Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Od modelu molekularnego in silico do odpowiedzi komórkowej in vitro. Modyfikowane nukleozydy jako radio- bądź/i fotosensybilizatory uszkodzeń DNA

2014/14/A/ST4/00405

Słowa kluczowe:

modyfikowane nukleozydy radiosensybilizatory fotosensybilizatory podwójne pęknięcia DNA odpowiedż komórkowa terapia przeciwnowotworowa

Deskryptory:

  • ST4_17: Fotochemia
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST4_16: Chemia jądrowa i radiacyjna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Janusz Rak 

Liczba wykonawców projektu: 21

Konkurs: MAESTRO 6 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 3 958 291 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-04-23

Zakończenie projektu: 2021-01-22

Planowany czas trwania projektu: 69 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do pomiarów stężenia tlenu w kulturach komórkowych. Za kwotę 158 000 PLN
  2. Preparatywny system HPLC. Za kwotę 251 000 PLN
  3. System UHPLC. Za kwotę 362 000 PLN
  4. System do liofilizacji z rozpuszczalników niewodnych.
  5. system do oczyszczania wody.
  6. Komora do naświetlań UV. Za kwotę 100 000 PLN
  7. System do analizy Western blot. Za kwotę 12 500 PLN
  8. Inkubator z kontrolą ciśnienia tlenu. Za kwotę 37 000 PLN
  9. Odwrócony mikroskop fluorescencyjny. Za kwotę 122 000 PLN
  10. System elektroforetyczny do sekwencjonowania DNA. Za kwotę 17 000 PLN
  11. Wirówka z chłodzeniem. Za kwotę 16 000 PLN
  12. Cytometr przepływowy. Za kwotę 264 450 PLN
  13. Klaster komputerowy. Za kwotę 350 000 PLN
  14. Komora do napromieniań promieniowaniem X. Za kwotę 320 000 PLN
  15. Niskotemperaturowa zamrażarka. Za kwotę 26 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (16)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. Molecular features of thymidine analogues governing the activity of human thymidine kinase
    Autorzy:
    Karolina Jagiello, Samanta Makurat, Sylwester Pereć, Janusz Rak, Tomasz Puzyn
    Czasopismo:
    Structural Chemistry (rok: 2018, tom: 29, strony: 1367–1374), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11224-018-1124-2 - link do publikacji
  2. The Sequence Dependence of Photoinduced Single Strand Break in 5-Bromo-2′-deoxyuridine Labeled DNA Supports That Electron Transfer Is Responsible for the Damage
    Autorzy:
    Kinga Westphal, Samanta Makurat, Janusz Rak
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2017, tom: 121, strony: 9169−9174), Wydawca: American Chemical Socitey
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.7b07338 - link do publikacji
  3. 5-(N-Trifluoromethylcarboxy)aminouracil as a Potential DNA Radiosensitizer and Its Radiochemical Conversion into N-Uracil-5-yloxamic Acid
    Autorzy:
    Paulina Spisz, Witold Kozak, Lidia Chomicz-Mańka, Samanta Makurat, Karina Falkiewicz, Artur Sikorski, Anna Czaja, Janusz Rak, Magdalena Zdrowowicz
    Czasopismo:
    International Journal o f Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 6352), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21176352 - link do publikacji
  4. 5-Selenocyanatouracil: A Potential Hypoxic Radiosensitizer. Electron Attachment Induced Formation of Selenium Centered Radical
    Autorzy:
    Marta Sosnowska, Samanta Makurat, Magdalena Zdrowowicz, Janusz Rak
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2017, tom: 121, strony: 6139−6147), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.7b03633 - link do publikacji
  5. Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
    Autorzy:
    Paweł Wityk, Miłosz Wieczór, Samanta Makurat, Lidia Chomicz-Mańka, Jacek Czub, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computations (rok: 2017, tom: 13, strony: 6415−6423), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.7b00978 - link do publikacji
  6. Electron-Induced Dissociation of the Potential Radiosensitizer 5‑Selenocyanato-2′-deoxyuridine
    Autorzy:
    Rebecca Meißner, Samanta Makurat, Witold Kozak, Paulo Limão-Vieira, Janusz Rak, Stephan Denifl
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 1274−1282), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.8b11523 - link do publikacji
  7. Electrophilic 5-Substituted Uracils as Potential Radiosensitizers. A DFT Study
    Autorzy:
    Samanta Makurat, Lidia Chomicz-Mańka, Janusz Rak
    Czasopismo:
    ChemPhysChem (rok: 2016, tom: 17, strony: 2572-2578), Wydawca: WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cphc.201600240 - link do publikacji
  8. Low-energy electron-induced decomposition of 5-trifluoromethanesulfonyl-uracil: A potential radiosensitizer
    Autorzy:
    J. Ameixa, E. Arthur-Baidoo, R. Meißner, S. Makurat, W. Kozak, K. Butowska, F. Ferreira da Silva, J. Rak, S. Denifl
    Czasopismo:
    The Journal of Chemical Physics (rok: 2018, tom: 149, strony: 164307), Wydawca: AIP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5050594 - link do publikacji
  9. 5-Selenocyanato and 5-trifluoromethanesulfonyl derivatives of 20-deoxyuridine: synthesis, radiation and computational chemistry as well as cytotoxicity
    Autorzy:
    Samanta Makurat, Magdalena Zdrowowicz, Lidia Chomicz-Mańka, Witold Kozak, Illia E. Serdiuk, Paweł Wityk, Alicja Kawecka, Marta Sosnowska, Janusz Rak
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2018, tom: 8, strony: 21378–21388), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C8RA03172J - link do publikacji
  10. Modifications at the C(5) position of pyrimidine nucleosides
    Autorzy:
    Witold Kozak, Sebastian Demkowicz, Mateusz DasÂko, Janusz Rachon, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Russian Chemical Reviews (rok: 2020, tom: 89, strony: 281-310), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1070/RCR4919 - link do publikacji
  11. Photoinduced electron transfer in 5-bromouracil labeled DNA. A contrathermodynamic mechanism revisited by electron transfer theories
    Autorzy:
    Lorenzo Cupellini, Paweł Wityk, Benedetta Mennucci, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2019, tom: 21, strony: 4387-4393), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8cp07700b - link do publikacji
  12. UV-induced electron transfer between triethylamine and 5-bromo-2'-deoxyuridine. A puzzle concerning the photochemical debromination of labelled DNA
    Autorzy:
    Paweł Wityk, Magdalena Zdrowowicz, Justyna Wiczk and Janusz Rak
    Czasopismo:
    Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis (rok: 2017, tom: 142, strony: 262–269), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jpba.2017.04.044 - link do publikacji
  13. Uracil-5-yl O‑Sulfamate: An Illusive Radiosensitizer. Pitfalls in Modeling the Radiosensitizing Derivatives of Nucleobases
    Autorzy:
    Paulina Spisz, Magdalena Zdrowowicz, Witold Kozak, Lidia Chomicz-Mańka, Karina Falkiewicz, Samanta Makurat, Artur Sikorski, Dariusz Wyrzykowski, Janusz Rak, Eugene Arthur-Baidoo, Patrick Ziegler, Mateus Salomao Rodrigues Costa, and Stephan Denifl
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2020, tom: 124, strony: 5600−5613), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.0c03844 - link do publikacji
  14. 5-Iodo-4-thio-20-Deoxyuridine as a Sensitizer of X-ray Induced Cancer Cell Killing
    Autorzy:
    Samanta Makurat, Paulina Spisz, Witold Kozak, Janusz Rak, Magdalena Zdrowowicz
    Czasopismo:
    International Journal o f Molecular Sciences (rok: 2019, tom: 20, strony: 1308), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms20061308 - link do publikacji
  15. Electron-Induced Decomposition of Uracil-5-yl O-(N,N-dimethylsulfamate): Role of Methylation in Molecular Stability
    Autorzy:
    Eugene Arthur-Baidoo, Karina Falkiewicz, Lidia Chomicz-Mańka, Anna Czaja, Sebastian Demkowicz, Karol Biernacki, Witold Kozak, Janusz Rak, Stephan Denifl
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 2344), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22052344 - link do publikacji
  16. Why Does the Type of Halogen Atom Matter for the Radiosensitizing Properties of 5-Halogen Substituted 4-Thio-20-Deoxyuridines?
    Autorzy:
    Paulina Spisz, Magdalena Zdrowowicz, Samanta Makurat, Witold Kozak, Konrad Skotnicki, Krzysztof Bobrowski, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2019, tom: 24, strony: 2819), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules24152819 - link do publikacji
  1. Consequences of Electron Attachment to Modified Nucleosides Incorporated into DNA
    Autorzy:
    Lidia Chomicz-Mańka, Paweł Wityk, Łukasz Golon, Magdalena Zdrowowicz, Justyna Wiczk, Kinga Westphal, Michał Żyndul, Samanta Makurat, Janusz Rak
    Książka:
    Handbook of Computational Chemistry (rok: 2017, tom: brak, strony: 1895-1916), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. DNA damage radiosensitizers geared towards hydrated electrons
    Autorzy:
    Magdalena Zdrowowicz, Lidia Chomicz-Mańka, Kamila Butowska, Paulina Spisz, Karina Falkiewicz, Anna Czaja, Janusz Rak
    Książka:
    Practical Aspects of Computational Chemistry-V , Wydawca: Springer
    Status:
    Przyjęta do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy