Trójwymiarowa mikroskopia superrozdzielcza do badania zmian struktury chromatyny komórek nerwowych pod wpływem stresu epileptycznego.
2012/05/E/ST2/02180
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST6_8: Grafika komputerowa, przetwarzanie obrazów, wizualizacja komputerowa, multimedia, gry komputerowe
- NZ3_6: Neurobiologia komórkowa
- ST2_8: Optyka i optyka kwantowa
Panel
ST2 – Podstawowe składniki materii: fizyka cząstek elementarnych, jądrowa, plazmy, atomowa, molekularna, gazów i optyczna
Jednostka realizująca
Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 3
Konkurs
SONATA BIS 1 – ogłoszony 2012-03-15
- Przyznana kwota
- 1 496 000 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2013-03-07
- Zakończenie projektu
- 2018-03-06
- Planowany czas trwania projektu
- 60 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Detektor mikroskopowy (kamera). Za kwotę 5 198 PLN
- Komora laminarna i cieplarka.. Za kwotę 50 000 PLN
- Lasery.. Za kwotę 60 343 PLN
- Mikroskop wyposażony w: obiektywy, soczewki tubusa, macierze mikrosoczewek, filtry fluorescencyjne, stół antywibracyjny.. Za kwotę 180 000 PLN
- Stacja robocza PC.. Za kwotę 30 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (13)
-
Application of detector precision characteristics for the denoising of biological micrographs in the wavelet domain.
- Autorzy:
- T. Bernas, R. Starosolski, R. Wójcicki
- Czasopismo:
- Biomedical Signal Processing and Control (rok: 2015, tom: 19, strony: 46035), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.bspc.2015.02.010 – link do publikacji
-
Increasing microscopy resolution with photobleaching and intensity cumulant analysis.
- Autorzy:
- W. Brutkowski, D. Dziob, T. Bernas
- Czasopismo:
- Micr. Res. Tech. (rok: 2015, tom: 78(11), strony: 958-68), Wydawca: Wiley Periodicals, Inc.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jemt.22559 – link do publikacji
-
Substitution of Metallocenes with [2.2]Paracyclophane to Enable Confocal Microscopy Imaging in Living Cells.
- Autorzy:
- J. Skiba, C. Schmidt, P. Lipmann, P. Ensllen, A. Wagenknecht, R. Czerwieniec, F. Brandl, I. Ott, T. Bernas, B. Krawczyk, D. Szczukocki, K. Kowalski
- Czasopismo:
- Eur. J. Inorg. Chemistry (rok: 2016, tom: 2017(2), strony: 297-305), Wydawca: Wiley Periodicals, Inc.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/ejic.201600281 – link do publikacji
-
Luminescent rhenium(I)–chromone bioconjugate: Synthesis, photophysical properties, and confocal luminescence microscopy investigation.
- Autorzy:
- K. Kowalski, L. Szczupak, T. Bernas, R. Czerwieniec
- Czasopismo:
- J. Organometallic. Chemistry (rok: 2015, tom: 782 (15), strony: 124 - 130), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.jorganchem.2015.01.017 – link do publikacji
-
Analysis of spatial correlations between patterns of DNA Damage Response and DNA replication in nuclei of cells subjected to replication stress or oxidative damage.
- Autorzy:
- T. Bernas, K. Berniak, P. Rybak, M. Zarębski, H. Zhao, Z. Darzynkiewicz, J. W. Dobrucki.
- Czasopismo:
- Cytometry (rok: 2013, tom: 83 (10), strony: 925 - 932), Wydawca: Willey
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/cyto.a.22325 – link do publikacji
-
Relationship between DNA damage response, initiated by camptothecin or oxidative stress, and DNA replication, analyzed by quantitative 3D image analysis.
- Autorzy:
- 2.K. Berniak, P. Rybak, T. Bernas, M. Zarębski, E. Biela, H. Zhao, Z. Darzynkiewicz, J. W. Dobrucki.
- Czasopismo:
- Cytometry (rok: 2013, tom: 83 (10), strony: 913 - 924), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/cyto.a.22327 – link do publikacji
-
Inhibition of stearoyl-CoA desaturase impairs palmitate-derived autophagy at the step of autophagosome-lysosome fusion in pancreatic beta-cells
- Autorzy:
- J. Janikiewicz, K. Hanzelka, A. Dziewulska, K. Kozinski, P. Dobrzyn, T. Bernas, A. Dobrzyn
- Czasopismo:
- J. Lipid. Res. (rok: 2015, tom: 56(10), strony: 1901-1911), Wydawca: ASBMB
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1194/jlr.M059980 – link do publikacji
-
Spatial heterogeneity of dynamics of H1 linker histone.
- Autorzy:
- T. Bernas, W. Brutkowski, M. Zarebski, J. Dobrucki
- Czasopismo:
- European Journal of Biophysics (rok: 2014, tom: 43, strony: 287-300), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00249-014-0962-0 – link do publikacji
-
Quality of biological images, reconstructed using localization microscopy data.
- Autorzy:
- B. Ruszczycki, T. Bernas
- Czasopismo:
- Bioinformatics (rok: 2018, tom: 34(5), strony: 845-852), Wydawca: Oxford Academic
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/bioinformatics/btx597 – link do publikacji
-
Some chemotherapeutics-treated colon cancer cells display a specific phenotype being a combination of stem-like and senescent cell features
- Autorzy:
- H. Was; J. Czarnecka; A. Kowalczyk; K. Barszcz; T. Bernas; K. Piwocka, B. Kaminska
- Czasopismo:
- Cancer. Biol. Therap. (rok: 2018, tom: 19(1), strony: 63-75), Wydawca: Taylor & Francis
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1080/15384047.2017.1385675. – link do publikacji
-
Pyrene–nucleobase conjugates: synthesis, oligonucleotide binding and confocal bioimaging studies.
- Autorzy:
- A. Jablonski, Y. Fritz, A. Wagenknecht, R. Czerwieniec, T. Bernas, D. Trzybinski, K. Wozniak, K. Kowalski
- Czasopismo:
- Beilstein J. Org. Chem. (rok: 2017, tom: 13, strony: 2521–2534), Wydawca: Beilstein
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3762/bjoc.13.249 – link do publikacji
-
Low level phosphorylation of histone H2AX on serine 139 (γH2AX) is not associated with DNA double-strand breaks.
- Autorzy:
- P. Rybak, A. Hoang, L. Bujnowicz, T. Bernas, K. Berniak, M. Zarebski, Z. Darzynkiewicz, J. Dobrucki
- Czasopismo:
- Oncotarget (rok: 2016, tom: 7(31), strony: 49574-49587), Wydawca: Impact Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.18632/oncotarget.10411 – link do publikacji
-
Bafilomycin A1 triggers proliferative potential of senescent cancer cells in vitro and in NOD/SCID mice.
- Autorzy:
- H. Was, K. Barszcz, J. Czarnecka, A. Kowalczyk, T. Bernas, E. Uzarowska, P. Koza, A. Klejman, K. Piwocka, B. Kaminska, E. Sikora.
- Czasopismo:
- Oncotarget (rok: 2016, tom: 8(6), strony: 9303-9322), Wydawca: Impact Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.18632/oncotarget.14066 – link do publikacji