Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Zastosowanie ukierunkowanego sekwencjonowania następnej generacji (NGS) w szacowaniu markerów genetycznych związanych z jakością mięsa wieprzowego

2013/09/D/NZ9/02452

Słowa kluczowe:

sekwencjonowanie nasępnej generacji świnie loci cech ilościowych

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ9_2: Naukowe podstawy zootechniki

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Instytut Zootechniki - Państwowy Instytut Badawczy

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Katarzyna Piórkowska 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: SONATA 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 611 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-17

Zakończenie projektu: 2017-09-16

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. 2200 TapeStation Nucleic Acid System (Agilent).
  2. Sonifikator Bioruptor® NGS UCD-600 TS (Diagenode). Za kwotę 100 000 PLN
  3. TagMan Array Card Block Upgrade Kit wraz z wirówką do kart TLDA.
  4. Aparat Bioanalyzer (Agilent). Za kwotę 120 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
  1. Transcript variants of a region on SSC15 rich in QTLs associated with meat quality in pigs IF: 1,018
    Autorzy:
    Piórkowska K., Żukowski K., Szmatoła T., Ropka-Molik K.
    Czasopismo:
    Annals of Animal Science (rok: 2017, tom: 17 (3), strony: 703–715), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1515/aoas-2016-0095 - link do publikacji
  2. The SSC15 QTL-rich region mutations affecting intramuscular fat and production traits in pigs IF: 1,371
    Autorzy:
    Piórkowska, K. Tyra M., Żukowski K., Ropka-Molik K.
    Czasopismo:
    Animal Production Science (rok: 2019, tom: ., strony: .), Wydawca: .
    Status:
    Złożona
  3. A comprehensive transcriptome analysis of skeletal muscles in two Polish pig breeds differing in fat and meat quality traits IF: 1,493
    Autorzy:
    Piórkowska K. , Żukowski K., Ropka-Molik K., Tyra M., Gurgul A.
    Czasopismo:
    Genetics and Molecular Biology (rok: 2018, tom: 41(1), strony: 125–136), Wydawca: SciELO (Scientific Library Online)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1590/1678-4685-GMB-2016-0101 - link do publikacji
  4. Deep sequencing of a QTL-rich region spanning 128-136Mbp of pig chromosome 15 IF: 2,498
    Autorzy:
    Piórkowska K., Żukowski K., Ropka-Molik K., Tyra M.
    Czasopismo:
    Gene (rok: 2018, tom: 647, strony: 268-275), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.gene.2018.01.045 - link do publikacji
  5. Detection of genetic variants between different Polish Landrace and Pulawska pigs by means of RNA-seq analysis IF: 1,841
    Autorzy:
    Piórkowska K., Żukowski K., Ropka-Molik K., Tyra M.
    Czasopismo:
    Animal Genetics (rok: 2018, tom: 49(3), strony: 215-225), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/age.12654 - link do publikacji
  6. The effect of QTL-rich region polymorphisms identified by targeted DNA-seq on pig production traits IF: 1,889
    Autorzy:
    Stuczyńska A., Piórkowska K., Tyra M., Żukowski K.
    Czasopismo:
    Molecular Biology Reports (rok: 2018, tom: 45(3), strony: 361-371), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11033-018-4170-3 - link do publikacji
  1. Deep sequencing of QTL-rich region on porcine chromosome 15
    Autorzy:
    Piórkowska K., Żukowski K., Tyra M., Ropka-Molik K.
    Konferencja:
    6th Central European Congress of Life Sciences EUROBIOTECH 2017, Kraków, (rok: 2017, ), Wydawca: Targi w Krakowie Ltd.
    Data:
    konferencja 11.09 – 14.09.2017 r.
    Status:
    Opublikowana
  2. Can targeted-enrichment next-generation sequencing be a potential screening tool for searching for molecular markers of growth traits in pigs?
    Autorzy:
    Piórkowska K., Stuczynska A. , Zukowski K.
    Konferencja:
    36th International Society for Animal Genetics Conference (2017) Dublin, Ireland (rok: 2017, ), Wydawca: ISAG 2017 Abstract Book
    Data:
    konferencja 7.16.2017 – 7.21.2017
    Status:
    Opublikowana