Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania strukturalne oparte na niskim podobieństwie sekwencyjnym receptorów sprzężonych z białkiem G aktywowanych przez hormony i modulatory allosteryczne

2012/07/D/NZ1/04244

Słowa kluczowe:

białka błonowe receptory sprzężone z białkiem G modelowanie homologiczne wirtualny skrining dynamika molekularna efekt uboczny leku allosteryczność uliniowienie wielu sekwencji profil sekwencyjny receptory glikoproteinowe rodzina receptorów sekretynowych GPR30 rodzina rodopsyny agonizm antagonizm aktywacja receptora

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Dorota Latek 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: SONATA 4 - ogłoszony 2012-09-15

Przyznana kwota: 491 250 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-07-16

Zakończenie projektu: 2019-01-15

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  1. Drug-induced diabetes type 2: In silico study involving class B GPCRs IF: 2,766
    Autorzy:
    Dorota Latek, Ewelina Rutkowska, Szymon Niewieczerzal, Judyta Cielecka-Piontek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2019, tom: 14(1), strony: e0208892), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0208892 - link do publikacji
  2. Potential off-target effects of beta-blockers on gut hormone receptors: In silico study including GUT-DOCK—A web service for small-molecule docking IF: 2,766
    Autorzy:
    Pawel Pasznik, Ewelina Rutkowska, Szymon Niewieczerzal, Judyta Cielecka-Piontek, Dorota Latek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2019, tom: 14(1), strony: e0210705), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
  3. A hybrid approach to structure and function modeling of G protein-coupled receptors IF: 3,76
    Autorzy:
    D. Latek, M. Bajda, S. Filipek
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Information and Modeling (rok: 2016, tom: 56, strony: 630-641), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.5b00451 - link do publikacji
  4. GPCRM - a homology modeling web service with triple membrane-fitted quality assessment of GPCR models IF: 11,561
    Autorzy:
    Przemysław Miszta, Paweł Pasznik, Jakub Jakowiecki, Agnieszka Sztyler, Dorota Latek, Sławomir Filipek
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2018, tom: 46, strony: W387–W395), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gky429 - link do publikacji
  5. A Molecular Dynamics Study of Vasoactive Intestinal Peptide Receptor 1 and the Basis of Its Therapeutic Antagonism IF: 4,556
    Autorzy:
    Dorota Latek, Ingrid Langer,Krystiana A. Krzysko, Łukasz Charzewski
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2019, tom: 20(18), strony: 4348), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms20184348 - link do publikacji
  6. Rosetta Broker for membrane protein structure prediction: concentrative nucleoside transporter 3 and corticotropin-releasing factor receptor 1 test cases. IF: 1,771
    Autorzy:
    Dorota Latek
    Czasopismo:
    BMC Structural Biology (rok: 2017, tom: 0,713888888888889, strony: N/A), Wydawca: BIOMED CENTRAL LTD
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12900-017-0078-8 - link do publikacji
  1. Application of a membrane protein structure prediction web service GPCRM to a gastric inhibitory polypeptide receptor model
    Autorzy:
    Ewelina Rutkowska, Przemysław Miszta, Krzysztof Młynarczyk, Jakub Jakowiecki,Paweł Pasznik, Sławomir Filipek, Dorota Latek
    Konferencja:
    IWBBIO 2017 - 5th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (rok: 2017, ), Wydawca: Springer, Cham
    Data:
    konferencja 26-28 kwietnia 2017
    Status:
    Opublikowana
  2. Drug-induced diabetes risk reduction – in silico study involving gut hormone GPCR receptors
    Autorzy:
    Rutkowska Ewelina, Cielecka-Piontek Judyta, Niewieczerzal Szymon, Pasznik Paweł, Latek Dorota
    Konferencja:
    3rd Central European Biomedical Congress (rok: 2018, ), Wydawca: Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk w Krakowie, Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego
    Data:
    konferencja 15-18 września 2018
    Status:
    Opublikowana
  3. Gut hormone GPCRs as potential off-targets for beta-adrenoreceptor blocking agents
    Autorzy:
    Dorota Latek, Paweł Pasznik, Ewelina Rutkowska, Szymon Niewieczerzał, Judyta Cielecka-Piontek, Sławomir Filipek
    Konferencja:
    The Federation of the European Biochemical Societies (FEBS) Congress 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Press and John Wiley & Sons Ltd
    Data:
    konferencja 7-12 lipca 2018
    Status:
    Opublikowana