Projekty finansowane przez NCN
Badanie własności fizykochemicznych fragmentu rybosomu bakteryjnego oraz enzymów dezaktywujących w miejscach wiązania linkozamidów z wykorzystaniem metod modelowania komputerowego
2013/09/N/ST4/00932
Słowa kluczowe:
linkozamidy rybosom własności fizykochemiczne modelowanie komputerowe kwantowo-klasyczna dynamika molekularna
Deskryptory:
- ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
Panel:
ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
dr Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs: PRELUDIUM 5 - ogłoszony 2013-03-15
Przyznana kwota: 150 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-02-21
Zakończenie projektu: 2017-06-20
Planowany czas trwania projektu: 40 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- komputer przenośny typu laptop. Za kwotę 6 200 PLN
- dysk twardy (macierz dyskowa) (5 szt.). Za kwotę 6 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
- Conformational space of clindamycin studied by quantum and full-atom molecular dynamicsAutorzy:Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Trylska, Joanna SadlejCzasopismo:Journal of Molecular Modeling (rok: 2016, tom: 0,930555555555555, strony: 45302), Wydawca: Springer Berlin HeidelbergStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00894-015-2881-0 - link do publikacji
- Molecular dynamics simulations suggest why the A2058G mutation in 23S RNA results in bacterial resistance against clindamycinAutorzy:Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Sadlej, Joanna TrylskaCzasopismo:Journal of Molecular Modeling (rok: 2018, tom: 24:191, strony: 45303), Wydawca: Springer Berlin HeidelbergStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00894-018-3689-5 - link do publikacji
- Interactions of clindamycin with the fragment of ribosome – quantum mechanics/molecular mechanics studyAutorzy:Katarzyna Kulczycka-Mierzejewska, Joanna Trylska, Joanna SadlejKonferencja:XXI International Conference on "Horizons in Hydrogen Bond Research (rok: 2015, ), Wydawca: Uniwersytet WrocławskiData:konferencja 13-18.09.2015Status:Opublikowana