Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Algorytmy dla problemu dopasowania wielu sekwencji oraz problemów pokrewnych

2012/05/N/ST6/03158

Słowa kluczowe:

dopasowanie wielu sekwencji algorytmy równoległe GPGPU

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Adam Gudyś 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 3 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 80 520 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-25

Zakończenie projektu: 2016-09-24

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer obliczeniowy. Za kwotę 16 000 PLN
  2. Oprogramowanie. Za kwotę 5 000 PLN
  3. Komputer przenośny.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  1. QuickProbs - A Fast Multiple Sequence Alignment Algorithm Designed for Graphics Processors IF: 3,73
    Autorzy:
    Adam Gudyś, Sebastian Deorowicz
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2014, tom: 9(2), strony: e88901), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0088901 - link do publikacji
  2. QuickProbs 2: towards rapid construction of high-quality alignments of large protein families IF: 5,228
    Autorzy:
    Adam Gudyś, Sebastian Deorowicz
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: article no. 41553), Wydawca: Nature Research
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep41553 - link do publikacji
  3. FAMSA: Fast and accurate multiple sequence alignment of huge protein families IF: 5,228
    Autorzy:
    Sebastian Deorowicz, Agnieszka Debudaj-Grabysz, Adam Gudyś
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: article no. 33964), Wydawca: Nature Research
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep33964 - link do publikacji