Charakterystyka nowego niezbędnego do życia białka TPR LapB oraz nowego niekodującego RNA, które wspólnie regulują składanie endotoksyny
2013/11/B/NZ2/02641
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_1: Genetyka molekularna
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs
OPUS 6 – ogłoszony 2013-09-16
- Przyznana kwota
- 746 960 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2014-07-09
- Zakończenie projektu
- 2017-07-08
- Planowany czas trwania projektu
- 36 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Mikrowirówka (table-top centrifuge).
- System do elektroforezy dwukierunkowej 2D-PAGE IEF. Za kwotę 55 000 PLN
- Wirówka szybkoobrotowa z chłodzeniem, z rotorem kątowym, adapterami i naczyniami wirowniczymi. Za kwotę 147 000 PLN
- Zamrażarka -80°C ze statywami.
- Zamrażarka laboratoryjna -20°C.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (3)
-
Small regulatory bacterial RNAs regulating the envelope stress response
- Autorzy:
- G. Klein and S. Raina
- Czasopismo:
- Biochemical Society Transactions (rok: 2017, tom: 45, strony: 417-425), Wydawca: Portland Press Biochemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1042/BST20160367 – link do publikacji
-
Multiple transcriptional factors regulate transcription of the rpoE gene in Escherichia coli under different growth conditions and when the lipopolysaccharide biosynthesis is defective
- Autorzy:
- Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz, Buko Lindner and Satish Raina
- Czasopismo:
- The Journal of Biological Chemistry (rok: 2016, tom: 291, strony: 22999-23019), Wydawca: American Society of Biochemistry and Molecular Biology
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M116.748954 – link do publikacji
-
Regulated Control of the Assembly and Diversity of LPS by Noncoding sRNAs
- Autorzy:
- Gracjana Klein and Satish Raina
- Czasopismo:
- BioMed Research International (rok: 2015, tom: 2015, strony: 46038), Wydawca: Hindawi Publication Corporation
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1155/2015/153561 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
-
Regulation of LPS biosynthesis and sensing of LPS defects by the RpoE sigma factor
- Autorzy:
- Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz, Buko Lindner and Satish Raina
- Konferencja:
- 14th Biennial Meeting of the International Endotoxin Innate Immunity Society (rok: 2016, strony: 26), Wydawca: International Endotoxin Innate Immunity Society
- Data:
- konferencja 22-24 September
- Status:
- Opublikowana
-
Novel controls of balanced LPS biosynthesis by LapB, non-coding RNAs and stress responsive envelope biogenesis factors
- Autorzy:
- Satish Raina, Anna Stupak and Gracjana Klein
- Konferencja:
- 14th Biennial Meeting of the International Endotoxin Innate Immunity Society (rok: 2016, strony: 3), Wydawca: International Endotoxin Innate Immunity Society
- Data:
- konferencja 22-24 September
- Status:
- Opublikowana
-
Regulation of LPS composition, biosynthesis and critical checkpoints in its assembly by non-coding regulatory RNAs
- Autorzy:
- S. Raina* and G. Klein
- Konferencja:
- Microbiology and Infections 2017 (rok: 2017, strony: 219), Wydawca: Springer
- Data:
- konferencja 05.03.2017--08.03.2017
- Status:
- Opublikowana
-
Integrated network of different sigma factors, two-component systems and non-coding RNAs that regulate transcription of the rpoE gene encoding ECF sigma factor in Escherichia coli in response to different signals
- Autorzy:
- G. Klein*, A. Stupak, P. Wojtkiewicz, D. Biernacka and S. Raina
- Konferencja:
- Microbiology and Infections 2017 (rok: 2017, strony: 218), Wydawca: Springer
- Data:
- konferencja 05.03.2017-08.03.2017
- Status:
- Opublikowana
-
Regulated assembly of LPS: mechanism of coupling of LPS synthesis and its translocation
- Autorzy:
- Satish Raina, Gracjana Klein
- Konferencja:
- The 6th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (rok: 2014, strony: 21), Wydawca: Pro Science Polska, Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
- Data:
- konferencja 7-10 September
- Status:
- Opublikowana
-
Assembly of LPs in Escherichia coli requires the essential LpaB heat shock protein and its modulation by a new sRNA slrA
- Autorzy:
- Gracjana Klein, Satish Raina
- Konferencja:
- The 6th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (rok: 2014, strony: 71), Wydawca: Pro Science Polska, Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
- Data:
- konferencja 7-10 September
- Status:
- Opublikowana
-
Regulated assembly and diversity of lipopolysaccharide by non-coding sRNAs
- Autorzy:
- Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz and Satish Raina
- Konferencja:
- 81st Harden Conference: RNA and Disease,https://www.biochemistry.org/Events/tabid/379/View/Programme/Filter/64/MeetingNo/81HDN/Default.aspx (rok: 2016, strony: p14), Wydawca: Biochemical Society , London
- Data:
- konferencja 4-7 September
- Status:
- Opublikowana
-
Coordinated assembly of LPS by TPR-containing LapB heat shock protein along with DnaKJ chaperones
- Autorzy:
- Satish Raina, Anna Stupak, Patrycja Gorzelak, Gracjana Klein
- Konferencja:
- The Biology of Molecular Chaperones, EMBO Conference (rok: 2015, strony: p152), Wydawca: EMBO
- Data:
- konferencja 8-13 May
- Status:
- Opublikowana