Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania strukturalne proteinaz o nieznanym mechanizmie katalitycznym. Utworzenie unikatowego zespołu badań strukturalnych w ramach Uniwersytetu Jagiellońskiego i Małopolskiego Centrum Biotechnologii

2011/01/D/NZ1/01169

Słowa kluczowe:

proteinazy enzymy proteolityczne mechanizm katalizy badania strukturalne

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

UNIWERSYTET JAGIELLOŃSKI

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Grzegorz Dubin 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: SONATA 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 996 550 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06

Zakończenie projektu: 2015-06-05

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do elektroforezy.
  2. Zestaw pipet. Za kwotę 4 500 PLN
  3. Dewar transportowy CX100. Walizka transportowa do CX100. Za kwotę 8 500 PLN
  4. Monitor LCD/LED, Notebook. Za kwotę 4 500 PLN
  5. Mikrowirówka z chłodzeniem. Wirnik kątowy.. Za kwotę 12 500 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Atomic resolution crystal structure of HV-BBI protease inhibitor from amphibian skin in complex with bovine trypsin
    Autorzy:
    Grudnik, P., Debowski, D., Legowska, A., Malicki, S., Golik, P., Karna, N., Rolka, K., Dubin, G.
    Czasopismo:
    Proteins (rok: 2015, tom: 83, strony: 582-589), Wydawca: Wiley Periodicals Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/prot.24750 - link do publikacji
  2. Development and binding characteristics of phosphonate inhibitors of SplA protease from Staphylococcus aureus
    Autorzy:
    Ewa Burchacka, Michal Zdzalik, Justyna-Stec Niemczyk, Katarzyna Pustelny, Grzegorz Popowicz, Benedykt Wladyka, Adam Dubin, Jan Potempa, Marcin Sienczyk, Grzegorz Dubin, Jozef Oleksyszyn
    Czasopismo:
    Protein Science (rok: 2014, tom: 23, strony: 179-189), Wydawca: Wiley-Blackwell
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/pro.2403 - link do publikacji
  3. Evaluation of P1' substrate specificity of staphylococcal SplB protease
    Autorzy:
    Katarzyna Pustelny, Natalia Stach, Benedykt Wladyka, Adam Dubin and Grzegorz Dubin
    Czasopismo:
    Acta Biochimica Polonica (rok: 2014, tom: 61, strony: 149-152), Wydawca: Polish Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
  4. Bacterial proteases in disease - role in intracellular survival, evasion of coagulation/fibrinolysis innate defenses, toxicoses and viral infections.
    Autorzy:
    Dubin, G., Koziel, J., Pyrc, K., Wladyka, B., Potempa. J.
    Czasopismo:
    Current Pharmaceutical Design (rok: 2012, tom: 19, strony: 1090-1113), Wydawca: Bentham Science Publishing Ltd.
    Status:
    Opublikowana
  5. Biochemical and Structural Characterization of SplD Protease from Staphylococcus aureus
    Autorzy:
    Zdzalik, M., Kalinska, M., Wysocka, M., Stec-Niemczyk, J., Cichon, P., Stach, N., Gruba, N., Stennicke, H.R., Jabaiah, A., Markiewicz, M., Kedracka-Krok, S., Wladyka, B., Daugherty, P.S., Lesner, A., Rolka, K., Dubin, A., Potempa, J., Dubin, G.
    Czasopismo:
    Plos ONE (rok: 2013, tom: 8, strony: e76812), Wydawca: Public Library Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0076812 - link do publikacji
  6. Insights into eukaryotic Rubisco assembly - Crystal structures of RbcX chaperones from Arabidopsis thaliana.
    Autorzy:
    Kolesinski, P., Golik, P., Grudnik, P., Piechota, J., Markiewicz, M., Tarnawski, M., Dubin, G., Szczepaniak, A.
    Czasopismo:
    BBA General Subjects (rok: 2013, tom: 1830, strony: 2899-2906), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagen.2012.12.025 - link do publikacji
  7. Staphylococcal SplB Serine Protease Utilizes a Novel Molecular Mechanism of Activation
    Autorzy:
    Katarzyna Pustelny, Michal Zdzalik, Natalia Stach, Justyna Stec-Niemczyk, Przemyslaw Cichon, Anna Czarna, Grzegorz Popowicz, Pawel Mak, Marcin Drag, Guy S. Salvesen, Benedykt Wladyka, Jan Potempa, Adam Dubin, Grzegorz Dubin
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2014, tom: 289, strony: 15544-15553), Wydawca: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M113.507616 - link do publikacji
  8. Structural basis of GD2 ganglioside and mimetic peptide recognition by 14G2a antibody
    Autorzy:
    Horwacik, I., Golik, P., Grudnik, P., Kolinski, M., Zdzalik, M., Rokita, H., Dubin, G.
    Czasopismo:
    Molecular and Cellular Proteomics (rok: 2015, tom: 14, strony: 2577-2590), Wydawca: American Society for Biochemisty and Molecular Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/mcp.M115.052720 - link do publikacji