Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania desulfuracji 2-tiourydyn w kontekście uszkodzeń tRNA w warunkach stresu oksydacyjnego

2011/03/B/ST5/02669

Słowa kluczowe:

2-tiourydyna desulfuracja tRNA stress oksydacyjny uszkodzenia tRNA w stresie oksydacyjnym

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

woj. łódzkie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Barbara Nawrot 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 842 100 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-05

Zakończenie projektu: 2015-09-04

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Pompa olejowa.
  2. Pompa próżniowa. Za kwotę 8 000 PLN
  3. Miernik ph. Za kwotę 4 000 PLN
  4. SciFinder. Za kwotę 5 000 PLN
  5. Wirówka do odparowań. Za kwotę 15 000 PLN
  6. Wyparka rotacyjna. Za kwotę 15 000 PLN
  7. Zestaw HPLC. Za kwotę 240 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
  1. Transformation of a wobble 2-thiouridine to 2-selenouridine via S-geranyl-2-thiouridine as a possible cellular pathway
    Autorzy:
    Paulina Bartos, Anna Maciaszek, Anna Rosinska, Elzbieta Sochacka, Barbara Nawrot
    Czasopismo:
    Bioorganic Chemistry (rok: 2014, tom: 56, strony: 49-53), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bioorg.2014.05.012 - link do publikacji
  2. 2-Thiouracil deprived of thiocarbonyl function preferentially base pairs with guanine rather than adenine in RNA and DNA duplexes
    Autorzy:
    E. Sochacka, R. H. Szczepanowski, M. Cypryk, M. Sobczak, M. Janicka, K. Kraszewska, P. Bartos, A. Chwialkowska, B. Nawrot
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 2499-2512), Wydawca: Oxford Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkv109 - link do publikacji
  3. Guanosine in a single stranded region of anticodon stem-loop tRNA models is prone to oxidative damage resulting in dehydroguanidinohydantoin and spiroiminodihydantoin lesions
    Autorzy:
    Agnieszka Tomaszewska-Antczak, Piotr Guga, Barbara Nawrot, Geneviève Pratviel
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2015, tom: 21, strony: 6381-5.), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.201406409 - link do publikacji
  4. An efficient approach for conversion of 5-substituted 2-thiouridines built in RNA oligomers into corresponding desulfured 4-pyrimidinone products
    Autorzy:
    Anna Chwialkowska, Ewelina Wielgus, Grazyna Leszczynska, Milena Sobczak, Barbara Mikolajczyk, Elzbieta Sochacka, Barbara Nawrot
    Czasopismo:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (rok: 2015, tom: 25, strony: 3100-3104), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmcl.2015.06.019. - link do publikacji
  5. The influence of the C5 substituent on the 2-thiouridine desulfuration pathway and the conformational analysis of the resulting 4-pyrimidinone products
    Autorzy:
    Bartos P, Ebenryter-Olbinska K, Sochacka E, Nawrot B.
    Czasopismo:
    Bioorg Med Chem (rok: 2015, tom: 23, strony: 5587-94), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmc.2015.07.030 - link do publikacji
  6. Desulfuration of 2-thiouridine with hydrogen peroxide in the physiological pH range 6.6-7.6 is pH-dependent and results in two distinct products
    Autorzy:
    E. Sochacka, P. Bartos , K. Kraszewska, B. Nawrot
    Czasopismo:
    Bioorg. Med. Chem. Lett. (rok: 2013, tom: 23, strony: 5803-5805), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmcl.2013.08.114. - link do publikacji
  7. Nucleoside modifications in the regulation of gene expression: focus on tRNA
    Autorzy:
    Markus Duechler, Grazyna Leszczynska, Elzbieta Sochacka, Barbara Nawrot
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (CMLS) , Wydawca: SPRINGER
    Status:
    Złożona
    Doi:
    CMLS-S-15-01191 - link do publikacji
  1. The possible pathway of oxone-mediated desulfuration of 2-thiouridine
    Autorzy:
    Paulina Bartos L. Piotrowski, B. Nawrot, G. Pratviel, E. Sochacka
    Konferencja:
    XVI Symposium on Chemistry on Nucleic Acid Components, Cesky Krumlov, (rok: 2014, ), Wydawca: Institute of Organic Chemsitry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic
    Data:
    konferencja 8-13.06.2014
    Status:
    Opublikowana
  2. CHEMICAL TRANSFORMATION OF 2-THIOURIDINE INTO 2-SELENO-URIDINE VIA NEWLY DISCOVERED S-GERANYL-2-THIOURIDINE
    Autorzy:
    Anna ROSINSKA, Anna MACIASZEK, Paulina BARTOS, Elzbieta SOCHACKA, Barbara NAWROT
    Konferencja:
    XVI Symposium on Chemistry on Nucleic Acid Components, Cesky Krumlov, (rok: 2014, ), Wydawca: Institute of organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic
    Data:
    konferencja 8-13.06.2014
    Status:
    Opublikowana