Projects funded by the NCN
The effect of ppGpp analogs on RNA polymerase in the aspect of prokariotic and eukariotic transcriptional factors.
2013/10/E/NZ1/00657
Keywords:
RNA polymerase ppGpp transcription
Descriptors:
- NZ1_1: Molecular biology
- NZ1_10: Microbiology
Panel:
NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology
Host institution :
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii
woj. pomorskie
Principal investigator (from the host institution):
Number of co-investigators in the project: 5
Call: SONATA BIS 3 - announced on 2013-06-14
Amount awarded: 1 463 820 PLN
Project start date (Y-m-d): 2014-06-05
Project end date (Y-m-d): 2019-06-04
Project duration:: 60 months (the same as in the proposal)
Project status: Project settled
Equipment purchased [PL]
- aparat do horyzontalnej elektroforezy agarozowej (6 000 PLN)
- mikrowirówka z chłodzeniem (22 000 PLN)
- mini-autoklaw (19 500 PLN)
- Wirówka stołowa z chłodzeniem o dużej mocy przerobowej (42 000 PLN)
- wytrząsarka wodna (40 000 PLN)
- Spektrofotometr (22 000 PLN)
- Zestaw komputerowy: komputer stacjonarny z kolorową drukarką i skanerem (6 500 PLN)
- mikrowirówka (15 000 PLN)
- system do dokumentacji płytek TLC (61 500 PLN)
- termoblok (9 000 PLN)
- Łaźnia wodna (2 900 PLN)
- termoblok z opcją wytrząsania (12 000 PLN)
- Aparat do elektroforezy poliakrylamidowej białek (3 200 PLN)
- Termocykler (44 000 PLN)
- zasilacz (15 000 PLN)
Information in the final report
- Publication in academic press/journals (5)
- Estimates of RelSeq, Mesh1, and SAHMex Hydrolysis of (p)ppGpp and (p)ppApp by Thin Layer Chromatography and NADP/NADH Coupled AssaysAuthors:Katarzyna Potrykus, Nathan E. Thomas, Bożena Bruhn-Olszewska, Michał Sobala, Maciej Dylewski, Tamara James and Michael CashelAcademic press:Frontiers in Microbiology (rok: 2020, tom: 11, strony: 45303), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:PublishedDOI:10.3389/fmicb.2020.581271 - link to the publication
- From (p)ppGpp to (pp)pGpp: Characterization of Regulatory Effects of pGpp Synthesized by the Small Alarmone Synthetase of Enterococcus faecalis.Authors:Gaca AO, Kudrin P, Colomer-Winter C, Beljantseva J, Liu K, Anderson B, Wang JD, Rejman D, Potrykus K, Cashel M, Hauryliuk V, Lemos JA.Academic press:Journal of Bacteriology (rok: 2015, tom: 197, strony: 2908-19), Wydawca: American Society for MicrobiologyStatus:PublishedDOI:10.1128/JB.00324-15 - link to the publication
- Methylobacterium extorquens RSH enzyme synthesizes (p)ppGpp and pppApp in vitro and in vivo, and leads to discovery of pppApp synthesis in Escherichia coli.Authors:Sobala M, Bruhn-Olszewska B, Cashel M, Potrykus KAcademic press:Frontiers in Microbiology (rok: 2019, tom: 10, strony: 45304), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:PublishedDOI:10.3389/fmicb.2019.00859 - link to the publication
- 50th anniversary of discovering "magic spots" – the latest advances in (p)ppGpp researchAuthors:Dylewski M, Sobala M, Bruhn-Olszewska B, Potrykus KAcademic press:Postępy Biochemii (rok: 2018, tom: 64 (1), strony: 45299), Wydawca: Polskie Towarzystwo BiochemiczneStatus:PublishedDOI:brak - link to the publication
- Structure-function comparisons of (p)ppApp vs (p)ppGpp for Escherichia coli RNA polymerase binding sites and for rrnB P1 promoter regulatory responses in vitro.Authors:Bruhn-Olszewska B, Molodtsov V, Sobala M, Dylewski M, Murakami KS, Cashel M, Potrykus K.Academic press:Biochimica Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms (rok: 2018, tom: 1861(8), strony: 731-742), Wydawca: ElsevierStatus:PublishedDOI:10.1016/j.bbagrm.2018.07.005 - link to the publication