Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Exploration of zinc proteome - Identification and characterization of new zinc domains and their function in stabilization of proteins and protein-protein interactions

2012/07/E/NZ1/01894

Keywords:

zinc homeostasis zinc domain zinc finger protein stability

Descriptors:

  • NZ1_3: Biophysics
  • NZ1_4: Structural biology
  • ST4_13: Solid-state chemistry, surface physicochemistry

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Artur Krężel 

Number of co-investigators in the project: 7

Call: SONATA BIS 2 - announced on 2012-09-15

Amount awarded: 1 499 040 PLN

Project start date (Y-m-d): 2013-07-02

Project end date (Y-m-d): 2018-05-01

Project duration:: 58 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Zestaw komputerowy (komputer stacjonarny, monitor, klawiatura, mysz, drukarka) (2 szt.) (9 000 PLN)
  2. Termostatujący inkubator bakteryjny (45 000 PLN)
  3. fluorymetr o wysokiej czułości z opcją pomiaru anizotropii fluorescencji wraz z przystawką typu Peltier.
  4. spektropolarymetr CD.
  5. Niskociśnieniwy system chromatograficzny do oczyszczania białek (90 000 PLN)
  6. System preparatywny HPLC z detektorem diodowym UV-Vis i fluorescencyjnym oraz autosamplerem (340 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (10)
  • Articles in post-conference publications (17)
  1. Coordination Properties of Dithiobutylamine (DTBA), a Newly Introduced Protein Disulfide Reducing Agent
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Wojciech Bal, Artur Krężel
    Academic press:
    Inorganic Chemistry (rok: 2015, tom: 54, strony: 596-606), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/ic5025026 - link to the publication
  2. Interdependence of the Rad50 Hook and Globular Domain Functions
    Authors:
    Marcel Hohl, Tomasz Kochańczyk, Cristina Tous, Andres Aguilera, Artur Krężel, John H.J. Petrini
    Academic press:
    Molecular Cell (rok: 2015, tom: 57, strony: 479-491), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.molcel.2014.12.018 - link to the publication
  3. The functions of metamorphic metallothioneins in zinc and copper metabolism
    Authors:
    Artur Krężel, Wolfgang Maret
    Academic press:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2017, tom: 18, strony: 1237), Wydawca: MDPI
    Status:
    Published
    DOI:
    10.3390/ijms18061237 - link to the publication
  4. Metal binding properties of the zinc finger metallome – insights into variations in stability
    Authors:
    Anna Miłoch, Artur Krężel
    Academic press:
    Metallomics (rok: 2014, tom: 6, strony: 2015-2024), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c4mt00149d - link to the publication
  5. Metal binding properties, stability and reactivity of zinc fingers
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Academic press:
    Coordination Chemistry Reviews (rok: 2018, tom: 367, strony: 18-64), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.ccr.2018.04.009 - link to the publication
  6. Metal binding properties of zinc fingers with a naturally altered metal binding site
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Academic press:
    Metallomics (rok: 2018, tom: 10, strony: 248-263), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c7mt00256d - link to the publication
  7. The biological inorganic chemistry of zinc ions
    Authors:
    Artur Krężel, Wolfgang Maret
    Academic press:
    Archives of Biochemistry and Biophysics (rok: 2016, tom: 611, strony: 45370), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.abb.2016.04.010 - link to the publication
  8. Crosstalk of the structural and zinc buffering properties of mammalian metallothionein-2
    Authors:
    Agnieszka Drozd, Dominika Wojewska, Manuel David Peris-Diaz, Piotr Jakimowicz, Artur Krężel
    Academic press:
    Metallomics (rok: 2018, tom: 10, strony: 595-613), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Published
    DOI:
    1039/c7MT00332c - link to the publication
  9. Revisiting mitochondrial pH with an improved algorithm for calibration of the ratiometric 5(6)-carboxy-SNARF-1 probe reveals anticooperative reaction with H+ ions and warrants furter studies of organellar pH
    Authors:
    Tomasz M. Żurawik, Adam Pomorski, Agnieszka Belczyk-Ciesielska, Grażyna Goch, Katarzyna Niedźwiedzka, Róża Kucharczyk, Artur Krężel, Wojciech Bal
    Academic press:
    PLOS ONE (rok: 2016, tom: 11, strony: e0161353), Wydawca: PLOS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pone.0161353 - link to the publication
  10. Zinc clasp-based reversible toolset for selective metal-mediated protein heterodimerization
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Academic press:
    Chemical Communications (Camb.) (rok: 2018, tom: 54, strony: 13539-13542), Wydawca: Royal Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/c8cc06301j - link to the publication
  1. Hydrolytic properties and stability of sequentially divers bba zinc fingers
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Artur Krężel
    Conference:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Published
  2. Design of zinc baits as a tool for seeking out metal-mediated protein-protein interactions
    Authors:
    Iwona Mieszczak, Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    X Parnas Conference Young Scientist Forum "Molecules in the Living Cell and Innovative Medicine" (rok: 2016, ), Wydawca: X Parnas Conference
    Data:
    konferencja 10-12.07
    Status:
    Published
  3. Interplay between zinc coordination architecture and stability of zinc proteins - insights into zinc protein regulation
    Authors:
    T. Kochańczyk, A. Krężel
    Conference:
    9-th International Biometals Symposium (rok: 2014, ), Wydawca: Duke University
    Data:
    konferencja 13-18.07
    Status:
    Published
  4. Selective and highly stable Zn(II)-mediated protein-protein heterodimerization based on zinc clasp motif from CD4 coreceptor and Lck tyrosine-protein kinase
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Published
  5. Structure-stability relations in zinc proteins
    Authors:
    Artur Krężel, Anna Kocyła, Justyna Adamczyk, Miłosz Nowak, M. Padjasek, Tomasz Kochańczyk
    Conference:
    59 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2016, ), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 16-23.09
    Status:
    Published
  6. The mystery of difference in classical zinc fingers
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Conference:
    Chemical Biology 2016 (EMBO Conference) (rok: 2016, ), Wydawca: EMBO
    Data:
    konferencja 31.08-3.09
    Status:
    Published
  7. Zależność pomiędzy stabilnością, strukturą a funkcją białek cynkowych
    Authors:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Conference:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  8. Structural studies of Zn(II) binding to minimal zinc hook peptides
    Authors:
    M. Nowakowski, A. Ejchart, T. Kochańczyk, W. Koźmiński, D. Wojewska, A. Krężel
    Conference:
    4-th Annual Bio-NMR User Meeting (rok: 2014, ), Wydawca: Uniwersytet Warszawski
    Data:
    konferencja 05-08.05
    Status:
    Published
  9. Zinc clasp peptide model as a protein heterodimerization system derived from CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase - through optimization to aaplication
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Universytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Published
  10. How proteins match Zn(II) affinity with their biological functions?
    Authors:
    Anna Kocyła, Adam Pomorski, Agnieszka Drozd, Justyna Adamczyk, Tomasz Kochańczyk, Artur Krężel
    Conference:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Published
  11. Wpływ zmienności sekwencyjnej domen palców cynkowych bba na ich stabilność i właściwości hydrolityczne
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Conference:
    60 Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2017, ), Wydawca: Politechnika Wrocławska
    Data:
    konferencja 17-21.09
    Status:
    Published
  12. Determination of the factors that drive high stability and heteroselectivity of CD4-Zn2+-Lck zinc clasp domain
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    International Society for Zinc Biology ISZB 5-th meeting (rok: 2017, ), Wydawca: UCLan
    Data:
    konferencja 18-22.06
    Status:
    Published
  13. Efficient protein heterodimerization system based in zinc clasp motif - from optimization to application
    Authors:
    Anna Kocyła, Artur Krężel
    Conference:
    Chemical Biology 2016 (EMBO Conference) (rok: 2016, ), Wydawca: EMBO
    Data:
    konferencja 31.08-3.09
    Status:
    Published
  14. Metal binding properties of distorted classical zinc fingers
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Conference:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Published
  15. Structural and thermodynamic factors that control zinc protein stability and functionality
    Authors:
    Tomasz Kochańczyk, Justyna Adamczyk, Anna Miłoch, Agnieszka Drozd, Artur Krężel
    Conference:
    13th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry - ISABC13 (rok: 2015, ), Wydawca: NUI Galway
    Data:
    konferencja 12-15.07
    Status:
    Published
  16. Synthesis and characterization of naturally modified zinc finger peptides
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Artur Krężel
    Conference:
    24-th Polish Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Uniwersytet Gdański
    Data:
    konferencja 3-7.09
    Status:
    Published
  17. The hidden effect in the stability diversification of classical zinc fingers
    Authors:
    Justyna Adamczyk, Artur Krężel
    Conference:
    14-th International Conference on Applied Bioinorganic Chemistry (rok: 2017, ), Wydawca: University of Toulouse
    Data:
    konferencja 7-10.06
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy