Transpozony w genomach pierwszych grzybów lądowych (Zygomycota)

2012/07/D/NZ2/04286

Słowa kluczowe

Deskryptory

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_9: Biologia systemowa

Panel

NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca

Instytut Biochemii i Biofizyki PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki »

Kierownik projektu (z jednostki realizującej)

dr Anna Muszewska

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs

SONATA 4 – ogłoszony 2012-09-15

Przyznana kwota
499 800 PLN
Rozpoczęcie projektu
2013-07-16
Zakończenie projektu
2017-07-15
Planowany czas trwania projektu
48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu
Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer HP Proliant w wersji 24 lib 48 procesorowej z ponad 64GB RAM. Za kwotę 24 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

Publikacje w czasopismach (9)

  1. Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)

    Autorzy:
    M.M. Teixeira, L.F. Moreno, B.J. Stielow, A. Muszewska, M. Hainaut, L. Gonzaga, A. Abouelleil, J.S.L. Patané, M. Priest, R. Souza, S. Young, K.S. Ferreira, Q. Zeng, M.M.L. da Cunha, A. Gladki, B. Barker, V.A. Vicente, E.M. de Souza, S. Almeida, B. Henrissat, A.T.R. Vasconcelos, S. Deng, H. Voglmayr, T.A.A. Moussa, A. Gorbushina, M.S.S. Felipe, C.A. Cuomo, G. Sybren de Hoog
    Czasopismo:
    Studies in Mycology (rok: 2017, tom: S0166-0616(17), strony: 30016-7), Wydawca: Science direct
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.simyco.2017.01.001 – link do publikacji
  2. Fungal lifestyle reflected in serine protease repertoire

    Autorzy:
    Anna Muszewska, Marta M. Stepniewska-Dziubinska,Kamil Steczkiewicz, Julia Pawlowska, Agata Dziedzic, Krzysztof Ginalski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: -), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1038/s41598-017-09644-w – link do publikacji
  3. Cut-and-paste transposons in fungi with diverse lifestyles

    Autorzy:
    Anna Muszewska, Kamil Steczkiewicz, Marta M. Stepniewska-Dziubinska, Krzysztof Ginalski
    Czasopismo:
    Genome Biology and Evolution (rok: 2017, tom: 1;9(12), strony: 3463-3477), Wydawca: Oxford Jourmals
    Status:
    Opublikowana
  4. Phylogeny-Based Systematization of Arabidopsis Proteins with Histone H1 Globular Domain

    Autorzy:
    Maciej Kotliński, Lukasz Knizewski, Anna Muszewska, Kinga Rutowicz, Maciej Lirski, Anja Schmidt, Célia Baroux, Krzysztof Ginalski, Andrzej Jerzmanowski
    Czasopismo:
    Plant Physiology (rok: 2017, tom: 174, strony: 27-34), Wydawca: American Society of Plant Biologists
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1104/pp.16.00214 – link do publikacji
  5. Phylogenetic and phylogenomic definition of Rhizopus species

    Autorzy:
    Gryganskyi A, Golan J, Dolatabadi S, Mondo S, Robb S, Idnurm A, Muszewska A, Steczkiewicz K, Masonjones S, Liao HL, Gajdeczka MT1, Anike F, Vuek A, Anishchenko IM, Voigt K, de Hoog GS, Smith ME, Heitman J, Vilgalys R, Stajich JE
    Czasopismo:
    G3: Genes, Genomes, Genetics (rok: 2018, tom: vol. 8 no. 6, strony: 2007-2018), Wydawca: The Genetics Society of America
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1534/g3.118.200235 – link do publikacji
  6. Phosphorylation of spore coat proteins by a family of atypical protein kinases.

    Autorzy:
    Nguyen KB, Sreelatha A, Durrant ES, Lopez-Garrido J, Muszewska A, Dudkiewicz M, Grynberg M, Yee S, Pogliano K, Tomchick DR, Pawłowski K, Dixon JE, Tagliabracci VS.
    Czasopismo:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (rok: 2016, tom: 113(25), strony: E3482-91), Wydawca: National Academy of Sciences
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1073/pnas.1605917113. – link do publikacji
  7. Fungal genomes tell a story of ecological adaptations

    Autorzy:
    Anna Muszewska
    Czasopismo:
    Folia Biologica et Oecologica (rok: 2014, tom: 10, strony: 46282), Wydawca: DE GRUYTER
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.2478/fobio-2014-0011 – link do publikacji
  8. Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)

    Autorzy:
    Teixeira MM, Moreno LF, Stielow BJ, Muszewska A, Hainaut M, Gonzaga L, Abouelleil A, Patané JS, Priest M, Souza R, Young S, Ferreira KS, Zeng Q, da Cunha MM, Gladki A, Barker B, Vicente VA, de Souza EM, Almeida S, Henrissat B, Vasconcelos AT, Deng S, Voglmayr H, Moussa TA, Gorbushina A, Felipe MS, Cuomo CA, de Hoog GS
    Czasopismo:
    Studies in Mycology (rok: 2017, tom: 86, strony: 46050), Wydawca: Elsevier B.V.
    Status:
    Opublikowana
  9. Biology, systematics, and clinical manifestations of Zygomycota infections

    Autorzy:
    Anna Muszewska, Julia Pawłowska, Paweł Krzyściak
    Czasopismo:
    European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2014, tom: 33, strony: 1273-1287), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s10096-014-2076-0 – link do publikacji

Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)

  1. Detecting Locus Acquisition Events in Gene Trees

    Autorzy:
    Michał Ciach, Anna Muszewska and Paweł Górecki.
    Konferencja:
    17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2017) (rok: 2017, strony: -), Wydawca: Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum fuer Informatik
    Data:
    konferencja 21-23.08.2017
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    link do publikacji

« Nowe wyszukiwanie

Projekt graficzny i wykonanie: Jakub Piotrowski