Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Charakterystyka nowego niezbędnego do życia białka TPR LapB oraz nowego niekodującego RNA, które wspólnie regulują składanie endotoksyny

2013/11/B/NZ2/02641

Słowa kluczowe:

białka z tetratrikopeptydowymi powtórzeniami (TPR) lipopolisacharydy (LPS) endotoksyna lipid A niekodujące RNA CHIR-090 białka transport Lpt transferaza Kdo

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ1_10: Biologia drobnoustrojów

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Satish Raina 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 6 - ogłoszony 2013-09-16

Przyznana kwota: 746 960 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-07-09

Zakończenie projektu: 2017-07-08

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. System do elektroforezy dwukierunkowej 2D-PAGE IEF. Za kwotę 55 000 PLN
  2. Mikrowirówka (table-top centrifuge).
  3. Wirówka szybkoobrotowa z chłodzeniem, z rotorem kątowym, adapterami i naczyniami wirowniczymi. Za kwotę 147 000 PLN
  4. Zamrażarka -80°C ze statywami.
  5. Zamrażarka laboratoryjna -20°C.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
  1. Multiple transcriptional factors regulate transcription of the rpoE gene in Escherichia coli under different growth conditions and when the lipopolysaccharide biosynthesis is defective IF: 4,258
    Autorzy:
    Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz, Buko Lindner and Satish Raina
    Czasopismo:
    The Journal of Biological Chemistry (rok: 2016, tom: 291, strony: 22999-23019), Wydawca: American Society of Biochemistry and Molecular Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M116.748954 - link do publikacji
  2. Small regulatory bacterial RNAs regulating the envelope stress response IF: 2,765
    Autorzy:
    G. Klein and S. Raina
    Czasopismo:
    Biochemical Society Transactions (rok: 2017, tom: 45, strony: 417-425), Wydawca: Portland Press Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1042/BST20160367 - link do publikacji
  3. Regulated Control of the Assembly and Diversity of LPS by Noncoding sRNAs IF: 1,579
    Autorzy:
    Gracjana Klein and Satish Raina
    Czasopismo:
    BioMed Research International (rok: 2015, tom: 2015, strony: 44577), Wydawca: Hindawi Publication Corporation
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1155/2015/153561 - link do publikacji
  4. Regulated Control of the Assembly and Diversity of LPS by Noncoding sRNAs IF: 2,134
    Autorzy:
    Gracjana Klein and Satish Raina
    Czasopismo:
    BioMed Research International (rok: 2015, tom: 2015, strony: 44577), Wydawca: Hindawi Publication Corporation
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1155/2015/153561 - link do publikacji
  1. Assembly of LPs in Escherichia coli requires the essential LpaB heat shock protein and its modulation by a new sRNA slrA
    Autorzy:
    Gracjana Klein, Satish Raina
    Konferencja:
    The 6th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (rok: 2014, ), Wydawca: Pro Science Polska, Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 7-10 September
    Status:
    Opublikowana
  2. Regulated assembly of LPS: mechanism of coupling of LPS synthesis and its translocation
    Autorzy:
    Satish Raina, Gracjana Klein
    Konferencja:
    The 6th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates (rok: 2014, ), Wydawca: Pro Science Polska, Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 7-10 September
    Status:
    Opublikowana
  3. Regulation of LPS composition, biosynthesis and critical checkpoints in its assembly by non-coding regulatory RNAs
    Autorzy:
    S. Raina* and G. Klein
    Konferencja:
    Microbiology and Infections 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 05.03.2017--08.03.2017
    Status:
    Opublikowana
  4. Novel controls of balanced LPS biosynthesis by LapB, non-coding RNAs and stress responsive envelope biogenesis factors
    Autorzy:
    Satish Raina, Anna Stupak and Gracjana Klein
    Konferencja:
    14th Biennial Meeting of the International Endotoxin Innate Immunity Society (rok: 2016, ), Wydawca: International Endotoxin Innate Immunity Society
    Data:
    konferencja 22-24 September
    Status:
    Opublikowana
  5. Regulation of LPS biosynthesis and sensing of LPS defects by the RpoE sigma factor
    Autorzy:
    Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz, Buko Lindner and Satish Raina
    Konferencja:
    14th Biennial Meeting of the International Endotoxin Innate Immunity Society (rok: 2016, ), Wydawca: International Endotoxin Innate Immunity Society
    Data:
    konferencja 22-24 September
    Status:
    Opublikowana
  6. Coordinated assembly of LPS by TPR-containing LapB heat shock protein along with DnaKJ chaperones
    Autorzy:
    Satish Raina, Anna Stupak, Patrycja Gorzelak, Gracjana Klein
    Konferencja:
    The Biology of Molecular Chaperones, EMBO Conference (rok: 2015, ), Wydawca: EMBO
    Data:
    konferencja 8-13 May
    Status:
    Opublikowana
  7. Integrated network of different sigma factors, two-component systems and non-coding RNAs that regulate transcription of the rpoE gene encoding ECF sigma factor in Escherichia coli in response to different signals
    Autorzy:
    G. Klein*, A. Stupak, P. Wojtkiewicz, D. Biernacka and S. Raina
    Konferencja:
    Microbiology and Infections 2017 (rok: 2017, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 05.03.2017-08.03.2017
    Status:
    Opublikowana
  8. Regulated assembly and diversity of lipopolysaccharide by non-coding sRNAs
    Autorzy:
    Gracjana Klein, Anna Stupak, Daria Biernacka, Pawel Wojtkiewicz and Satish Raina
    Konferencja:
    81st Harden Conference: RNA and Disease,https://www.biochemistry.org/Events/tabid/379/View/Programme/Filter/64/MeetingNo/81HDN/Default.aspx (rok: 2016, ), Wydawca: Biochemical Society , London
    Data:
    konferencja 4-7 September
    Status:
    Opublikowana