Wyszukiwarka projektów

NAHR-mediated copy-number variants in a clinical population: Mechanistic insights into both genomic disorders and Mendelizing traits.

Autorzy:

Dittwald P, Gambin T, Szafranski P, Li J, Amato S, Divon MY, Rodríguez Rojas LX, Elton LE, Scott DA, Schaaf CP, Torres-Martinez W, Stevens AK, Rosenfeld JA, Agadi S, Francis D, Kang SH, Breman A, Lalani SR, Bacino CA, Bi W, Milosavljevic A, Beaudet AL, Patel A, Shaw CA, Lupski JR, Gambin A, Cheung SW, Stankiewicz P

Czasopismo:

Genome Research (rok: 2013, tom: 23(9), strony: 1395-13409), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1101/gr.152454.112 – link do publikacji

StochDecomp--Matlab package for noise decomposition in stochastic biochemical systems.

Autorzy:

Jetka T, Charzyńska A, Gambin A, Stumpf MP, Komorowski M.

Czasopismo:

Bioinformatics. (rok: 2014, tom: 30(1), strony: 137-138), Wydawca: Oxford University Press

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1093/bioinformatics/btt631 – link do publikacji

Towards automated discrimination of lipids versus peptides from full scan mass spectra.

Autorzy:

Dittwald P, Nghia VT, Harris GA, Caprioli RM, Van de Plas R, Laukens K, Gambin A, Valkenborg D.

Czasopismo:

EuPA Open Proteom. (rok: 2014, tom: 4, strony: 87-100), Wydawca: Elsevier ( European Proteomics Association )

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1016/j.euprot.2014.05.002 – link do publikacji

On the Fine Isotopic Distribution and Limits to Resolution in Mass Spectrometry.

Autorzy:

Dittwald P, Valkenborg D, Claesen J, Rockwood AL, Gambin A.

Czasopismo:

J Am Soc Mass Spectrom. (rok: 2015, tom: 1, strony: 46036), Wydawca: Springer

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1007/s13361-015-1180-4 – link do publikacji

Computational modeling of sphingolipid metabolism.

Autorzy:

Wronowska W, Charzyńska A, Nienałtowski K, Gambin A.

Czasopismo:

BMC Syst Biol. (rok: 2015, tom: 0,407638888888889, strony: 46038), Wydawca: BioMed Central

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1186/s12918-015-0176-9. – link do publikacji

State-dependent swap strategies and automatic reduction of number of temperatures in adaptive parallel tempering algorithm

Autorzy:

MK Łącki B Miasojedow

Czasopismo:

Stat Comput (rok: 2015, tom: 1, strony: 46037), Wydawca: Springer

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1007/s11222-015-9579-0 – link do publikacji

Delete or merge regressors for linear model selection.

Autorzy:

A. Maj-Kanska, P. Pokarowski and A. Prochenka

Czasopismo:

Electronic Journal of Statistics (rok: 2015, tom: 9, strony: 1749-1778), Wydawca: The Institute of Mathematical Statistics and the Bernoulli Society

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1214/15-EJS1050 – link do publikacji

Effective reaction rates in diffusion-limited phosphorylation-dephosphorylation cycles

Autorzy:

Paulina Szymańska, Marek Kochańczyk, Jacek Miękisz, and Tomasz Lipniacki

Czasopismo:

Phys. Rev. E (rok: 2015, tom: 91, strony: 22702), Wydawca: American Physical Society

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1103/PhysRevE.91.022702 – link do publikacji

Computational models of the JAK1/2-STAT1 signaling.

Autorzy:

Gambin A, Charzyńska A, Ellert-Miklaszewska A, Rybiński M.

Czasopismo:

Jak Stat (rok: 2013, tom: 0,0854166666666667, strony: e24672), Wydawca: Landes Bioscience

Status:

Opublikowana

DOI:

10.4161/jkst.24672 – link do publikacji

BRAIN: a universal tool for high-throughput calculations of the isotopic distribution for mass spectrometry.

Autorzy:

Dittwald P, Claesen J, Burzykowski T, Valkenborg D, Gambin A.

Czasopismo:

Analytical Chemistry (rok: 2013, tom: 85(4), strony: 1991-1994), Wydawca: ACS Publications

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1021/ac303439m. – link do publikacji

Multiple samples aCGH analysis for rare CNVs detection

Autorzy:

Sykulski M, Gambin T, Bartnik M, Derwińska K, Wiśniowiecka-Kowalnik B, Stankiewicz P, Gambin A.

Czasopismo:

Journal of Clinical Bioinformatics (rok: 2013, tom: 11;3(1):12., strony: -), Wydawca: BioMed Central

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1186/2043-9113-3-12 – link do publikacji

An efficient method to calculate the aggregated isotopic distribution and exact center-masses.

Autorzy:

Claesen J, Dittwald P, Burzykowski T, Valkenborg D.

Czasopismo:

J Am Soc Mass Spectrom (rok: 2012, tom: 23(4), strony: 753-763), Wydawca: Springer Science+Business Media (USA)

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1007/s13361-011-0326-2 – link do publikacji

Modelling the efficacy of hyperthermia treatment.

Autorzy:

Rybinski M, Szymanska Z, Lasota S, Gambin A.

Czasopismo:

Journal of the Royal Society Interface (rok: 2013, tom: 10(88), strony: 20130527), Wydawca: The Royal Society

Status:

Opublikowana

DOI:

link do publikacji

Functional performance of aCGH design for clinical cytogenetics.

Autorzy:

Gambin T, Stankiewicz P, Sykulski M, Gambin A.

Czasopismo:

Computers in Biology and Medicine (rok: 2013, tom: 43(6), strony: 775-785), Wydawca: Elsevier

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1016/j.compbiomed.2013.02.008 – link do publikacji

Comment on Computation of Isotopic Peak Center-Mass Distribution by Fourier Transform

Autorzy:

Hu H, Dittwald P, Zaia J, Valkenborg D.

Czasopismo:

Analytical Chemistry (rok: 2013, tom: 85(24), strony: 12189-12192), Wydawca: ACS Publications

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1021/ac402731h – link do publikacji

Small noncoding differentially methylated copy-number variants, including lncRNA genes, cause a lethal lung developmental disorder.

Autorzy:

Szafranski P, Dharmadhikari AV, Brosens E, Gurha P, Kolodziejska KE, Zhishuo O, Dittwald P, Majewski T, Mohan KN, Chen B, Person RE, Tibboel D, de Klein A, Pinner J, Chopra M, Malcolm G, Peters G, Arbuckle S, Guiang SF 3rd, Hustead VA, Jessurun J, Hirsch R, Witte DP, Maystadt I, Sebire N, Fisher R, Langston C, Sen P, Stankiewicz P.

Czasopismo:

Genome Research (rok: 2013, tom: 23(1), strony: 23-33), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1101/gr.141887.112 – link do publikacji

Inferring serum proteolytic activity from LC-MS/MS data.

Autorzy:

Dittwald P, Ostrowski J, Karczmarski J, Gambin A.

Czasopismo:

BMC Bioinformatics (rok: 2012, tom: 5:S7, strony: 46031), Wydawca: BioMed Central

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1186/1471-2105-13-S5-S7 – link do publikacji

Inverted low-copy repeats and genome instability--a genome-wide analysis.

Autorzy:

Dittwald P, Gambin T, Gonzaga-Jauregui C, Carvalho CM, Lupski JR, Stankiewicz P, Gambin A.

Czasopismo:

Human Mutation (rok: 2013, tom: 34(1), strony: 210-220), Wydawca: Wiley-Liss on behalf of the Human Genome Variation Society

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1002/humu.22217 – link do publikacji

Synthetic sickness or lethality points at candidate combination therapy targets in glioblastoma.

Autorzy:

Szczurek E, Misra N, Vingron M.

Czasopismo:

Int J Cancer (rok: 2013, tom: 133(9), strony: 2123-2132), Wydawca: John Wiley & Sons on behalf of the Union for International Cancer Control

Status:

Opublikowana

DOI:

10.1002/ijc.28235 – link do publikacji

Sensitivity analysis of mathematical models of signaling pathways

Autorzy:

Agata Charzyńska, Anna Nałęcz, Mikołaj Rybiński, Anna Gambin

Czasopismo:

Biotechnologia (rok: 2012, tom: 93(3), strony: 291-308), Wydawca: Biotechnology Committee Polish Academy of Sciences and the Institute of Bioorganic Chemistry Polish Academy of Sciences

Status:

Opublikowana

Efficient and Error-Tolerant Sequencing Read Mapping

Autorzy:

Piotr Jaroszyński, Norbert Dojer

Konferencja:

International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (rok: 2013, strony: 353-364), Wydawca: Francisco Ortuno, Ignacio Rojas

Data:

konferencja 18-20.03

Status:

Opublikowana