Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowatorskie badania ilościowe w komórce in vivo: pomiary mobilności białek i oddziaływania białek z takimi strukturami wewnątrzkomórkowymi jak glikogen i mitochondria

2013/08/W/NZ1/00687

Słowa kluczowe:

nanolepkość dyfuzja oddziaływanie spektroskopia korelacji fluorescencji metabolizm energetyczny Drp1 GBE1 glikogen mitochondria

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ3_1: Biologia komórki

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jerzy Duszyński 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: SYMFONIA 1 - ogłoszony 2012-11-15

Przyznana kwota: 5 000 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-12-09

Zakończenie projektu: 2018-07-08

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Inkubator CO2 (z pokryciem komory wewnętrznej ze stopu miedzi). Za kwotę 60 000 PLN
  2. licznik do komórek Countess II FL wraz z wyposażeniem.
  3. wyciągarka kapilar. Za kwotę 35 000 PLN
  4. autoklaw. Za kwotę 10 000 PLN
  5. demineralizator.
  6. kolumna do chromatografii wykluczenia (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
  7. pojemnik dewara do przechowywania zamrożonych komórek. Za kwotę 15 000 PLN
  8. mikroskop. Za kwotę 100 000 PLN
  9. wirówka z chłodzeniem. Za kwotę 50 000 PLN
  10. łaźnia wodna. Za kwotę 5 000 PLN
  11. aparat do mikrowstrzyknięć (stanowisko do mikrowstrzyknięć). Za kwotę 165 000 PLN
  12. komora laminarna. Za kwotę 50 000 PLN
  13. pompka próżniowa z akcesoriami. Za kwotę 10 000 PLN
  14. termocykler.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (14)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (4)
  1. Bacteriophage-Based Bioconjugates as a Flow Cytometry Probe for Fast Bacteria Detection IF: 4,818
    Autorzy:
    Marta Janczuk, Łukasz Richter,Grażyna Hoser,Jerzy Kawiak, Marcin Łoś,Joanna Niedziółka-Jonsson,Jan Paczesny, Robert Hołyst
    Czasopismo:
    BIOCONJUGATE CHEMISTRY (rok: 2017, tom: 28, strony: 419-425), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.bioconjchem.6b00596 - link do publikacji
  2. Determination of oligomerization state of Drp1 protein in living cells at nanomolar concentrations IF: 4,011
    Autorzy:
    Karina Kwapiszewska, Tomasz Kalwarczyk, Bernadeta Michalska, Krzysztof Szczepański, Jędrzej Szymański, Paulina Patalas-Krawczyk, Tomasz Andryszewski, Michalina Iwan, Jerzy Duszyński & Robert Hołyst
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 5906), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-42418-0 - link do publikacji
  3. Electrochemical pathway for the quantification of SERS enhancement factor IF: 4,287
    Autorzy:
    Arumugam Sivanesan, Witold Adamkiewicz, Govindasamy Kalaivani, Agnieszka Kamińska, Jacek Waluk, Robert Hołyst, Emad L. Izake
    Czasopismo:
    Electrochemistry Communications (rok: 2014, tom: 49, strony: 103-106), Wydawca: ScienceDirect
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  4. Insight into the fission mechanism by quantitative characterization of Drp1 protein distribution in the living cell IF: 4,122
    Autorzy:
    Michalska BM, Kwapiszewska K, Szczepanowska J, Kalwarczyk T, Patalas-Krawczyk P, Szczepański K, Hołyst R, Duszyński J, Szymański J.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: 8122), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-26578-z - link do publikacji
  5. Interaction of Mitochondria with the Endoplasmic Reticulum and Plasma Membrane in Calcium Homeostasis, Lipid Trafficking and Mitochondrial Structure IF: 3,226
    Autorzy:
    Szymanski Jędrzej; Janikiewicz Justyna; Michalska Bernadeta; Patalas-Krawczyk Paulina; Perrone Mariasole; Ziolkowski Wieslaw; Duszynski Jerzy; Pinton Paolo; Dobrzyn Agnieszka; Wieckowski Mariusz R.
    Czasopismo:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES (rok: 2017, tom: 18, strony: 1576), Wydawca: MDPI AG
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms18071576 - link do publikacji
  6. Manipulation of multiple-responsive fluorescent supramolecular materials based on the inclusion complexation of cyclodextrins with Tyloxapol IF: 4,696
    Autorzy:
    Jinglin Shen, Jinyu Pang, Tomasz Kalwarczyk, Robert Hołyst, Xia Xin, Guiying Xu, Xiaoyu Luan and Yingjie Yang
    Czasopismo:
    Journal of Materials Chemistry C (rok: 2015, tom: 3, strony: 8104-8113), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C5TC01826A - link do publikacji
  7. Motion of nanoprobes in complex liquids within the framework of the length-scale dependent viscosity model IF: 7,776
    Autorzy:
    Tomasz Kalwarczyk, Krzysztof Sozanski, Anna Ochab-Marcinek, Jedrzej Szymanski, Marcin Tabaka, Sen Hou, Robert Holyst
    Czasopismo:
    Advances in Colloid and Interface Science (rok: 2015, tom: 223, strony: 55-63), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE BV
