Mechanizmy selektywnego wyciszania genów chorób poliglutaminowych przez nietypowe siRNA
2014/15/B/NZ1/01880
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ2_3: Proteomika
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel
NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca
Instytut Chemii Bioorganicznej PAN
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs
OPUS 8 – ogłoszony 2014-09-15
- Przyznana kwota
- 1 476 600 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2015-07-15
- Zakończenie projektu
- 2019-07-14
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Analizator RNA, DNA i białek.. Za kwotę 100 000 PLN
- Aparat do elektroforezy i transferu białek. Za kwotę 10 000 PLN
- Kolektor frakcji. Za kwotę 15 000 PLN
- Komputer z oprogramowaniem (3 szt.). Za kwotę 15 000 PLN
- Licznik komórek. Za kwotę 15 000 PLN
- Mini wirówki 2 sztuki.
- Pompa do odsysania płynów przy hodowlach komórkowych. Za kwotę 5 000 PLN
- Sonikator.
- Termomikser. Za kwotę 5 000 PLN
- Zamrażarka niskotemperaturowa -80st.C. Za kwotę 35 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (9)
-
A potential role of extended simple sequence repeats in competing endogenous RNA crosstalk
- Autorzy:
- Tomasz M. Witkoś, Włodzimierz J. Krzyżosiak, Agnieszka Fiszer, Edyta Kościańska
- Czasopismo:
- RNA Biology (rok: 2018, tom: 15, strony: 1399-1409), Wydawca: Talor&Francis
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1080/15476286.2018.1536593 – link do publikacji
-
Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents
- Autorzy:
- Martyna O. Urbanek, Agnieszka Fiszer, Wlodzimierz J. Krzyzosiak
- Czasopismo:
- Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: FRONTIERS MEDIA SA
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fncel.2017.00082 – link do publikacji
-
Artificial miRNAs targeting CAG repeat expansion in ORFs cause rapid deadenylation and translation inhibition of mutant transcripts
- Autorzy:
- Adam Ciesiolka, Anna Stroynowska-Czerwinska, Paweł Joachimiak, Agata Ciolak, Emilia Kozlowska, Michal Michalak, Magdalena Dabrowska, Marta Olejniczak, Katarzyna D Raczynska, Dominika Zielinska, Magdalena Wozna-Wysocka, Wlodzimierz J Krzyzosiak, Agnieszka Fiszer
- Czasopismo:
- Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2021, tom: 78, strony: 1577-1596), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00018-020-03596-7 – link do publikacji
-
Nucleotide sequence of miRNA precursor contributes to cleavage site selection by Dicer.
- Autorzy:
- Starega-Roslan J, Galka-Marciniak P, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 10939-51), Wydawca: OXFORD UNIVERSITY PRESS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkv968 – link do publikacji
-
RNA FISH for detecting expanded repeats in human diseases.
- Autorzy:
- Urbanek MO, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Methods (rok: 2016, tom: 98, strony: 115-23), Wydawca: ELSEVIER- Academic Press INC Elsevier Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.ymeth.2015.11.017 – link do publikacji
-
siRNA release from pri-miRNA scaffolds is controlled by the sequence and structure of RNA.
- Autorzy:
- Galka-Marciniak P, Olejniczak M, Starega-Roslan J, Szczesniak MW, Makalowska I, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms (rok: 2016, tom: 1859, strony: 639-49), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE BV
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.bbagrm.2016.02.014 – link do publikacji
-
Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases.
- Autorzy:
- Jazurek M, Ciesiolka A, Starega-Roslan J, Bilinska K, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050-9070), Wydawca: OXFORD UNIVERSITY PRESS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/nar/gkw803 – link do publikacji
-
Mutant CAG Repeats Effectively Targeted by RNA Interference in SCA7 Cells.
- Autorzy:
- Fiszer A, Wroblewska JP, Nowak BM, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Genes (Basel) (rok: 2016, tom: 7, strony: 132), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/genes7120132 – link do publikacji
-
Silencing of genes responsible for polyQ diseases using chemically modified single-stranded siRNAs.
- Autorzy:
- Fiszer A, Ellison-Klimontowicz ME, Krzyzosiak WJ
- Czasopismo:
- Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63, strony: 759-764), Wydawca: Polish Biochemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.18388/abp.2016_1336 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
-
Mutant HTT mRNA as therapeutic target in allele-selective CAG repeat-directed RNAi approach and putative pathogenic agent in HD
- Autorzy:
- Agnieszka Fiszer, Łukasz Przybył, Magdalena Jazurek-Ciesiołka, Adam Ciesiołka, Paweł Joachimiak, Emilia Kozłowska, Michał Michalak, Paweł M. Świtoński, Magdalena Woźna-Wysocka, Agata Łużna, Włodzimierz J. Krzyżosiak
- Konferencja:
- EHDN Plenary Meeting (rok: 2018, strony: A89), Wydawca: Journal of Neurology Neurosurgery and Psychiatry
- Data:
- konferencja 14-16.09.2018
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji