Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza zmian profilu transkryptomicznego mięśni szkieletowych i krwi u koni czystej krwi arabskiej, pod wpływem treningu wyścigowego, w oparciu o metodę sekwencjonowania następnej generacji - RNA-seq

2014/15/D/NZ9/05256

Słowa kluczowe:

konie czystej krwi arabskiej RNA-seq transkryptom mięśnie szkieletowe krew marker selekcyjny

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ9_2: Naukowe podstawy zootechniki

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Instytut Zootechniki - Państwowy Instytut Badawczy

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Katarzyna Ropka-Molik 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA 8 - ogłoszony 2014-09-15

Przyznana kwota: 694 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-07-24

Zakończenie projektu: 2019-07-23

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (13)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (15)
  1. The expression profile of genes involved in osteoclastogenesis detected in whole blood of Arabian horses during 3 years of competing at race track IF: 1,751
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Ropka-Molik K., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M.
    Czasopismo:
    Research in Veterinary Science (rok: 2019, tom: 123, strony: 59-64), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.rvsc.2018.12.013 - link do publikacji
  2. Variation in the SLC16A1 and the ACOX1 genes is associated with gallop racing performance in Arabian horses IF: 1,1
    Autorzy:
    Fontane M., Todd E., Drabbe A., Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Myćka G., Velie B.D.,
    Czasopismo:
    Journal of Equine Veterinary Science (rok: 2020, tom: 93, strony: 44930), Wydawca: ScienceDirect
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jevs.2020.103202 - link do publikacji
  3. The blood and muscle expression pattern of equine TCAP gene during the race track training of Arabian horses IF: 1,832
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Szmatoła T., Łątka J., Długosz B., Ropka-Molik K.,
    Czasopismo:
    Animals (rok: 2019, tom: 9, strony: 574), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ani9080574 - link do publikacji
  4. Transcriptomic hallmarks of bone remodelling revealed by RNA-Seq profiling in blood of Arabian horses during racing training regime IF: 2,498
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Ropka-Molik K., Piórkowska K., Żukiowski K., Bugno-Poniewierska M.,
    Czasopismo:
    Gene (rok: 2018, tom: 676, strony: 256-262), Wydawca: ElsevierB.V.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.gene.2018.07.040. - link do publikacji
  5. Variability of ACOX1 gene polymorphisms across different horse breeds in regard to selection pressure IF: 2,323
    Autorzy:
    Myćka G., Musiał A.D., Stefaniuk-Szmukier M., Piórkowska K., Ropka-Molik K.,
    Czasopismo:
    Animals (rok: 2020, tom: animals-870235, strony: ), Wydawca: MDPI
    Status:
    Złożona
  6. ACTN3 genotype distribution across horses representing different utility types and breeds IF: 2,107
    Autorzy:
    Musial AD, Ropka-Molik K., Piórkowska K., Jaworska J., Stefaniuk-Szmukier M.,
    Czasopismo:
    Molecular Biology Reports (rok: 2019, tom: 46, strony: 5795–5803), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11033-019-05013-0 - link do publikacji
  7. Analysis of polymorphisms in the equine MSTN gene in Polish populations of horse breeds IF: 1,293
    Autorzy:
    Stefaniuk M., Ropka-Molik K., Piórkowska K., Kulisa M., Podstawski Z.
    Czasopismo:
    Livestock Science (rok: 2016, tom: 187, strony: 151-157), Wydawca: ElsevierB.V.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.livsci.2016.03.012 - link do publikacji
  8. Exercise-induced modification of the skeletal muscle transcriptome in Arabian horses IF: 2,986
    Autorzy:
    Ropka-Molik K, Stefaniuk-Szmukier M, Z Ukowski K, Piórkowska K, Bugno-Poniewierska M
    Czasopismo:
    Physiological Genomics (rok: 2017, tom: 49(6), strony: 318-326), Wydawca: American Physiological Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1152/physiolgenomics.00130.2016 - link do publikacji
