Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Genetyczna analiza korelacji polimorfizmu nukleotydowego ze zmiennością adaptacyjną i historią populacji w europejskim zasięgu gatunków sosen Pinus sylvestris i Pinus mugo

2012/05/E/NZ9/03476

Słowa kluczowe:

molekularna genetyka populacyjna markery molekularne SNPs naturalna selekcja

Deskryptory:

  • NZ9_3: Naukowe podstawy leśnictwa
  • NZ9_12: Ochrona zasobów genetycznych

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Instytut Dendrologii PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Witold Wachowiak 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 1 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 1 486 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-12

Zakończenie projektu: 2019-10-11

Planowany czas trwania projektu: 79 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Wirówka typy Eppendorf 5804R z rotorem na mikropłytki (AZDWP) i aerozoloszczelnym rotorem na probówki typu Eppendorf (F453011). Za kwotę 33 000 PLN
  2. Zestaw komputerowy. Za kwotę 9 766 PLN
  3. Trzy komputery o odpowiedniej mocy (typu Dell Latitude - E6220) z oprzyrządowaniem (3 szt.). Za kwotę 17 490 PLN
  4. oprogramowanie komputerowe CodonCode Aligner.
  5. Pakiet komputerowy ENDNOTE. Za kwotę 5 510 PLN
  6. Termocykler (typu DNA Engine Biorad C1000 Touch). Za kwotę 48 000 PLN
  7. termowytrząsarka (termomixer).
  8. zestaw komputerowy (komputer z drukarką).

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (17)
  1. High genetic similarity between Polish and North European Scots pine (Pinus sylvestris L.) populations at nuclear gene loci.
    Autorzy:
    Wachowiak, Witold; Wόjkiewicz, Błażej; Cavers, Stephen; Lewandowski, Andrzej
    Czasopismo:
    Tree Genetics & Genomes (rok: 2014, tom: 10, strony: 10: 1015-1025), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11295-014-0739-8 - link do publikacji
  2. Interspecific gene flow and ecological selection in a pine (Pinus sp.) contact zone.
    Autorzy:
    Wachowiak Witold, Stephen Cavers, Weronika B. Żukowska.
    Czasopismo:
    Plant Systematics and Evolution (rok: 2014, tom: 12, strony: 45301), Wydawca: Springer Vienna
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00606-014-1182-x - link do publikacji
  3. Utility of closely related taxa for genetic studies of adaptive variation and speciation: Current state and perspectives in plants with focus on forest tree species.
    Autorzy:
    Weronika B. Żukowska, Witold Wachowiak
    Czasopismo:
    Journal of Systematics and Evolution (rok: 2016, tom: 54, strony: 17-28), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/jse.12177 - link do publikacji
  4. Contrasting patterns of genetic variation in core and peripheral populations of highly outcrossing and wind pollinated forest tree species.
    Autorzy:
    Wójkiewicz B., Litkowiec M., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    AoB Plants (rok: 2016, tom: 8, strony: plw054), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/aobpla/plw054 - link do publikacji
  5. Cross-amplification and multiplexing of cpSSRs and nSSRs in two closely related pine species (Pinus sylvestris L. and P. mugo Turra).
    Autorzy:
    Żukowska WB., Wójkiewicz B., Litkowiec M., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Dendrobiology (rok: 2017, tom: 77, strony: 59-64), Wydawca: Bogucki Wydawnictwo Naukowe S.C.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.12657/denbio.077.005 - link do publikacji
  6. Heterogeneous patterns of genetic variation at nuclear genes and quantitative traits in Scots pine provenance trial.
    Autorzy:
    Hebda A., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Acta Societatis Botanicorum Poloniae (rok: 2019, tom: 88(2):3623., strony: 45305), Wydawca: Polish Botanical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5586/asbp.3623 - link do publikacji
  7. Long-term growth performance and productivity of Scots pine (Pinus sylvestris L.) populations.
    Autorzy:
    Hebda AM., Wachowiak W., Skrzyszewski J.
    Czasopismo:
    Acta Societatis Botanicorum Poloniae (rok: 2017, tom: 86(1), strony: 3521), Wydawca: Polish Botanical Society
    Status:
    Opublikowana
  8. Reconstructing the plant mitochondrial genome for marker discovery: a case study using Pinus.
    Autorzy:
    Donnelly K., Cottrell J., Ennos RA., Vendramin GG., A'Hara S., King S. Perry A., Wachowiak W., Cavers S.
    Czasopismo:
    Molecular Ecology Resources (rok: 2017, tom: 17, strony: 943–954), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/1755-0998.12646 - link do publikacji
  9. Zróżnicowanie fenotypowe i zmienność tła genetycznego polskich proweniencji sosny zwyczajnej
    Autorzy:
    Hebda A., Skrzyszewski J., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Sylwan (rok: 2017, tom: 161 (4), strony: 277-286), Wydawca: Polish Forestry Society
    Status:
    Opublikowana
  10. Early phenology and growth trait variation in closely related European pine species.
    Autorzy:
    Wachowiak W., Perry A., Donnelly K., Cavers S.
    Czasopismo:
    Ecology and Evolution (rok: 2018, tom: 8, strony: 655–666), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/ece3.3690 - link do publikacji
  11. Hybridization in contact zone between temperate European pine species.
    Autorzy:
    Wachowiak W., Żukowska WB., Wójkiewicz B., Cavers S., Litkowiec M.
    Czasopismo:
    Tree Genetics & Genomes (rok: 2016, tom: 0,533333333333333, strony: 45303), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11295-016-1007-x - link do publikacji
  12. Substructuring of Scots pine in Europe based on polymorphism at chloroplast microsatellite loci.
    Autorzy:
    Wójkiewicz BW, Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Flora (rok: 2016, tom: 220, strony: 142-149), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.flora.2016.03.005 - link do publikacji
  13. Comparative transcriptomics of a complex of four European pine species.
    Autorzy:
    Witold Wachowiak, Urmi Trivedi, Annika Perry, Stephen Cavers
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2015, tom: 0,829166666666667, strony: 45300), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12864-015-1401-z - link do publikacji
  14. Comparison of range-wide chloroplast microsatellite and needle trait variation patterns in Pinus mugo Turra (dwarf mountain pine).
    Autorzy:
    Żukowska B. Weronika, Boratyńska Krystyna, Wachowiak Witold
    Czasopismo:
    iForest - Biogeosciences and Forestry (rok: 2017, tom: 10, strony: 250-258), Wydawca: Italian Society of Silviculture and Forest Ecology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3832/ifor1860-009 - link do publikacji
  15. Current approaches and perspectives in population genetics of Scots pine (Pinus sylvestris L.).
    Autorzy:
    Wójkiewicz BW, Cavers S, Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Forest Science (rok: 2016, tom: 62 (3), strony: 343-354), Wydawca: Society of American Foresters
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5849/forsci.15-040 - link do publikacji
  16. Genetic characteristics of Scots pine (Pinus sylvestris L.) in Poland and reference populations based on nuclear and chloroplast microsatellite loci markers.
    Autorzy:
    Hebda AM., Wójkiewicz B., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Silva Fennica (rok: 2017, tom: 51 (2), strony: 45308), Wydawca: Finnish Society of Forest Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14214/sf.1721 - link do publikacji
  17. Nuclear microsatellite markers reveal the low genetic structure of Pinus mugo Turra (dwarf mountain pine) populations in Europe
    Autorzy:
    Żukowska WB., Wachowiak W.
    Czasopismo:
    Plant Systematics and Evolution (rok: 2017, tom: 303, strony: 641-651), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana