Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Proteom cynkowy w kontekście homeostazy jonów cynku - Identyfikacja oraz charakterystyka nowych domen cynkowych i ich rola w stabilizacji białek oraz oddziaływań białko-białko

2012/07/E/NZ1/01894

Słowa kluczowe:

homeostaza jonów cynku domena cynkowa palec cynkowy stabilność białek

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Artur Krężel 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: SONATA BIS 2 - ogłoszony 2012-09-15

Przyznana kwota: 1 499 040 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-07-02

Zakończenie projektu: 2018-05-01

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw komputerowy (komputer stacjonarny, monitor, klawiatura, mysz, drukarka) (2 szt.). Za kwotę 9 000 PLN
  2. Termostatujący inkubator bakteryjny. Za kwotę 45 000 PLN
  3. fluorymetr o wysokiej czułości z opcją pomiaru anizotropii fluorescencji wraz z przystawką typu Peltier.
  4. spektropolarymetr CD.
  5. Niskociśnieniwy system chromatograficzny do oczyszczania białek. Za kwotę 90 000 PLN
  6. System preparatywny HPLC z detektorem diodowym UV-Vis i fluorescencyjnym oraz autosamplerem. Za kwotę 340 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (17)
  1. The biological inorganic chemistry of zinc ions IF: 3,017
    Autorzy:
    Artur Krężel, Wolfgang Maret
    Czasopismo:
    Archives of Biochemistry and Biophysics (rok: 2016, tom: 611, strony: 44639), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.abb.2016.04.010 - link do publikacji
  2. The functions of metamorphic metallothioneins in zinc and copper metabolism IF: 3,226
    Autorzy:
    Artur Krężel, Wolfgang Maret
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2017, tom: 18, strony: 1237), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms18061237 - link do publikacji
  3. Metal binding properties, stability and reactivity of zinc fingers IF: 13,324
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Coordination Chemistry Reviews (rok: 2018, tom: 367, strony: 18-64), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ccr.2018.04.009 - link do publikacji
  4. Revisiting mitochondrial pH with an improved algorithm for calibration of the ratiometric 5(6)-carboxy-SNARF-1 probe reveals anticooperative reaction with H+ ions and warrants furter studies of organellar pH IF: 3,234
    Autorzy:
    Tomasz M. Żurawik, Adam Pomorski, Agnieszka Belczyk-Ciesielska, Grażyna Goch, Katarzyna Niedźwiedzka, Róża Kucharczyk, Artur Krężel, Wojciech Bal
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2016, tom: 11, strony: e0161353), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0161353 - link do publikacji
  5. Zinc clasp-based reversible toolset for selective metal-mediated protein heterodimerization IF: 6,164
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Chemical Communications (Camb.) (rok: 2018, tom: 54, strony: 13539-13542), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8cc06301j - link do publikacji
  6. Crosstalk of the structural and zinc buffering properties of mammalian metallothionein-2 IF: 3,978
    Autorzy:
    Agnieszka Drozd, Dominika Wojewska, Manuel David Peris-Diaz, Piotr Jakimowicz, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2018, tom: 10, strony: 595-613), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    1039/c7MT00332c - link do publikacji
  7. Metal binding properties of zinc fingers with a naturally altered metal binding site IF: 3,975
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2018, tom: 10, strony: 248-263), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c7mt00256d - link do publikacji
  8. Coordination Properties of Dithiobutylamine (DTBA), a Newly Introduced Protein Disulfide Reducing Agent IF: 4,794
    Autorzy:
    Justyna Adamczyk, Wojciech Bal, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Inorganic Chemistry (rok: 2015, tom: 54, strony: 596-606), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/ic5025026 - link do publikacji
  9. Interdependence of the Rad50 Hook and Globular Domain Functions IF: 14,464
    Autorzy:
    Marcel Hohl, Tomasz Kochańczyk, Cristina Tous, Andres Aguilera, Artur Krężel, John H.J. Petrini
    Czasopismo:
    Molecular Cell (rok: 2015, tom: 57, strony: 479-491), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.molcel.2014.12.018 - link do publikacji
  10. Metal binding properties of the zinc finger metallome – insights into variations in stability IF: 3,978
    Autorzy:
    Anna Miłoch, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2014, tom: 6, strony: 2015-2024), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c4mt00149d - link do publikacji
  1. Determination of the factors that drive high stability and heteroselectivity of CD4-Zn2+-Lck zinc clasp domain
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Konferencja:
    International Society for Zinc Biology ISZB 5-th meeting (rok: 2017, ), Wydawca: UCLan
    Data:
    konferencja 18-22.06
    Status:
    Opublikowana
  2. Hydrolytic properties and stability of sequentially divers bba zinc fingers
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Artur Krężel
    Konferencja:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Opublikowana
  3. Metal binding properties of distorted classical zinc fingers
    Autorzy:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Opublikowana
  4. Structure-stability relations in zinc proteins
    Autorzy:
    Artur Krężel, Anna Kocyła, Justyna Adamczyk, Miłosz Nowak, M. Padjasek, Tomasz Kochańczyk
    Konferencja:
    59 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2016, ), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 16-23.09
    Status:
    Opublikowana
  5. The hidden effect in the stability diversification of classical zinc fingers
    Autorzy:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Opublikowana
  6. Design of zinc baits as a tool for seeking out metal-mediated protein-protein interactions
    Autorzy:
    Iwona Mieszczak, Anna Kocyła, Artur Krężel
    Konferencja:
    X Parnas Conference Young Scientist Forum "Molecules in the Living Cell and Innovative Medicine" (rok: 2016, ), Wydawca: X Parnas Conference
    Data:
    konferencja 10-12.07
    Status:
    Opublikowana
  7. How proteins match Zn(II) affinity with their biological functions?
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Opublikowana
  8. Interplay between zinc coordination architecture and stability of zinc proteins - insights into zinc protein regulation
    Autorzy:
    T. Kochańczyk, A. Krężel
    Konferencja:
    9-th International Biometals Symposium (rok: 2014, ), Wydawca: Duke University
    Data:
    konferencja 13-18.07
    Status:
    Opublikowana
  9. Selective and highly stable Zn(II)-mediated protein-protein heterodimerization based on zinc clasp motif from CD4 coreceptor and Lck tyrosine-protein kinase
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Konferencja:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Opublikowana
  10. Zależność pomiędzy stabilnością, strukturą a funkcją białek cynkowych
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Opublikowana
  11. Zinc clasp peptide model as a protein heterodimerization system derived from CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase - through optimization to aaplication
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Konferencja:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Universytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Opublikowana
  12. Efficient protein heterodimerization system based in zinc clasp motif - from optimization to application
    Autorzy:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Konferencja:
    Chemical Biology 2016 (EMBO Conference) (rok: 2016, ), Wydawca: EMBO
    Data:
    konferencja 31.08-3.09
    Status:
    Opublikowana
  13. Structural and thermodynamic factors that control zinc protein stability and functionality
    Autorzy:
    Tomasz Kochańczyk, Justyna Adamczyk, Anna Miłoch, Agnieszka Drozd, Artur Krężel
    Konferencja:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Opublikowana
  14. The mystery of difference in classical zinc fingers
    Autorzy:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    Chemical Biology 2016 (EMBO Conference) (rok: 2016, ), Wydawca: EMBO
    Data:
    konferencja 31.08-3.09
    Status:
    Opublikowana
  15. Wpływ zmienności sekwencyjnej domen palców cynkowych bba na ich stabilność i właściwości hydrolityczne
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Konferencja:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Opublikowana
  16. Structural studies of Zn(II) binding to minimal zinc hook peptides
    Autorzy:
    M. Nowakowski, A. Ejchart, T. Kochańczyk, W. Koźmiński, D. Wojewska, A. Krężel
    Konferencja:
    4-th Annual Bio-NMR User Meeting (rok: 2014, ), Wydawca: Uniwersytet Warszawski
    Data:
    konferencja 05-08.05
    Status:
    Opublikowana
  17. Synthesis and characterization of naturally modified zinc finger peptides
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Artur Krężel
    Konferencja:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Uniwersytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Opublikowana