Projekty finansowane przez NCN
"From junk to treasure" - funkcjonalna ewolucja retrogenów
2013/11/B/NZ2/02598
Słowa kluczowe:
genomika ewolucyjna retrogeny analiza ekspresji przewidywanie funkcji genów
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs: OPUS 6 - ogłoszony 2013-09-16
Przyznana kwota: 697 600 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-07-01
Zakończenie projektu: 2018-07-09
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Komputer. Za kwotę 6 000 PLN
- rotator, talerz, vortex mixer. Za kwotę 3 206 PLN
- chłodziarko-zamrażarka.
- kuchenka mikrofalowa.
- Termocykler. Za kwotę 60 000 PLN
- blok grzejny.
- monitor do komputera.
- wirówka.
- zamrażarka.
- Drukarka sieciowa - urządzenie wielofunkcyjne. Za kwotę 5 000 PLN
- Waga laboratoryjna.
- serwer plików z dyskami.
- wytrząsarka.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (5)
- Protein-coding genes' retrocopies and their functionsAutorzy:Kubiak MR., Makałowska I.Czasopismo:Viruses (rok: 2017, tom: 13;9(4), strony: e80), Wydawca: MDPI AGStatus:OpublikowanaDoi:http://www.mdpi.com/1999-4915/9/4/80 - link do publikacji
- Complex analysis of retroposed genes' contribution to human genome, proteome and transcriptomeAutorzy:Magdalena Regina Kubiak, Michał Wojciech Szcześniak, Izabela MakałowskaCzasopismo:Genes (rok: 2020, tom: 11(5), strony: 542), Wydawca: MDPIStatus:OpublikowanaDoi:10.3390/genes11050542 - link do publikacji
- Inter-population Differences in Retrogene Loss and Expression in HumansAutorzy:Kabza, M., M. R. Kubiak, A. Danek, W. Rosikiewicz, S. Deorowicz, A. Polanski and I. MakalowskaCzasopismo:PLoS Genetics (rok: 2015, tom: 11, strony: e1005579), Wydawca: PLOSStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pgen.1005579 - link do publikacji
- Retroposition as a source of antisense long non-coding RNAs with possible regulatory functions.Autorzy:Bryzghalov O, Szcześniak MW, Makałowska I.Czasopismo:Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63(4), strony: 825-833), Wydawca: The Journal of the Polish Biochemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.18388/abp.2016_1354 - link do publikacji
- RetrogeneDB – a database of plant and animal retrocopiesAutorzy:Rosikiewicz W., Kabza M., Kosiński J., Ciomborowska J., Kubiak RM., Makałowska ICzasopismo:Database - The Journal of Biological Databases and Curation (rok: 2017, tom: 2017, strony: 0), Wydawca: OXFORD UNIV PRESSStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/database/bax038 - link do publikacji