Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa sygnalizacja w nieswoistej odpowiedzi immunologicznej: analiza eksperymentalna i matematyczna

2011/03/B/NZ2/00281

Słowa kluczowe:

szlaki sygnałowe IRF3 NF-kB stymulacja LPS obrazowanie pojedyńczych komórek białka znaczone fluorescencyjnie układy mikroprzepływowe

Deskryptory:

  • NZ2_9: Biologia systemowa
  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ3_7: Przekaźnictwo sygnału

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Tomasz Lipniacki 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 562 761 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-08-01

Zakończenie projektu: 2016-02-05

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. karta wielofunkcyjna DAQ. Za kwotę 12 000 PLN
  2. pakiet oprogramowania "LabView". Za kwotę 10 000 PLN
  3. trzy komputery klasy PC do obsługi aparatury pomiarowej, analizy danych pomiarowych oraz symulacji numerycznych. Za kwotę 12 565 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  1. Dynamic cross talk model of the epithelial innate immune response to double-stranded RNA stimulation: coordinated dynamics emerging from cell-level noise
    Autorzy:
    Bertolusso R, Tian B, Zhao Y, Vergara L, Sabree A, Iwanaszko M, Lipniacki T, Brasier AR, Kimmel M
    Czasopismo:
    PLOS One (rok: 2014, tom: 9, strony: e93396), Wydawca: PUBLIC LIBRARY SCIENCE
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0093396 - link do publikacji
  2. Clustering reveals limits of parameter identifiability in multi-parameter models of biochemical dynamic
    Autorzy:
    Nienałtowski K., Włodarczyk M., Lipniacki T., Komorowski M.
    Czasopismo:
    BMC SYSTEMS BIOLOGY (rok: 2015, tom: 0,420138888888889, strony: 45300), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12918-015-0205-8 - link do publikacji
  3. Stability of bacterial toggle switches is enhanced by cell-cycle lengthening by several orders of magnitude
    Autorzy:
    Jaruszewicz J, Kimmel M, Lipniacki T
    Czasopismo:
    Physical Review E (rok: 2014, tom: 89, strony: 22710), Wydawca: AMER PHYSICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1103/PhysRevE.89.022710 - link do publikacji
  4. Computational Analysis of an Autophagy/Translation Switch Based on Mutual Inhibition of M TORC1 and ULK1
    Autorzy:
    Szymańska P, Martin KR, MacKeigan JP , Hlavacek WS, Lipniacki T
    Czasopismo:
    PLOS One (rok: 2015, tom: 10, strony: e0116550), Wydawca: PUBLIC LIBRARY SCIENCE
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0116550 - link do publikacji
  5. Digital signaling decouples activation probability and population heterogeneity
    Autorzy:
    RA Kellogg, C Tian, T Lipniacki, SR Quake, S Tay
    Czasopismo:
    eLife (rok: 2015, tom: 4, strony: e08931), Wydawca: eLife Sciences Publications LTD
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.7554/eLife.08931 - link do publikacji
  6. Levels of pro-apoptotic regulator Bad and anti-apoptotic regulator Bcl-xL determine the type of the apoptotic logic gate
    Autorzy:
    Bogdał MN, Hat B, Kochańczyk M, Lipniacki T
    Czasopismo:
    BMC Systems Biology (rok: 2013, tom: 7, strony: 67), Wydawca: BIOMED CENTRAL LTD
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1752-0509-7-67 - link do publikacji
  7. Cell fate in antiviral response is decided in the crosstalk of the IRF, NF-κB and JAK/STAT pathways
    Autorzy:
    Czerkies M, Korwek Z, Prus W, Kochańczyk M, Jaruszewicz-Błońska J, Tudelska K, Błoński S, Kimmel M, Brasier AR, Lipniacki T
    Czasopismo:
    Nature Communications , Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Złożona
  8. Effective reaction rates in diffusion-limited phosphorylation-dephosphorylation cycles
    Autorzy:
    Szymańska P, Kochańczyk M, Miękisz J, Lipniacki T
    Czasopismo:
    Physical Review E (rok: 2015, tom: 91, strony: 22702), Wydawca: AMER PHYSICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1103/PhysRevE.91.022702 - link do publikacji
  9. Spontaneous NF-κB Activation by Autocrine TNFα Signaling: A Computational Analysis
    Autorzy:
    Pękalski J, Zuk PJ, Kochańczyk M, Junkin M, Kellog R, Tay S, Lipniacki T
    Czasopismo:
    PLOS One (rok: 2013, tom: 8, strony: e78887), Wydawca: PUBLIC LIBRARY SCIENCE
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0078887 - link do publikacji