Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Konserwatywne motywy strukturalne RNA wirusa grypy: klucz do zrozumienia funkcji wirusowych RNA

2013/08/M/NZ1/01062

Słowa kluczowe:

struktura drugorzędowa RNA przewidywanie struktury drugorzędowej RNA zależność struktura-funkcja w RNA funkcja RNA wirus grypy mikromacierze modyfikowane oligonukleotydy

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Elżbieta Kierzek 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: HARMONIA 4 - ogłoszony 2012-12-15

Przyznana kwota: 912 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-08-28

Zakończenie projektu: 2017-05-27

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (12)
  1. A Conserved Secondary Structural Element in the Coding Region of the Influenza A Virus Nucleoprotein (NP) mRNA Is Important for the Regulation of Viral Proliferation IF: 3,234
    Autorzy:
    M. Soszynska-Jozwiak, P. Michalak, W.N. Moss, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2015, tom: 10, strony: e0141132), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0141132 - link do publikacji
  2. Secondary Structure of a Conserved Domain in an Intron of Influenza A M1 mRNA IF: 3,194
    Autorzy:
    T. Jiang, S.D. Kennedy, W.N. Moss, E. Kierzek, D.H. Turner
    Czasopismo:
    Biochemistry (rok: 2014, tom: 53, strony: 5236-5248), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/bi500611j - link do publikacji
  3. Structural Aspects of the Antiparallel and Parallel Duplexes Formed by DNA, 2 '-O-Methyl RNA and RNA Oligonucleotides IF: 3,234
    Autorzy:
    M. Szabat, T. Pedzinski, T. Czapik, E. Kierzek, R. Kierzek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2015, tom: 10, strony: e0143354), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0143354 - link do publikacji
  4. Antisense Oligonucleotides Targeting Influenza A Segment 8 Genomic RNA Inhibit Viral Replication IF: 3,041
    Autorzy:
    E. Lenartowicz, A. Nogales, E. Kierzek, R. Kierzek, L. Martinez-Sobrido, D.H. Turner
    Czasopismo:
    Nucleic Acid Therapeutics (rok: 2016, tom: 26, strony: 277–285), Wydawca: Mary Ann Liebert, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1089/nat.2016.0619 - link do publikacji
  5. Structural determinants for alternative splicing regulation of the MAPT pre-mRNA IF: 4,974
    Autorzy:
    J. Lisowiec, D. Magner; E. Kierzek, E. Lenartowicz, R. Kierzek
    Czasopismo:
    RNA BIOLOGY (rok: 2015, tom: 12, strony: 330-342), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/15476286.2015.1017214 - link do publikacji
  6. The contribution of pseudouridine to stabilities and structure of RNAs IF: 8,808
    Autorzy:
    E. Kierzek, M. Malgowska, J. Lisowiec, D. H. Turner, Z. Gdaniec and R. Kierzek
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 3492-3501), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkt1330 - link do publikacji
  7. Microarrays for identifying binding sites and probing structure of RNAs IF: 9,112
    Autorzy:
    R. Kierzek, D.H. Turner, E. Kierzek
    Czasopismo:
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH (rok: 2015, tom: 43, strony: 44573), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku1303 - link do publikacji
  8. Interplay of LNA and 2′‑O‑Methyl RNA in the Structure and Thermodynamics of RNA Hybrid Systems: A Molecular Dynamics Study Using the Revised AMBER Force Field and Comparison with Experimental Results IF: 3,377
    Autorzy:
    I. Yildirim, E. Kierzek, R. Kierzek, and G. C. Schatz
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2014, tom: 118, strony: 14177-14187), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/jp506703g - link do publikacji
  9. A Tandem Oligonucleotide Approach for SNP-Selective RNA Degradation Using Modified Antisense Oligonucleotides IF: 3,234
    Autorzy:
    D. Magner, E. Biala, J. Lisowiec-Wachnicka, E. Kierzek, R. Kierzek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2015, tom: 10, strony: e0142139), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0142139 - link do publikacji
  10. Secondary structure model of the naked segment 7 influenza A virus genomic RNA IF: 4,116
    Autorzy:
    A. Ruszkowska, E. Lenartowicz, W. N. Moss, R. Kierzek and E. Kierzek
    Czasopismo:
    Biochemical Journal (rok: 2016, tom: 473, strony: 4327-4348), Wydawca: Portland Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1042/BCJ20160651 - link do publikacji
  11. Self-Folding of Naked Segment 8 Genomic RNA of Influenza A Virus IF: 3,535
    Autorzy:
    E. Lenartowicz, J. Kesy, A. Ruszkowska, M. Soszynska-Jozwiak, P. Michalak, W.N. Moss, D.H. Turner, DH, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    PloS One (rok: 2016, tom: 11, strony: e0148281), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0148281 - link do publikacji
  12. TMV mutants with poly(A) tracts of different lengths demonstrate structural variations in 3 ' UTR affecting viral RNAs accumulation and symptom expression IF: 5,578
    Autorzy:
    S. Guo, E. Kierzek, G. Chen, Y. Zhou & S. Wong
    Czasopismo:
    SCIENTIFIC REPORTS (rok: 2015, tom: 5, strony: 18412), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep18412 - link do publikacji