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.cis.2015.06.007 - link do publikacji
  8. Towards improved precision in the quantification of surface-enhanced Raman scattering (SERS) enhancement factors: a renewed approach IF: 4,107
    Autorzy:
    Arumugam Sivanesan, Witold Adamkiewicz, Govindasamy Kalaivani, Agnieszka Kaminska, Jacek Waluk, Robert Hołyst and Emad L. Izake
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 489-496), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C4AN01778A - link do publikacji
  9. Mechanizm fragmentacji mitochondriów – struktura i funkcja białka Drp1
    Autorzy:
    Bernadeta Michalska, Jerzy Duszyński, Jędrzej Szymański
    Czasopismo:
    Postępy Biochemii (rok: 2016, tom: 62, strony: 127-137), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
  10. Apparent Anomalous Diffusion in the Cytoplasm of Human Cells: The Effect of Probes' Polydispersity IF: 3,177
    Autorzy:
    Kalwarczyk Tomasz; Kwapiszewska Karina; Szczepanski Krzysztof; Sozanski Krzysztof; Szymański Jędrzej; Michalska Bernadeta; Patalas-Krawczyk Paulina; Duszynski Jerzy; Holyst Robert
    Czasopismo:
    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B (rok: 2017, tom: 121, strony: 9831-9837), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.7b07158 - link do publikacji
  11. Mitochondria-associated membranes in aging and senescence: structure, function, and dynamics IF: 5,638
    Autorzy:
    Janikiewicz J, Szymański J, Malinska D, Patalas-Krawczyk P, Michalska B, Duszyński J, Giorgi C, Bonora M, Dobrzyn A, Wieckowski MR.
    Czasopismo:
    Cell Death & Disease (rok: 2018, tom: 9, strony: 332), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41419-017-0105-5 - link do publikacji
  12. Photoactive Langmuir−Blodgett, Freely Suspended and Free Standing Films of Carboxylate Ligand-Coated ZnO Nanocrystals IF: 7,145
    Autorzy:
    Jan Paczesny, Małgorzata Wolska-Pietkiewicz, Ilona Binkiewicz, Monika Wadowska, Zbigniew Wróbel, Kinga Matuła, Wojciech Nogala, Janusz Lewiński, and Robert Hołyst
    Czasopismo:
    ACS Applied Materials & Interfaces (rok: 2016, tom: 8, strony: 13532−13541), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsami.6b03579 - link do publikacji
  13. Mitochondria and Reactive Oxygen Species in Aging and Age-Related Diseases IF: 3,622
    Autorzy:
    Carlotta Giorgi, Saverio Marchi, Ines C.M. Simoes, Ziyu Ren, Giampaolo Morciano, Mariasole Perrone, Paulina Patalas-Krawczyk, Sabine Borchard, Paulina Jędrak, Karolina Pierzynowska, Jędrzej Szymański, David Q. Wang, Piero Portincasa, Grzegorz Węgrzyn, Hans Zischka, Pawel Dobrzyn, Massimo Bonora, Jerzy Duszynski, Alessandro Rimessi, Agnieszka Karkucinska-Wieckowska, Agnieszka Dobrzyn, Gyorgy Szabadkai, Barbara Zavan, Paulo J. Oliveira, Vilma A. Sardao, Paolo Pinton, Mariusz R. Wieckowski
    Czasopismo:
    International Review of Cell and Molecular Biology (rok: 2018, tom: 340, strony: 209-344), Wydawca: ScienceDirect
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/bs.ircmb.2018.05.006 - link do publikacji
  14. The effect of macromolecular crowding on mobility of biomolecules, association kinetics, and gene expression in living cells
    Autorzy:
    Tabaka Marcin, Kalwarczyk Tomasz, Szymański Jędrzej, Hou Sen, Hołyst Robert
    Czasopismo:
    Frontiers in Physics (rok: 2014, tom: 2, strony: 54), Wydawca: frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fphy.2014.00054 - link do publikacji
  1. Insight into Drp1 mediated mitochondrial fission from FCS calibrated imaging
    Autorzy:
    Michalska, B.; Duszynski, J.; Szymanski, J.
    Konferencja:
    42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back (rok: 2017, ), Wydawca: WILEY
    Data:
    konferencja SEP 10-14, 2017
    Status:
    Opublikowana
  2. Measurements of intracellular mobility of proteins associated with glycogen
    Autorzy:
    Paulina Patalas-Krawczyk, Jerzy Duszyński, Jędrzej Szymański
    Konferencja:
    BIO 2016 Congress (rok: 2016, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne i Komitet Biochemii i Biofizyki PAN
    Data:
    konferencja 13-16.09
    Status:
    Opublikowana
  3. Quantitative analysis of Drp1 oligomeric states in the living cell
    Autorzy:
    Bernadeta Michalska, Jerzy Duszyński, Jędrzej Szymański
    Konferencja:
    BIO 2016 Congress (rok: 2016, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne i Komitet Biochemii i Biofizyki PAN
    Data:
    konferencja 13-16.09
    Status:
    Opublikowana
  4. Diffusion of Drp1 protein in the living cell
    Autorzy:
    Bernadeta Michalska, Jerzy Duszyński, Jędrzej Szymański
    Konferencja:
    2016 EBEC Abstracts (rok: 2016, ), Wydawca: Elsevier
    Data:
    konferencja Lipiec 2-7
    Status:
    Opublikowana