Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Termodynamiczne podstawy projektowania optymalnych funkcjonalnie, modyfikowanych siRNA oraz ich eksperymentalna weryfikacja.

2013/10/E/NZ1/00741

Słowa kluczowe:

siRNA termodynamika RNA wyciszanie genów modyfikowane nukleotydy chemia i biologia funkcjonalnych RNA

Deskryptory:

  • NZ1_6: Biologia syntetyczna
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST5_16: Chemia biologiczna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Anna Pasternak 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA BIS 3 - ogłoszony 2013-06-14

Przyznana kwota: 810 300 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-07-02

Zakończenie projektu: 2018-04-01

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. kołyska laboratoryjna. Za kwotę 5 500 PLN
  2. zasilacz do elektroforezy wysokonapięciowej. Za kwotę 9 000 PLN
  3. miniwirówka. Za kwotę 5 500 PLN
  4. elektroporator. Za kwotę 42 000 PLN
  5. zestaw komputerowy (komputer, monitor, drukarka). Za kwotę 7 000 PLN
  6. kaseta z ekranem do fosforimigera firmy Fuji. Za kwotę 15 000 PLN
  7. spektrofotometr mikropłytkowy z inkubatorem.
  8. moduł grzewczy do wytrząsarki (z pokrywą). Za kwotę 8 000 PLN
  9. pompa olejowa wysokiej próżni. Za kwotę 10 000 PLN
  10. łaźnia wodna. Za kwotę 5 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Contribution of 3′T and 3′TT overhangs to the thermodynamic stability of model siRNA duplexes IF: 1,949
    Autorzy:
    Jolanta Lisowiec-Wąchnicka, Brent M. Znosko, Anna Pasternak
    Czasopismo:
    Biophysical Chemistry (rok: 2019, tom: 246, strony: 35-39), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bpc.2018.12.006 - link do publikacji
  2. Thermodynamic, anticoagulant, and antiproliferative properties of thrombin binding aptamer containing novel UNA derivative IF: 5,8
    Autorzy:
    Kotkowiak W., Lisowiec-Wachnicka J., Grynda J., Kierzek R., Wengel J., Pasternak A.
    Czasopismo:
    Molecular Therapy Nucleic Acids (rok: 2018, tom: 10, strony: 304-316), Wydawca: Elsevier, Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.omtn.2017.12.013 - link do publikacji
  3. Improved RE31 Analogues Containing Modified Nucleic Acid Monomers: Thermodynamic, Structural, and Biological Effects IF: 6,054
    Autorzy:
    Weronika Kotkowiak, Jesper Wengel, Chris J. Scotton, Anna Pasternak
    Czasopismo:
    Journal of Medicinal Chemistry (rok: 2019, tom: 62, strony: 2499-2507), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jmedchem.8b01806 - link do publikacji
  4. Novel isoguanine derivative of unlocked nucleic acid – investigations of thermodynamics and biological potential of modified thrombin binding aptamer IF: 3,4
    Autorzy:
    Weronika Kotkowiak, Tomasz Czapik, Anna Pasternak
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2018, tom: 13, strony: e0197835), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0197835 - link do publikacji
  5. Synthesis and hybridization properties of oligonucleotide analogues with novel acyclic triazole internucleotide linkages IF: 2,9
    Autorzy:
    Gladysz M., Nowak-Karnowska A., Pasternak A., Milecki J.
    Czasopismo:
    Bioorganic Chemistry (rok: 2017, tom: 72, strony: 161-167), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bioorg.2017.04.004 - link do publikacji
  6. A systematic study on the infuence of thermodynamic asymmetry of 5′-ends of siRNA duplexes in relation to their silencing potency IF: 4,011
    Autorzy:
    Jolanta Lisowiec-Wąchnicka, Natalia Bartyś, Anna Pasternak
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 2477), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-36620-9 - link do publikacji
  7. Thermodynamic, structural and fluorescent characteristics of DNA hairpins containing functionalized pyrrolo-2'-deoxycytidines IF: 2,9
    Autorzy:
    Zofia Jahnz-Wechmann, Jolanta Lisowiec-Wachnicka, Grzegorz Framski, Joanna Kosman, Jerzy Boryski, Anna Pasternak
    Czasopismo:
    Bioorganic Chemistry (rok: 2017, tom: 71, strony: 294-298), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bioorg.2017.02.014 - link do publikacji
  8. Thermodynamic Features of Structural Motifs Formed by β-L-RNA IF: 3,4
    Autorzy:
    Szabat M, Gudanis D, Kotkowiak W, Gdaniec Z, Kierzek R, Pasternak A
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2016, tom: 11(2), strony: e0149478), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0149478 - link do publikacji