Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

CDKG/Ph1: czy istnieje uniwersalny mechanizm regulujący stabilność genomu u traw?

2014/14/M/NZ2/00519

Słowa kluczowe:

allopoliploidia Brachypodium hybridum CDK chromosomy homeologiczne cytogenetyka molekularna kontrola parowania chromosomów locus Ph1 mutanty organizm modelowy pszenica trawy

Deskryptory:

  • NZ2_5: Cytogenetyka
  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ3_1: Biologia komórki

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Śląski w Katowicach, Wydział Nauk Przyrodniczych

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Robert Hasterok 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: HARMONIA 6 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 1 995 175 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-05-08

Zakończenie projektu: 2019-11-07

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (14)
  1. Gradual polyploid genome evolution revealed by a pan-genomic analysis of Brachypodium hybridum and its diploid progenitors IF: 12,121
    Autorzy:
    Sean P. Gordon, Bruno Contreras-Moreira, Joshua J. Levy, Armin Djamei, Angelika Czedik-Eysenberg, Virginia S. Tartaglio, Adam Session, Joel Martin, Amy Cartwright, Andrew Katz, Vasanth R. Singan, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Vinh Ha Dinh-Thi, Boulos Chalhoub, Antonio Diaz-Perez, Ruben Sancho, Joanna Lusinska, Elzbieta Wolny, Candida Nibau, John H. Doonan, Luis Mur, Chris Plott, Jerry Jenkins, Samuel P. Hazen, Scott J. Lee, Shenquaing Shu, David Goodstein, Daniel Rokhsar, Jeremy Schmutz, Robert Hasterok, Pilar Catalan, John P. Vogel
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2020, tom: 11, strony: 3670 (1-16)), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-020-17302-5 - link do publikacji
  2. Plant Cell and Organism Development IF: 4,556
    Autorzy:
    Robert Hasterok, Alexander Betekhtin
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 5636 (1-10)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21165636 - link do publikacji
  3. Spatial distribution of selected chemical cell wall components in the embryogenic callus of Brachypodium distachyon IF: 2,806
    Autorzy:
    Alexander Betekhtin, Magdalena Rojek, Anna Milewska-Hendel, Robert Gawecki, Jagna Karcz, Ewa Kurczynska, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    PLos One (rok: 2016, tom: 11, strony: e0167426 (1-20)), Wydawca: Public Library od Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0167426 - link do publikacji
  4. 5-azacitidine induces cell death in a tissue culture of Brachypodium distachyon IF: 4,183
    Autorzy:
    Alexander Betekhtin, Anna Milewska-Hendel, Lukasz Chajec, Magdalena Rojek, Katarzyna Nowak, Jolanta Kwasniewska, Elzbieta Wolny, Ewa Kurczynska, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 1806 (1-21)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19061806 - link do publikacji
  5. Chromosome identification and reconstruction of evolutionary rearrangements in Brachypodium distachyon, B. stacei and B. hybridum IF: 3,454
    Autorzy:
    Joanna Lusinska, Joanna Majka, Alexander Betekhtin, Karolina Susek, Elzbieta Wolny, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    Annals of Botany (rok: 2018, tom: 122, strony: 445–459), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/aob/mcy086 - link do publikacji
  6. Comparatively barcoded chromosomes of Brachypodium perennials tell the story of their karyotype structure and evolution IF: 4,556
    Autorzy:
    Joanna Lusinska, Alexander Betekhtin, Diana Lopez-Alvarez, Pilar Catalan, Glyn Jenkins, Elzbieta Wolny, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2019, tom: 20, strony: 3390 (1-19)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms20225557 - link do publikacji
  7. A CRISPR/Cas9-based mutagenesis protocol for Brachypodium distachyon and its allopolyploid relative, Brachypodium hybridum IF: 4,402
    Autorzy:
    Karolina Hus, Alexander Betekhtin, Artur Pinski, Magdalena Rojek-Jelonek, Ewa Grzebelus, Candida Nibau, Mingjun Gao, Katja E. Jaeger, Glyn Jenkins, John H. Doonan, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    Frontiers in Plant Science (rok: 2020, tom: 11, strony: 614 (1-21)), Wydawca: Frontiers Media S.A.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fpls.2020.00614 - link do publikacji
  8. Hydroxyproline-rich glycoproteins as markers of temperature stress in the leaves of Brachypodium distachyon IF: 4,556
    Autorzy:
    Artur Pinski, Alexander Betekhtin, Katarzyna Sala, Kamila Godel-Jedrychowska, Ewa Kurczynska, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2019, tom: 20, strony: 2571 (1-21)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms20102571 - link do publikacji
  9. Progressive refinement of the karyotyping of Brachypodium genomes IF: 8,512
    Autorzy:
    Robert Hasterok, Kai Wang, Glyn Jenkins
    Czasopismo:
    New Phytologist (rok: 2020, tom: 227, strony: 1668-1675), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/nph.16342 - link do publikacji
  10. In vitro Tissue Culture in Brachypodium: applications and gaps IF: 4,556
    Autorzy:
    Alexander Betekhtin, Karolina Hus, Magdalena Rojek, Ewa Kurczynska, Candida Nibau, John H. Doonan, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1037 (1-16)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21031037 - link do publikacji
  11. Ribosomal DNA loci derived from Brachypodium stacei are switched off for major parts of the life cycle of Brachypodium hybridum IF: 5,908
    Autorzy:
    Natalia Borowska-Zuchowska, Ewa Robaszkiewicz, Elzbieta Wolny, Alexander Betekhtin, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    Journal of Experimental Botany (rok: 2019, tom: 70, strony: 805–815), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/jxb/ery425 - link do publikacji
  12. CDKG1 is required for meiotic and somatic recombination intermediate processing in Arabidopsis IF: 9,618
    Autorzy:
    Candida Nibau, Andrew Lloyd, Despoina Dadarou, Alexander Betekhtin, Foteini Tsilimigka, Dylan W. Phillips, John H. Doonan
    Czasopismo:
    Plant Cell (rok: 2020, tom: 32, strony: 1308–1322), Wydawca: American Society of Plant Biologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1105/tpc.19.00942 - link do publikacji
  13. Cell wall epitopes and endoploidy as reporters of embryogenic potential in Brachypodium distachyon callus culture IF: 4,183
    Autorzy:
    Alexander Betekhtin, Magdalena Rojek, Katarzyna Nowak, Artur Pinski, Anna Milewska-Hendel, Ewa Kurczynska, John H. Doonan, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 3811 (1-21)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19123811 - link do publikacji
  14. Organ and tissue-specific localisation of selected cell wall epitopes in the zygotic embryo of Brachypodium distachyon IF: 4,183
    Autorzy:
    Alexander Betekhtin, Anna Milewska-Hendel, Joanna Lusinska, Lukasz Chajec, Ewa Kurczynska, Robert Hasterok
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 725 (1-16)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19030725 - link do publikacji