Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wpływ selekcji na genom rośliny uprawnej - identyfikacja i charakterystyka sekwencji, na które nakierowana była presja selekcyjna w trakcie udomowienia i hodowli żyta (Secale cereale L.).

2014/14/E/NZ9/00285

Słowa kluczowe:

żyto genomika strukturalna sekencjonowanie nowej generacji genotypowanie DArT zróżnicowanie genetyczne mapa genetyczna presja selekcyjna

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ9_12: Ochrona zasobów genetycznych
  • NZ9_1: Naukowe podstawy agronomii

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Wydział Ogrodnictwa, Biotechnologii i Architektury Krajobrazu

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Hanna Bolibok-Brągoszewska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 4 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 1 834 141 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-06-03

Zakończenie projektu: 2022-12-02

Planowany czas trwania projektu: 90 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Zakupiona aparatura

  1. komputer z oprogramowaniem Windows Office (4 szt.). Za kwotę 18 000 PLN
  2. zamrażarka (-20 stopni C). Za kwotę 3 000 PLN
  3. zestaw pipet (3 szt.). Za kwotę 16 500 PLN
  4. lodówka. Za kwotę 2 500 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (9)
  1. Deep sampling and pooled amplicon sequencing reveals hidden genic variation in heterogeneous rye accessions
    Autorzy:
    Anna Hawliczek, Leszek Bolibok, Katarzyna Tofil, Ewa Borzęcka, Joanna Jankowicz-Cieślak, Piotr Gawroński, Adam Kral, Bradley J. Till, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2020, tom: 21, strony: nie dotyczy), Wydawca: BioMed Central Ltd/Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12864-020-07240-3 - link do publikacji
  2. Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential
    Autorzy:
    Timothy Rabanus-Wallace, M; Hackauf, Bernd; Mascher, Martin; Lux, Thomas; Wicker, Thomas; Gundlach, Heidrun; Baez, Mariana; Houben, Andreas; X Mayer, Klaus F; Guo, Liangliang; Poland, Jesse Pozniak, Curtis J; Walkowiak, Sean; Melonek, Joanna; Praz, Coraline R; Schreiber, Mona; Budak, Hikmet; Heuberger, Matthias; Steuernagel, Burkhard; Wulff, Brande; Börner, Andreas ;Byrns, Brook ;Čížková, Jana; Brian Fowler, D; Fritz, Allan; Himmelbach, Axel; Kaithakottil, Gemy; Keilwagen, Jens; Keller, Beat; Konkin, David; Larsen, Jamie; Li, Qiang; Myśków, Beata; Padmarasu, Sudharsan; Rawat, Nidhi; Sesiz, Uğur; Biyiklioglu-Kaya, Sezgi; Sharpe, Andy; Šimková, Hana; Small, Ian; Swarbreck, David; Toegelová, Helena; Tsvetkova, Natalia; Voylokov, Anatoly V ;Vrána, Jan; Bauer, Eva; Bolibok-Bragoszewska, Hanna; Doležel, Jaroslav; Hall, Anthony; Jia, Jizeng; Korzun, Viktor; Laroche, André; Ma, Xue-Feng; Ordon, Frank; Özkan, Hakan; Rakoczy-Trojanowska, Monika; Scholz, Uwe; Schulman, Alan H; Siekmann, Dörthe; Stojałowski, Stefa;n Tiwari, Vijay K; Spannagl, Manuel; Stein, Nils
    Czasopismo:
    Nature Genetics (rok: 2021, tom: 53, strony: 564-573), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41588-021-00807-0 - link do publikacji
  3. Selective sweeps identification in distinct groups of cultivated rye (Secale cereale L.) germplasm provides potential candidate genes for crop improvement.
    Autorzy:
    Anna Hawliczek, Ewa Borzęcka, Katarzyna Tofil, Nikolaos Alachiotis, Leszek Bolibok, Piotr Gawroński, Dörthe Siekmann, Bernd Hackauf, Roman Dušinský, Miroslav Švec, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Czasopismo:
    BMC Plant Biology (rok: 2023, tom: 23, strony: 323), Wydawca: SpringerNature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12870-023-04337-1 - link do publikacji
  4. Effective BAC clone anchoring with genotyping-by-sequencig and Diveristy Arrays Technology in a large genome cereal rye
    Autorzy:
    Ewa Borzęcka, Anna Hawliczek-Strulak, Leszek Bolibok, Piotr Gawroński, Katarzyna Tofil, Paweł Milczarski, Stefan Stojałowski, Beata Myśków, Małgorzata Tagońska-Karasek, Agnieszka Grądzielewska, Miłosz Smolik, Andrzej Kilian, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: 8428), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-26541-y - link do publikacji
