Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Toksyczność RNA w patogenezie chorób poliglutaminowych

2012/06/A/NZ1/00094

Słowa kluczowe:

toksyczność RNA choroby poliglutaminowe powtórzenia trójnukleotydowe inkluzje RNA HD SCA3

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ1_5: Inżynieria genetyczna
  • NZ1_7: Inżynieria komórkowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Maciej Figiel 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: MAESTRO 3 - ogłoszony 2012-06-15

Przyznana kwota: 2 996 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-22

Zakończenie projektu: 2019-03-21

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Termocykler (2 szt) i aparat do hybrydyzacji "dot blot" z pompą.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (21)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Discriminating RNA variants with single-molecule allele-specific FISH
    Autorzy:
    Urbanek MO, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Mutation Research. Reviews in Mutation Research (rok: 2017, tom: 773, strony: 230-241), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.mrrev.2016.09.003 - link do publikacji
  2. Generation of human iPS cell line IBCHi002-A from spinocerebellar ataxia type 3/Machado-Joseph disease patient's fibroblasts
    Autorzy:
    Agata Ciolak, Wlodzimierz J Krzyzosiak, Emilia Kozlowska, Agnieszka Fiszer
    Czasopismo:
    Stem Cell Research (rok: 2020, tom: 45, strony: 101796), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.scr.2020.101796 - link do publikacji
  3. 2D and 3D FISH of expanded repeat RNAs in human lymphoblasts
    Autorzy:
    Urbanek MO, Michalak M, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2017, tom: 120, strony: 49-57), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ymeth.2017.04.002 - link do publikacji
  4. Modeling simple repeat expansion diseases with iPSC technology
    Autorzy:
    Jaworska E, Kozlowska E, Switonski PM, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2016, tom: 73, strony: 4085-4100), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-016-2284-0 - link do publikacji
  5. Nuclear speckles are detention centers for transcripts containing expanded CAG repeats
    Autorzy:
    Urbanek MO, Jazurek M, Switonski PM, Figura G, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease (rok: 2016, tom: 1862, strony: 1513-1520), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbadis.2016.05.015 - link do publikacji
  6. RNA FISH for detecting expanded repeats in human diseases
    Autorzy:
    Urbanek MO, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Methods (rok: 2015, tom: 2015, strony: S1046-2023), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ymeth.2015.11.017 - link do publikacji
  7. Sequence-non-specific effects generated by various types of RNA interference triggers
    Autorzy:
    Olejniczak M, Urbanek MO, Jaworska E, Witucki L, Szczesniak MW, Makalowska I, Krzyzosiak WJ.
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta (rok: 2015, tom: 1859(2), strony: 306–314), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2015.11.005 - link do publikacji
  8. siRNA release from pri-miRNA scaffolds is controlled by the sequence and structure of RNA
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Olejniczak M, Starega-Roslan J, Szczesniak MW, Makalowska I, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms (rok: 2016, tom: 1859, strony: 639-649), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2016.02.014 - link do publikacji
  9. Identifying proteins that bind to specific RNAs - focus on simple repeat expansion diseases
    Autorzy:
    Jazurek M, Ciesiolka A, Starega-Roslan J, Bilinska K, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9050-9070), Wydawca: OXFORD ACADEMIC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw803 - link do publikacji
  10. Current understanding of the role of microRNAs in spinocerebellar ataxias
    Autorzy:
    Edyta Koscianska and Wlodzimierz J Krzyzosiak
    Czasopismo:
    Cerebellum and Ataxias (rok: 2014, tom: 0,0465277777777778, strony: bd), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/2053-8871-1-7 - link do publikacji
  11. In Vitro Expansion of CAG, CAA, and Mixed CAG/CAA Repeats
    Autorzy:
    Figura G, Koscianska E, Krzyzosiak WJ.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2015, tom: 16(8), strony: 18741-18751), Wydawca: MDPI AG
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms160818741 - link do publikacji
  12. RAN translation and frameshifting as translational challenges at simple repeats of human neurodegenerative disorders
    Autorzy:
    Wojciechowska M, Olejniczak M, Galka-Marciniak P, Jazurek M, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42(19), strony: 11849-64), Wydawca: Oxford Univ Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku794 - link do publikacji
  13. Small RNA Detection by in Situ Hybridization Methods
    Autorzy:
    Urbanek MO, Nawrocka AU, Krzyzosiak WJ.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2015, tom: 16(6), strony: 13259-13286), Wydawca: MDPI AG
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms160613259 - link do publikacji
  14. miRNAmotif—A Tool for the Prediction of Pre-miRNA–Protein Interactions
    Autorzy:
    Urbanek-Trzeciak MO, Jaworska E, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 4075), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19124075 - link do publikacji
  15. Cooperation meets competition in microRNA-mediated DMPK transcript regulation
    Autorzy:
    Koscianska E, Witkos TM, Kozlowska E, Wojciechowska M, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 9500-9518), Wydawca: OXFORD UNIV PRESS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkv849 - link do publikacji
  16. Nuclear speckles: molecular organization, biological function and role in disease
    Autorzy:
    Galganski L, Urbanek MO, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 10350-10368), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkx759 - link do publikacji
  17. RAN Translation of the Expanded CAG Repeats in the SCA3 Disease Context
    Autorzy:
    Magdalena Jazurek-Ciesiolka, Adam Ciesiolka, Alicja A.Komur, Martyna O.Urbanek-Trzeciak, Wlodzimierz J.Krzyzosiak, AgnieszkaFiszer
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Biology (rok: 2020, tom: 432, strony: 166699), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  18. RNA imaging in living cells - methods and applications
    Autorzy:
    Urbanek MO, Galka-Marciniak P, Olejniczak M, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2014, tom: 3;11(8), strony: 1083-95), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/rna.35506 - link do publikacji
  19. Reduction of Huntington's Disease RNA Foci by CAG Repeat-Targeting Reagents
    Autorzy:
    Urbanek MO, Fiszer A, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 82), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fncel.2017.00082 - link do publikacji
  20. Structural Characteristics of Simple RNA Repeats Associated with Disease and their Deleterious Protein Interactions
    Autorzy:
    Ciesiolka A, Jazurek M, Drazkowska K, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    Frontiers in Cellular Neuroscience (rok: 2017, tom: 11, strony: 97), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fncel.2017.00097 - link do publikacji
  21. The role of the immune system in triplet repeat expansion diseases.
    Autorzy:
    Olejniczak M, Urbanek MO, Krzyzosiak WJ.
    Czasopismo:
    Mediators of Inflammation (rok: 2015, tom: -, strony: 873860), Wydawca: HINDAWI PUBLISHING CORPORATION
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1155/2015/873860 - link do publikacji
  1. MicroRNA deregulation in trinucleotide repeat expansion disorders
    Autorzy:
    Koscianska E, Kozlowska E, Jaworska E, Krzyzosiak WJ.
    Książka:
    Applied RNAi: From Fundamental Research to Therapeutic Applications (rok: 2014, tom: bd, strony: 227-246), Wydawca: Caister Academic Press
    Status:
    Opublikowana