Całościowe przewidywanie kooperatywnych elementów regulatorowych w genomach eukariotycznych
2011/03/N/NZ2/03177
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 2 – ogłoszony 2011-09-15
- Przyznana kwota
- 79 100 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2012-09-18
- Zakończenie projektu
- 2014-09-17
- Planowany czas trwania projektu
- 24 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Notebook Sony Vaio SVS1312R9EB. Za kwotę 5 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (3)
-
Comprehensive prediction in 78 human cell lines reveals rigidity and compactness of transcription factor dimers
- Autorzy:
- Aleksander Jankowski, Ewa Szczurek, Ralf Jauch, Jerzy Tiuryn, Shyam Prabhakar
- Czasopismo:
- Genome Research (rok: 2013, tom: 23(8), strony: 1307-18), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1101/gr.154922.113 – link do publikacji
-
SOXE transcription factors form selective dimers on non-compact DNA motifs through multifaceted interactions between dimerization and high-mobility group domains
- Autorzy:
- Yong-Heng Huang, Aleksander Jankowski, Kathryn S. E. Cheah, Shyam Prabhakar, Ralf Jauch
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 10398), Wydawca: Nature Publishing Group
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep10398 – link do publikacji
-
TACO: a general-purpose tool for predicting cell-type–specific transcription factor dimers
- Autorzy:
- Aleksander Jankowski, Shyam Prabhakar, Jerzy Tiuryn
- Czasopismo:
- BMC Genomics (rok: 2014, tom: 15, strony: 208), Wydawca: BioMed Central
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/1471-2164-15-208 – link do publikacji