Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Całościowe przewidywanie kooperatywnych elementów regulatorowych w genomach eukariotycznych

2011/03/N/NZ2/03177

Słowa kluczowe:

czynniki transkrypcyjne kooperatywne wiązanie specyficzność dla typów komórek obszary regulatorowe otwartość chromatyny DNase-seq modyfikacje epigenetyczne

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Aleksander Jankowski 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 79 100 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-18

Zakończenie projektu: 2014-09-17

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Notebook Sony Vaio SVS1312R9EB. Za kwotę 5 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  1. SOXE transcription factors form selective dimers on non-compact DNA motifs through multifaceted interactions between dimerization and high-mobility group domains IF: 5,578
    Autorzy:
    Yong-Heng Huang, Aleksander Jankowski, Kathryn S. E. Cheah, Shyam Prabhakar, Ralf Jauch
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 10398), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep10398 - link do publikacji
  2. TACO: a general-purpose tool for predicting cell-type–specific transcription factor dimers IF: 4,4
    Autorzy:
    Aleksander Jankowski, Shyam Prabhakar, Jerzy Tiuryn
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2014, tom: 15, strony: 208), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1471-2164-15-208 - link do publikacji
  3. Comprehensive prediction in 78 human cell lines reveals rigidity and compactness of transcription factor dimers IF: 14,397
    Autorzy:
    Aleksander Jankowski, Ewa Szczurek, Ralf Jauch, Jerzy Tiuryn, Shyam Prabhakar
    Czasopismo:
    Genome Research (rok: 2013, tom: 23(8), strony: 1307-18), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1101/gr.154922.113 - link do publikacji