Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badanie własności fizykochemicznych fragmentu rybosomu bakteryjnego oraz enzymów dezaktywujących w miejscach wiązania linkozamidów z wykorzystaniem metod modelowania komputerowego

2013/09/N/ST4/00932

Słowa kluczowe:

linkozamidy rybosom własności fizykochemiczne modelowanie komputerowe kwantowo-klasyczna dynamika molekularna

Deskryptory:

  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 150 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-21

Zakończenie projektu: 2017-06-20

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. komputer przenośny typu laptop. Za kwotę 6 200 PLN
  2. dysk twardy (macierz dyskowa) (5 szt.). Za kwotę 6 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Conformational space of clindamycin studied by quantum and full-atom molecular dynamics IF: 1,736
    Autorzy:
    Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Trylska, Joanna Sadlej
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2016, tom: 0,930555555555555, strony: 44572), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00894-015-2881-0 - link do publikacji
  2. Molecular dynamics simulations suggest why the A2058G mutation in 23S RNA results in bacterial resistance against clindamycin IF: 1,507
    Autorzy:
    Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Sadlej, Joanna Trylska
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2018, tom: 24:191, strony: 44573), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00894-018-3689-5 - link do publikacji
  1. Interactions of clindamycin with the fragment of ribosome – quantum mechanics/molecular mechanics study
    Autorzy:
    Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Trylska, Joanna Sadlej
    Konferencja:
    XXI International Conference on "Horizons in Hydrogen Bond Research (rok: 2015, ), Wydawca: Uniwersytet Wrocławski
    Data:
    konferencja 13-18.09.2015
    Status:
    Opublikowana