Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

seQinspector - analiza mechanizmów regulacji transkrypcji genów w skali całego genomu

2011/01/N/NZ2/04827

Słowa kluczowe:

regulacja transkrypcji immunoprecypitacja chromatyny genomika czynnik transkrypcyjny sekwencjonowanie nowej generacji bioinformatyka

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Farmakologii PAN

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Marcin Piechota 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 94 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06

Zakończenie projektu: 2013-12-05

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer bazodanowy. Za kwotę 20 700 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  1. AnnoGene: RESTful web service for annotating genomic features
    Autorzy:
    Tomski A, Piechota M, Przewłocki R
    Czasopismo:
    Journal of Applied Computer Science Methods (rok: 2014, tom: 6, strony: 101-110), Wydawca: Academy of Management SWSPiZ, IT Institute
    Status:
    Złożona
  2. Common transcriptional effects in the mouse striatum following chronic treatment with heroin and methamphetamine IF: 3,59
    Autorzy:
    Piechota M, Korostynski M, Sikora M, Golda S, Dzbek J, Przewlocki R
    Czasopismo:
    Genes, Brain and Behavior (rok: 2012, tom: 2012 Jun;11(4), strony: 404-14), Wydawca: Blackwell Publishing Ltd and International
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/j.1601-183X.2012.00777.x. - link do publikacji
  3. Seqinspector: position-based navigation through the ChIP-seq data landscape to identify gene expression regulators IF: 2,58
    Autorzy:
    Piechota M, Korostynski M, Tomski A, Przewlocki R
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2015, tom: -, strony: -), Wydawca: Pubmed Central
    Status:
    Złożona