allele-selective CAG repeat-directed RNAi approach and putative pathogenic agent in HD
    Autorzy:
    Agnieszka Fiszer, Łukasz Przybył, Magdalena Jazurek-Ciesiołka, Adam Ciesiołka, Paweł Joachimiak, Emilia Kozłowska, Michał Michalak, Paweł M. Świtoński, Magdalena Woźna-Wysocka, Agata Łużna, Włodzimierz J. Krzyżosiak
    Konferencja:
    EHDN Plenary Meeting (rok: 2018, ), Wydawca: Journal of Neurology Neurosurgery and Psychiatry
    Data:
    konferencja 14-16.09.2018
    Status:
    Opublikowana