  1. Insights into influence of domestication and selection on the rye (Secale L.) genome based on GBS genotyping of diverse accessions with different origin and improvement status
    Autorzy:
    Anna Hawliczek, Ewa Borzęcka, Nikolaos Alachiotis, Katarzyna Tofil, Piotr Gawroński, Dörthe Siekmann, Bernd Hackauf, Roman Dušinský, Miroslav Švec, Hanna Bolibok-Brągoszewska
    Konferencja:
    5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding (rok: 2019, ), Wydawca: AKJournals AkCongress
    Data:
    konferencja 4-7 November
    Status:
    Opublikowana
  2. Identyfikacja śladów presji selekcyjnej w genomach form żyta o różnym pochodzeniu i stopniu ulepszenia
    Autorzy:
    Hawliczek A, Borzecka E, Alachiotis A, Tofil K, Gawroński P, Siekman D, Hackakuf B, Dusinsky R, Svec M, Bolibok-Bragoszewska H
    Konferencja:
    Genetyka aplikacyjna roślin - wyzwania XXI wieku (rok: 2021, ), Wydawca: KGHiBR SGGW
    Data:
    konferencja 22-24.09.
    Status:
    Opublikowana
  3. Development of an efficient Ecotilling protocol for rye
    Autorzy:
    Hawliczek-Strulak A, Till B, Jankowicz-Cieślak J, Borzęcka E, Tofil K, Kral A, Bolibok-Brągoszewska H
    Konferencja:
    8th International Triticeae Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Helmut Knupffer
    Data:
    konferencja June 12-16
    Status:
    Opublikowana
  4. Development of genomics resources in a large-genome non-model species Secale cereale L
    Autorzy:
    Bolibok-Brągoszewska H, Gawroński P, Hawliczek-Strulak A, Borzęcka E, Tofil K, Pawełkowicz M, Schmittner K, Ringauf A, Plader W
    Konferencja:
    Polski Kongres Genetyki (rok: 2016, ), Wydawca: Polskie Towarzystwo Genetyczne
    Data:
    konferencja 19-22 września
    Status:
    Opublikowana
  5. Markery molekularne nowej generacji w genomice żyta
    Autorzy:
    Hanna Bolibok-Brągoszewska, Anna Hawliczek-Strulak, Ewa Borzęcka, Katarzyna Tofil
    Konferencja:
    Nowe osiągnięcia polskich zespołów badawczych w dziedzinie genetyki, hodowli i biotechnologii roślin (rok: 2016, ), Wydawca: Wydział Kształtowania Środowiska i Rolnictwa, Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny
    Data:
    konferencja 8-10 czerwca
    Status:
    Opublikowana
  6. Analiza genetycznego zróznicowania wewnątrz-i miedzyodmianowego u żyta z różnych obszarów geograficznych
    Autorzy:
    Kutlug Onal I, Kielak O, Hawliczek A, Abuya H, Droszcz M, Ur Rehman S, Bolibok-BragoszewskaH
    Konferencja:
    Konferencja Naukowa "Genetyka Aplikacyjna Roślin - wyzwania XXI wieku" (rok: 2021, ), Wydawca: SGGW KGHiBR
    Data:
    konferencja 22-24.09.
    Status:
    Opublikowana
  7. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie w ocenie zróżnicowania genów oraz w identyfikacji ich funkcjonalnych wariantów
    Autorzy:
    ANNA HAWLICZEK, BRADLEY TILL, JOANNA JANKOWICZ-CIEŚLAK, EWA BORZĘCKA, KATARZYNA TOFIL, ADAM KRAL, HANNA BOLIBOK-BRĄGOSZEWSKA
    Konferencja:
    XIV OGÓLNOPOLSKA KONFERENCJA NAUKOWA NAUKA DLA HODOWLI I NASIENNICTWA ROŚLIN UPRAWNYCH ZAKOPANE, 5.02 — 8.02.2019r. (rok: 2019, ), Wydawca: INSTYTUT HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY
    Data:
    konferencja 5.02 — 8.02.2019
    Status:
    Opublikowana
  8. High-throughput anchoring of BAC clones to a rye genetic map using DArTseq technology
    Autorzy:
    Borzęcka E, Hawliczek-Strulak A, Tofli K, Gawroński P, Bolibok-Brągoszewska H
    Konferencja:
    8th International Triticeae Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: Helmut Knupfer
    Data:
    konferencja June 12-16
    Status:
    Opublikowana
  9. Biblioteka BAC i technologia Oxford Nanopore w poszukiwaniu genów warunkujących istotne użytkowo cechy żyta
    Autorzy:
    EWA BORZĘCKA, ANNA HAWLICZEK, PIOTR GAWROŃSKI, MAGDALENA PAWEŁKOWICZ, KATARZYNA TOFIL, HANNA BOLIBOK-BRĄGOSZEWSKA
    Konferencja:
    XIV OGÓLNOPOLSKA KONFERENCJA NAUKOWA NAUKA DLA HODOWLI I NASIENNICTWA ROŚLIN UPRAWNYCH ZAKOPANE, 5.02 — 8.02.2019 r. (rok: 2019, ), Wydawca: INSTYTUT HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN PAŃSTWOWY INSTYTUT BADAWCZY
    Data:
    konferencja 5.02 — 8.02.2019
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy