Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Opracowanie narzędzia do automatycznej oceny kompleksów ligandów z receptorami serotoninowymi opartego o wykorzystanie metod uczenia maszynowego.

2013/09/N/NZ2/01917

Słowa kluczowe:

receptory serotoninowe dokowanie uczenie maszynowe fingerprinty deskryptory molekularne

Deskryptory:

  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • ST1_18: Zastosowania matematyki w innych naukach

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Farmakologii PAN

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Sabina Podlewska 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 97 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-13

Zakończenie projektu: 2016-02-12

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (6)
  1. Extremely Randomized Machine Learning Methods for Compound Activity Prediction
    Autorzy:
    Wojciech M. Czarnecki, Sabina Podlewska, Andrzej J. Bojarski
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2015, tom: 20, strony: 20107-20117), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules201119679 - link do publikacji
  2. Multi-Step Protocol for Automatic Evaluation of Docking Results Based on Machine Learning Methods - a Case Study of Serotonin Receptors 5-HT6 and 5-HT7
    Autorzy:
    Sabina Smusz, Stefan Mordalski, Jagna Witek, Krzysztof Rataj, Rafał Kafel, Andrzej J. Bojarski
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2015, tom: 55, strony: 823-832), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/ci500564b - link do publikacji
  3. Multiple conformational states in retrospective virtual screening - homology models vs. crystal structures. Beta-2 adrenergic receptor case study
    Autorzy:
    Jagna Witek, Stefan Mordalski, Sabina Smusz, Krzysztof Rataj, Andrzej J. Bojarski
    Czasopismo:
    Journal of Cheminformatics (rok: 2015, tom: 9, strony: 45300), Wydawca: Chemistry Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13321-015-0062-x - link do publikacji
  1. Structural interaction profiles combination as a method for optimization of its application in docking results analysis - beta-2 adrenergic receptor case study
    Autorzy:
    Sabina Smusz, Jagna Witek, Krzysztof Rataj, Stefan Mordalski, Andrzej J. Bojarski
    Konferencja:
    The GLISTEN Budapest 2014 Conference (rok: 2014, ), Wydawca: Research Centre for Natural Sciences Hungarian Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 02-04 październik
    Status:
    Opublikowana
  2. Tools for in silico evaluation of cytochrome P450-mediated compounds metabolism
    Autorzy:
    Sabina Podlewska, Enza Lacivita, Marcello Leopoldo, Andrzej J. Bojarski
    Konferencja:
    V Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network (rok: 2015, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej
    Data:
    konferencja 03-05 lipiec
    Status:
    Opublikowana
  3. Automatyczna ocena kompleksów ligand-receptor przy wykorzystaniu metod uczenia maszynowego
    Autorzy:
    Sabina Smusz
    Konferencja:
    Dokonania Naukowe Doktorantów (rok: 2014, ), Wydawca: CreativeTime
    Data:
    konferencja 12.04.2014
    Status:
    Opublikowana
  4. A machine learning-based protocol for docking results analysis
    Autorzy:
    Sabina Smusz, Stefan Mordalski, Jagna Witek, Krzysztof Rataj, Andrzej J. Bojarski
    Konferencja:
    The 10th International Conference on Chemical Structures (rok: 2014, ), Wydawca: CIC Division of the German Chemical Society
    Data:
    konferencja 01-05 czerwiec
    Status:
    Opublikowana
  5. Combination of structural interaction profiles as a method for optimization of its application in docking results analysis
    Autorzy:
    Jagna Witek, Sabina Smusz, Krzysztof Rataj, Stefan Mordalski, Andrzej J. Bojarski
    Konferencja:
    VI Konwersatorium Chemii Medycznej (rok: 2014, ), Wydawca: Uniwersytet Medyczny w Lublinie
    Data:
    konferencja 18-20 wrzesień
    Status:
    Opublikowana
  6. Narzędzia do oceny stabilności metabolicznej in silico
    Autorzy:
    Sabina Podlewska, Enza Lacivita, Marcello Leopoldo, Andrzej J. Bojarski
    Konferencja:
    V Konferencja Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego – Collegium Medicum (rok: 2015, ), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński
    Data:
    konferencja 25-26 maj
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy