Projekty finansowane przez NCN
seQinspector - analiza mechanizmów regulacji transkrypcji genów w skali całego genomu
2011/01/N/NZ2/04827
Słowa kluczowe:
regulacja transkrypcji immunoprecypitacja chromatyny genomika czynnik transkrypcyjny sekwencjonowanie nowej generacji bioinformatyka
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15
Przyznana kwota: 94 800 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06
Zakończenie projektu: 2013-12-05
Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Serwer bazodanowy. Za kwotę 20 700 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- AnnoGene: RESTful web service for annotating genomic featuresAutorzy:Tomski A, Piechota M, Przewłocki RCzasopismo:Journal of Applied Computer Science Methods (rok: 2014, tom: 6, strony: 101-110), Wydawca: Academy of Management SWSPiZ, IT InstituteStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji
- Common transcriptional effects in the mouse striatum following chronic treatment with heroin and methamphetamineAutorzy:Piechota M, Korostynski M, Sikora M, Golda S, Dzbek J, Przewlocki RCzasopismo:Genes, Brain and Behavior (rok: 2012, tom: 2012 Jun;11(4), strony: 404-14), Wydawca: Blackwell Publishing Ltd and InternationalStatus:OpublikowanaDoi:10.1111/j.1601-183X.2012.00777.x. - link do publikacji
- Seqinspector: position-based navigation through the ChIP-seq data landscape to identify gene expression regulatorsAutorzy:Piechota M, Korostynski M, Tomski A, Przewlocki RCzasopismo:BMC Bioinformatics (rok: 2015, tom: -, strony: -), Wydawca: Pubmed CentralStatus:ZłożonaDoi: