Projekty finansowane przez NCN
Badania struktury drugorzędowej RNA in vivo z zastosowaniem metod wysokowydajnego sekwencjonowania
2011/03/D/NZ2/03304
Słowa kluczowe:
transkryptomika RNA struktura drugorzędowa RNA wysokowydajne sekwencjonowanie siRNA
Deskryptory:
- NZ2_1: Genetyka molekularna
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii UAM
woj. wielkopolskie
Konkurs: SONATA 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 994 324 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-09-17
Zakończenie projektu: 2018-03-16
Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- AGouTI - flexible Annotation of Genomic and Transcriptomic IntervalsAutorzy:Jan G. Kosiński, Marek ŻywickiCzasopismo:PLOS Computational Biology (rok: 2023, tom: 19, strony: e1011527), Wydawca: Public Library of ScienceStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pcbi.1011527 - link do publikacji
- The Evaluation of SHAPE-MaP RNA Structure Probing Protocols Reveals a Novel Role of Mn2+ in the Detection of 2′-OH AdductsAutorzy:Kamilla Grzywacz, Agnieszka Chełkowska-Pauszek, Marianna Plucinska-Jankowska, Marek ŻywickiCzasopismo:International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 7890), Wydawca: MDPIStatus:OpublikowanaDoi:10.3390/ijms24097890 - link do publikacji
- Suitability of high-throughput DMS-probing data for constraining the secondary structure prediction of small RNAsAutorzy:Marianna Plucinska, Kamilla Bąkowska-Żywicka, Marek ŻywickiCzasopismo:BioTechnologia (rok: 2016, tom: 97(3), strony: 161-167), Wydawca: Termedia Publishing HouseStatus:OpublikowanaDoi:10.5114/bta.2016.62353 - link do publikacji