  9. The use of the SLC16A1 gene as a potential marker to predict race performance in Arabian horses IF: 2,547
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Szmatoła T., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M.,
    Czasopismo:
    BMC Genectics (rok: 2019, tom: 0,884027777777778, strony: 44935), Wydawca: BioMed Central Ltd , Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12863-019-0774-4 - link do publikacji
  10. Molecular characterization of the apoptosis-related SH3RF1 and SH3RF2 genes and their association with exercise performance in Arabian horses IF: 1,958
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Piórkowska K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M.,
    Czasopismo:
    BMC Veterinary Research (rok: 2018, tom: 14, strony: 237), Wydawca: BioMedCentral
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12917-018-1567-0 - link do publikacji
  11. Sequence analysis and expression profiling of the equine ACTN3 gene during exercise in Arabian horses IF: 2,638
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Musiał A. D., Piórkowska K., Szmatoła T.,
    Czasopismo:
    Gene (rok: 2019, tom: 685, strony: 149-155), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  12. The Genetics of Racing Performance in Arabian Horses IF: 2,303
    Autorzy:
    K. Ropka-Molik, M. Stefaniuk-Szmukier, A. D. Musiał, B. D. Velie
    Czasopismo:
    International Journal of Genomics (rok: 2019, tom: ID 9013239, strony: 44934), Wydawca: Hindawi
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1155/2019/9013239 - link do publikacji
  13. Transcriptome profiling of Arabian horse blood during training regimens IF: 2,266
    Autorzy:
    Ropka-Molik K, Stefaniuk-Szmukier M, Żukowski K, Piórkowska K, Gurgul A, Bugno-Poniewierska M.
    Czasopismo:
    BMC Genetics (rok: 2017, tom: 18(1), strony: 31), Wydawca: BioMedCentral
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12863-017-0499-1 - link do publikacji
  1. Regulation of Transposable Elements by exercise induced stres in racing Arabian horses during race track performance reveal by RNA-seq.
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Ropka-Molik K., Żukowski K., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M
    Konferencja:
    Dorothy Russell Havemeyer 12th International Horse Genome Workshop (rok: 2018, ), Wydawca: Published for the Stichting International Foundation for Animal Genetics
    Data:
    konferencja 12-15 wrzesień
    Status:
    Opublikowana
  2. Genome wide recognition and analysis of long non-coding RNAs in Arabian horses transcriptome
    Autorzy:
    Żukowski, K., Stefaniuk-Szmukier, M., Ropka-Molik, K., Bugno-Poniewierska, M
    Konferencja:
    69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP) (rok: 2018, ), Wydawca: Wageningen Academic Publishers
    Data:
    konferencja 27-31 sierpnia
    Status:
    Opublikowana
  3. Identification of polymorphisms within ACTN3 locus in Equus caballus
    Autorzy:
    Ropka-Molik, K., Musiał, A.D., Stefaniuk-Szmukier, M., Szmatoła, T., Bugno-Poniewierska, M.
    Konferencja:
    69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP) (rok: 2018, ), Wydawca: Wageningen Academic Publishers
    Data:
    konferencja 27-31 Sierpnia
    Status:
    Opublikowana
  4. The expression pattern of ACTN3 gene during training regimen in Arabian horses
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Musiał A.D., Stefaniuk-Szmukier M., Piórkowska K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M.,
    Konferencja:
    1st Animal Genetics and Genomics conference (rok: 2018, ), Wydawca: University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Zakład Poligraficzny , 10-957 Olsztyn, Heweliusza st.3
    Data:
    konferencja 2-4 Lipca
    Status:
    Opublikowana
  5. The expression profile of VAV3 gene in whole blood of Arabian horses during competing at race track
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier, M.,, Ropka-Molik, K.,, Piórkowska, K., Bugno-Poniewierska, M.
    Konferencja:
    69th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP) (rok: 2018, ), Wydawca: Wageningen Academic Publishers
    Data:
    konferencja 27-31 Sierpnia
    Status:
    Opublikowana
  6. Exercise regulation of genes belonging to FoxO signaling pathway in Arabian horse blood tissue
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Szmukier-Stefaniuk M., Piórkowska K., Żukowski K.,
    Konferencja:
    V Polski Kongres Genetyki (rok: 2016, ), Wydawca: Materiały konferencyjne Polskiego Towarzystwa Genetycznego
    Data:
    konferencja 19-22.09
    Status:
    Opublikowana
  7. Influence of exercise on genes expression associated with lipid metabolism in Arabian horse blood
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Ropka-Molik K., Piórkowska K., Żukowski K., Bugno-Poniewierska M.
    Konferencja:
    V Polski Kongres Genetyki (rok: 2016, ), Wydawca: Materiały konferencyjne Polskiego Towarzystwa Genetycznego
    Data:
    konferencja 19-22.09
    Status:
    Opublikowana
  8. Major and candidate genes as a genetic markers in horses' selection
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M.
    Konferencja:
    1st Animal Genetics and Genomics conference (rok: 2018, ), Wydawca: University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Zakład Poligraficzny , 10-957 Olsztyn, Heweliusza st.3
    Data:
    konferencja 2-4 Lipiec
    Status:
    Opublikowana
  9. The most over-represented molecular pathways regulated during training in Arabian horse muscle tissue
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Żukowski K., Piórkowska K.
    Konferencja:
    36 th International Society for Animal Genetics: ISAG (rok: 2017, ), Wydawca: International Society for Animal Genetics
    Data:
    konferencja 16-21.07.2017
    Status:
    Opublikowana
  10. Exercise-related modification of the PLIN2 and FASN genes expression in Arabian horses skeletal muscle
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Żukowski K., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M.,
    Konferencja:
    6th Central European Congress of Life Science Eurobiotech (rok: 2017, ), Wydawca: Folia Biologica
    Data:
    konferencja 11-14.09.2017
    Status:
    Opublikowana
  11. Training-inducted modification of apoptosis related genes in Arabian horses during flat-racing schedule
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Piórkowska K., Musial AD, Stefaniuk-Szmukier M.,
    Konferencja:
    37th International Society for Animal Genetics Conference (rok: 2019, ), Wydawca: International Society for Animal Genetics
    Data:
    konferencja 7-12.07
    Status:
    Opublikowana
  12. Transcriptome profiling and comparison of whole blood and gluteus medius muscle of Arabian horses during 24 weeks race training
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M., Ropka-Molik K., Żukowski K., Piórkowska K., Bugno-Poniewierska M,
    Konferencja:
    36 th International Society for Animal Genetics: ISAG (rok: 2017, ), Wydawca: International Society for Animal Genetics
    Data:
    konferencja 16-21.07.2017
    Status:
    Opublikowana
  13. Potencjał wyścigowy koni arabskich a markery genetyczne
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M.
    Konferencja:
    Konferencja "Badania naukowe w praktyce hodowlanej koni – nowoczesne narzędzia dla hodowców" (rok: 2017, ), Wydawca: Instytut Zootechniki Państwowy Instytut Badawczy
    Data:
    konferencja 12.12.2017
    Status:
    Opublikowana
  14. Preliminary study of training induced changes in long transposable elements (LTEs) expression in blood of Arabian horses
    Autorzy:
    Stefaniuk-Szmukier M, Ropka-Molik K, Żukowski K, Piórkowska K, Monika Bugno-Poniewierska M,
    Konferencja:
    6th Central European Congress of Life Science Eurobiotech (rok: 2017, ), Wydawca: Folia Biologica
    Data:
    konferencja 11-14.09.2017
    Status:
    Opublikowana
  15. Transcriptome profiling of Arabian horses blood tissue during training regime using Next Generation Sequencing method
    Autorzy:
    Ropka-Molik K., Stefaniuk-Szmukier M., Żukowski K., Piórkowska K., Gurgul A.,
    Konferencja:
    35th International Society for Animal Genetics Conference; Salt Lake City, USA (rok: 2016, ), Wydawca: Journal of Animal Science
    Data:
    konferencja 23-27.07
    Status:
    Opublikowana