Transpozony w genomach pierwszych grzybów lądowych (Zygomycota)
2012/07/D/NZ2/04286
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_9: Biologia systemowa
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs
SONATA 4 – ogłoszony 2012-09-15
- Przyznana kwota
- 499 800 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2013-07-16
- Zakończenie projektu
- 2017-07-15
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Serwer HP Proliant w wersji 24 lib 48 procesorowej z ponad 64GB RAM. Za kwotę 24 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (9)
-
Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)
- Autorzy:
- M.M. Teixeira, L.F. Moreno, B.J. Stielow, A. Muszewska, M. Hainaut, L. Gonzaga, A. Abouelleil, J.S.L. Patané, M. Priest, R. Souza, S. Young, K.S. Ferreira, Q. Zeng, M.M.L. da Cunha, A. Gladki, B. Barker, V.A. Vicente, E.M. de Souza, S. Almeida, B. Henrissat, A.T.R. Vasconcelos, S. Deng, H. Voglmayr, T.A.A. Moussa, A. Gorbushina, M.S.S. Felipe, C.A. Cuomo, G. Sybren de Hoog
- Czasopismo:
- Studies in Mycology (rok: 2017, tom: S0166-0616(17), strony: 30016-7), Wydawca: Science direct
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.simyco.2017.01.001 – link do publikacji
-
Fungal lifestyle reflected in serine protease repertoire
- Autorzy:
- Anna Muszewska, Marta M. Stepniewska-Dziubinska,Kamil Steczkiewicz, Julia Pawlowska, Agata Dziedzic, Krzysztof Ginalski
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: -), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-017-09644-w – link do publikacji
-
Cut-and-paste transposons in fungi with diverse lifestyles
- Autorzy:
- Anna Muszewska, Kamil Steczkiewicz, Marta M. Stepniewska-Dziubinska, Krzysztof Ginalski
- Czasopismo:
- Genome Biology and Evolution (rok: 2017, tom: 1;9(12), strony: 3463-3477), Wydawca: Oxford Jourmals
- Status:
- Opublikowana
-
Phylogeny-Based Systematization of Arabidopsis Proteins with Histone H1 Globular Domain
- Autorzy:
- Maciej Kotliński, Lukasz Knizewski, Anna Muszewska, Kinga Rutowicz, Maciej Lirski, Anja Schmidt, Célia Baroux, Krzysztof Ginalski, Andrzej Jerzmanowski
- Czasopismo:
- Plant Physiology (rok: 2017, tom: 174, strony: 27-34), Wydawca: American Society of Plant Biologists
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1104/pp.16.00214 – link do publikacji
-
Phylogenetic and phylogenomic definition of Rhizopus species
- Autorzy:
- Gryganskyi A, Golan J, Dolatabadi S, Mondo S, Robb S, Idnurm A, Muszewska A, Steczkiewicz K, Masonjones S, Liao HL, Gajdeczka MT1, Anike F, Vuek A, Anishchenko IM, Voigt K, de Hoog GS, Smith ME, Heitman J, Vilgalys R, Stajich JE
- Czasopismo:
- G3: Genes, Genomes, Genetics (rok: 2018, tom: vol. 8 no. 6, strony: 2007-2018), Wydawca: The Genetics Society of America
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1534/g3.118.200235 – link do publikacji
-
Phosphorylation of spore coat proteins by a family of atypical protein kinases.
- Autorzy:
- Nguyen KB, Sreelatha A, Durrant ES, Lopez-Garrido J, Muszewska A, Dudkiewicz M, Grynberg M, Yee S, Pogliano K, Tomchick DR, Pawłowski K, Dixon JE, Tagliabracci VS.
- Czasopismo:
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (rok: 2016, tom: 113(25), strony: E3482-91), Wydawca: National Academy of Sciences
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1073/pnas.1605917113. – link do publikacji
-
Fungal genomes tell a story of ecological adaptations
- Autorzy:
- Anna Muszewska
- Czasopismo:
- Folia Biologica et Oecologica (rok: 2014, tom: 10, strony: 46282), Wydawca: DE GRUYTER
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.2478/fobio-2014-0011 – link do publikacji
-
Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)
- Autorzy:
- Teixeira MM, Moreno LF, Stielow BJ, Muszewska A, Hainaut M, Gonzaga L, Abouelleil A, Patané JS, Priest M, Souza R, Young S, Ferreira KS, Zeng Q, da Cunha MM, Gladki A, Barker B, Vicente VA, de Souza EM, Almeida S, Henrissat B, Vasconcelos AT, Deng S, Voglmayr H, Moussa TA, Gorbushina A, Felipe MS, Cuomo CA, de Hoog GS
- Czasopismo:
- Studies in Mycology (rok: 2017, tom: 86, strony: 46050), Wydawca: Elsevier B.V.
- Status:
- Opublikowana
-
Biology, systematics, and clinical manifestations of Zygomycota infections
- Autorzy:
- Anna Muszewska, Julia Pawłowska, Paweł Krzyściak
- Czasopismo:
- European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2014, tom: 33, strony: 1273-1287), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s10096-014-2076-0 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
-
Detecting Locus Acquisition Events in Gene Trees
- Autorzy:
- Michał Ciach, Anna Muszewska and Paweł Górecki.
- Konferencja:
- 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2017) (rok: 2017, strony: -), Wydawca: Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum fuer Informatik
- Data:
- konferencja 21-23.08.2017
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji