Projekty finansowane przez NCN
Gruboziarnista dynamika molekularna termometrów RNA w podwyższonej temperaturze
2011/03/N/NZ2/02482
Słowa kluczowe:
termometry RNA gruboziarniste pole siłowe algorytmy ewolucyjne dynamika molekularna
Deskryptory:
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- NZ1_3: Biofizyka
- ST6_8: Systemy inteligentne
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 250 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-09-18
Zakończenie projektu: 2014-09-17
Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Licencja Adobe Acrobat Pro PL.
- Licencja Adobe Illustrator CS6.
- Licencja MS Office Pro 2010.
- Moduł USB do zbierania danych z czujnikiem wilgotności.
- Laptop Inspiron 5523. Za kwotę 5 600 PLN
- Licencja Symantec Endpoint Protection.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Publikacje książkowe (1)
- Evolutionary Algorithm in the Optimization of a Coarse-Grained Force FieldAutorzy:Filip Leonarski, Fabio Trovato, Valentina Tozzini, Andrzej Leś, Joanna TrylskaCzasopismo:Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2013, tom: 9, strony: 4874-4889), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/ct4005036 - link do publikacji
- RedMDStream: Parameterization and Simulation Toolbox for Coarse-Grained Molecular Dynamics ModelsAutorzy:Filip Leonarski, Joanna TrylskaCzasopismo:Biophysical Journal (rok: 2015, tom: 108, strony: 1843-1847), Wydawca: Cell PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.bpj.2015.03.023 - link do publikacji
- Modeling Nucleic Acids at the Residue-Level ResolutionAutorzy:Filip Leonarski, Joanna TrylskaKsiążka:Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics (rok: 2013, tom: 1, strony: 109-149), Wydawca: SpringerStatus:Opublikowana