Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowe reagenty i metody w syntezie modyfikowanych nukleotydów oraz ich wykorzystanie do otrzymywania narzędzi biochemicznych i nukleotydów o dużym potencjale terapeutycznym

2012/05/E/ST5/03893

Słowa kluczowe:

synteza nukleotydów 5' mRNA kap reakcje typu click synteza modyfikowanych oligofosforanów biosynteza białka

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_11: Synteza biomateriałów
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Jacek Jemielity 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: SONATA BIS 1 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 1 479 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-15

Zakończenie projektu: 2018-03-14

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (17)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Analysis of Decapping Scavenger (DcpS)-cap complex using modified cap analogs reveals molecular determinants for efficient cap binding IF: 4,25
    Autorzy:
    Anna Wypijewska del Nogal, Marius D. Surleac, Joanna Kowalska, Maciej Lukaszewicz, Jacek Jemielity, Martin Bisaillon, Edward Darzynkiewicz, Adina L. Milac, Elzbieta Bojarska
    Czasopismo:
    FEBS Journal (rok: 2013, tom: 280, strony: 6508-6527), Wydawca: WILEY-BLACKWELL, 111 RIVER ST, HOBOKEN 07030-5774, NJ USA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/febs.12553 - link do publikacji
  2. Cap analogs containing 6-thioguanosine – reagents for the synthesis of mRNAs selectively photo-crosslinkable with cap-binding biomolecules IF: 3,487
    Autorzy:
    Monika Nowakowska, Joanna Kowalska, Franck Martin, Arnaud d'Orchymont, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Edward Darzynkiewicza and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Org. Biomol. Chem. (rok: 2014, tom: 12, strony: 4841–4847), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c4ob00059e - link do publikacji
  3. Potential therapeutic applications of RNA cap analogs IF: 3,31
    Autorzy:
    Marcin Ziemniak, Malwina Strenkowska, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Future Medicinal Chemistry (rok: 2013, tom: 5, strony: 1141-1172), Wydawca: FUTURE SCI LTD, UNITED HOUSE, 2 ALBERT PL, LONDON, N3 1QB, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4155/fmc.13.96) - link do publikacji
  4. mRNA cap analogues substituted in the tetraphosphate chain with CX2: identification of O-to-CCl2 as the first bridging modification that confers resistance to decapping without impairing translation IF: 9,338
    Autorzy:
    Anna M. Rydzik, Marcin Warminski, Pawel J. Sikorski, Marek R. Baranowski, Sylwia Walczak, Joanna Kowalska, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Elzbieta Nowak, Timothy D. W. Claridge, Edward Darzynkiewicz, Marcin Nowotny, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 8661-8675), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkx569 - link do publikacji
  5. Cap analogs modified with 1,2-dithiodiphosphate moiety protect mRNA from decapping and enhance its translational potential IF: 9,202
    Autorzy:
    Malwina Strenkowska, Renata Grzela, Maciej Majewski, Katarzyna Wnek, Joanna Kowalska, Maciej Lukaszewicz, Joanna Zuberek, Edward Darzynkiewicz, Andreas N Kuhn, Ugur Sahin, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9578-9590), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw896 - link do publikacji
  6. Fluorescent HTS assay for phosphohydrolases based on nucleoside 5ʹ-fluorophosphates: application in screening for inhibitors of mRNA Decapping Scavenger and PDE-I IF: 3,559
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Anna Nowicka, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2016, tom: 14, strony: 4595-4604), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6ob00492j - link do publikacji
  7. Structural basis of mRNA-cap recognition by Dcp1–Dcp2 IF: 13,338
    Autorzy:
    Jeffrey S. Mugridge, Marcin Ziemniak, Jacek Jemielity, John D. Gross
    Czasopismo:
    Nature Structural & Molecular Biology (rok: 2016, tom: 23, strony: 987-994), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/nsmb.3301 - link do publikacji
  8. Clickable trimethylguanosine cap analogs modified within the triphosphate bridge: synthesis, conjugation to RNA and susceptibility to degradation IF: 3,84
    Autorzy:
    Blazej A. Wojtczak, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Malgorzata Honcharenko, C. I. Edvard Smith, Roger Stromberg, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2016, tom: 6, strony: 8317-8328), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c5ra25684d - link do publikacji
  9. Five eIF4E isoforms from Arabidopsis thaliana are characterized by distinct features of cap analogs binding IF: 2,281
    Autorzy:
    Anna Kropiwnicka, Krzysztof Kuchta, Maciej Lukaszewicz, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Krzysztof Ginalski, Edward Darzynkiewicz, Joanna Zuberek
    Czasopismo:
    Biochemical and Biophysical Research Communications (rok: 2015, tom: 456, strony: 47-52), Wydawca: Elsevier Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbrc.2014.11.032 - link do publikacji
  10. The synthesis of isopropylidene mRNA cap analogs modified with phosphorothioate moiety and their evaluation as promoters of mRNA translation IF: 2,338
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Janina Buck, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Corina Nicola, Andreas N. Kuhn , Ugur Sahin, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (rok: 2013, tom: 23, strony: 3753-3758), Wydawca: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, THE BOULEVARD, LANGFORD LANE, KIDLINGTON, OXFORD OX5 1GB, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmcl.2013.05.001 - link do publikacji
  11. A novel route for preparing 5′ cap mimics and capped RNAs: phosphate-modified cap analogues obtained via click chemistry IF: 9,144
    Autorzy:
    Sylwia Walczak, Anna Nowicka, Dorota Kubacka, Kaja Fac, Przemyslaw Wanat, Seweryn Mroczek, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Chemical Science (rok: 2017, tom: 8, strony: 260-267), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6sc02437h - link do publikacji
  12. Ethynyl, 2-Propynyl, and 3-Butynyl C-Phosphonate Analogues of Nucleoside Di- and Triphosphates: Synthesis and Reactivity in CuAAC IF: 6,364
    Autorzy:
    Przemyslaw Wanat, Sylwia Walczak, Blazej A. Wojtczak, Monika Nowakowska, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Organic Letters (rok: 2015, tom: 17, strony: 3062-3065), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.orglett.5b01346 - link do publikacji
  13. Synthesis and evaluation of fluorescent cap analogues for mRNA labelling IF: 2,562
    Autorzy:
    Marcin Ziemniak, Mariusz Szabelski, Maciej Lukaszewicz, Anna Nowicka, Edward Darzynkiewicz, Zbigniew Wieczorek, Robert E. Rhoads, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2013, tom: 3, strony: 20943-20958), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY, THOMAS GRAHAM HOUSE, SCIENCE PARK, MILTON RD, CAMBRIDGE CB4 0WF, CAMBS, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c3ra42769b - link do publikacji
  14. Synthesis, properties, and biological activity of boranophosphate analogs of the mRNA cap: versatile tools for manipulation of therapeutically relevant cap-dependent processes IF: 8,808
    Autorzy:
    Joanna Kowalska, Anna Wypijewska del Nogal, Zbigniew M. Darzynkiewicz, Janina Buck, Corina Nicola, Andreas N. Kuhn, Maciej Lukaszewicz, Joanna Zuberek, Malwina Strenkowska, Marcin Ziemniak, Maciej Maciejczyk, Elzbieta Bojarska, Robert E. Rhoads, Edward Darzynkiewicz, Ugur Sahin and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 10245–10264), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku757 - link do publikacji
  15. Synthetic m3G-CAP attachment necessitates a minimum trinucleotide constituent to be recognised as a nuclear import signal IF: 3,289
    Autorzy:
    Malgorzata Honcharenko, Burcu Bestas, Martina Jezowska, Blazej A Wojtczak, Pedro Moreno, Joanna Romanowska, Susanna M Bächle, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity, C. I. Edvard Smith, Roger Stromberg
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2016, tom: 6, strony: 51367-51373), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C6RA09568B - link do publikacji
  16. Roquin targets mRNAs in a 3′-UTR-specific manner by different modes of regulation IF: 11,878
    Autorzy:
    Katharina Essig, Nina Kronbeck, Joao C. Guimaraes, Claudia Lohs, Andreas Schlundt, Anne Hoffmann, Gesine Behrens, Sven Brenner, Joanna Kowalska, Cristina Lopez-Rodriguez, Jacek Jemielity, Helmut Holtmann, Kristin Reiche, Jörg Hackermüller, Michael Sattler, Mihaela Zavolan , Vigo Heissmeyer
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2018, tom: 9, strony: 3810), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP, MACMILLAN BUILDING, 4 CRINAN ST, LONDON N1 9XW, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-018-06184-3 - link do publikacji
  17. Synthesis of Fluorophosphate Nucleotide Analogues and Their Characterization as Tools for 19F NMR Studies IF: 4,721
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Anna Nowicka, Anna M. Rydzik, Marcin Warmiński, Renata Kasprzyk, Błażej A. Wojtczak, Jacek Wójcik, Timothy D. W. Claridge, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    The Journal of Organic Chemistry (rok: 2015, tom: 80, strony: 3982-3997), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs,joc.5b00337 - link do publikacji
  1. Synthetic Capped mRNAs for Cap-Specific Photo-Cross-Linking Experiments
    Autorzy:
    Joanna Kowalska, Franck Martin, Jacek Jemielity
    Książka:
    Synthetic mRNA: Production, Introduction Into Cells, and Physiological Consequences (rok: 2016, tom: 1428, strony: 31-43), Wydawca: Springer Science+Business Media
    Status:
    Opublikowana