Projekty finansowane przez NCN
Wpływ analogów ppGpp na polimerazę RNA w aspekcie prokariotycznych i eukariotycznych czynników transkrypcyjnych
2013/10/E/NZ1/00657
Słowa kluczowe:
polimeraza RNA ppGpp transkrypcja
Deskryptory:
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs: SONATA BIS 3 - ogłoszony 2013-06-14
Przyznana kwota: 1 463 820 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-06-05
Zakończenie projektu: 2019-06-04
Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Spektrofotometr. Za kwotę 22 000 PLN
- Wirówka stołowa z chłodzeniem o dużej mocy przerobowej. Za kwotę 42 000 PLN
- Zestaw komputerowy: komputer stacjonarny z kolorową drukarką i skanerem. Za kwotę 6 500 PLN
- mini-autoklaw. Za kwotę 19 500 PLN
- Aparat do elektroforezy poliakrylamidowej białek. Za kwotę 3 200 PLN
- Termocykler. Za kwotę 44 000 PLN
- aparat do horyzontalnej elektroforezy agarozowej. Za kwotę 6 000 PLN
- mikrowirówka. Za kwotę 15 000 PLN
- termoblok. Za kwotę 9 000 PLN
- termoblok z opcją wytrząsania. Za kwotę 12 000 PLN
- mikrowirówka z chłodzeniem. Za kwotę 22 000 PLN
- zasilacz. Za kwotę 15 000 PLN
- system do dokumentacji płytek TLC. Za kwotę 61 500 PLN
- wytrząsarka wodna. Za kwotę 40 000 PLN
- Łaźnia wodna. Za kwotę 2 900 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (5)
- Estimates of RelSeq, Mesh1, and SAHMex Hydrolysis of (p)ppGpp and (p)ppApp by Thin Layer Chromatography and NADP/NADH Coupled AssaysAutorzy:Katarzyna Potrykus, Nathan E. Thomas, Bożena Bruhn-Olszewska, Michał Sobala, Maciej Dylewski, Tamara James and Michael CashelCzasopismo:Frontiers in Microbiology (rok: 2020, tom: 11, strony: 45303), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:OpublikowanaDoi:10.3389/fmicb.2020.581271 - link do publikacji
- From (p)ppGpp to (pp)pGpp: Characterization of Regulatory Effects of pGpp Synthesized by the Small Alarmone Synthetase of Enterococcus faecalis.Autorzy:Gaca AO, Kudrin P, Colomer-Winter C, Beljantseva J, Liu K, Anderson B, Wang JD, Rejman D, Potrykus K, Cashel M, Hauryliuk V, Lemos JA.Czasopismo:Journal of Bacteriology (rok: 2015, tom: 197, strony: 2908-19), Wydawca: American Society for MicrobiologyStatus:OpublikowanaDoi:10.1128/JB.00324-15 - link do publikacji
- Methylobacterium extorquens RSH enzyme synthesizes (p)ppGpp and pppApp in vitro and in vivo, and leads to discovery of pppApp synthesis in Escherichia coli.Autorzy:Sobala M, Bruhn-Olszewska B, Cashel M, Potrykus KCzasopismo:Frontiers in Microbiology (rok: 2019, tom: 10, strony: 45304), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:OpublikowanaDoi:10.3389/fmicb.2019.00859 - link do publikacji
- 50th anniversary of discovering "magic spots" – the latest advances in (p)ppGpp researchAutorzy:Dylewski M, Sobala M, Bruhn-Olszewska B, Potrykus KCzasopismo:Postępy Biochemii (rok: 2018, tom: 64 (1), strony: 45299), Wydawca: Polskie Towarzystwo BiochemiczneStatus:OpublikowanaDoi:brak - link do publikacji
- Structure-function comparisons of (p)ppApp vs (p)ppGpp for Escherichia coli RNA polymerase binding sites and for rrnB P1 promoter regulatory responses in vitro.Autorzy:Bruhn-Olszewska B, Molodtsov V, Sobala M, Dylewski M, Murakami KS, Cashel M, Potrykus K.Czasopismo:Biochimica Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms (rok: 2018, tom: 1861(8), strony: 731-742), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.bbagrm.2018.07.005 - link do publikacji