Projects funded by the NCN

Structure prediction of proteins and large protein assemblies guided by low-resolution or/and sparse experimental data.

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Next-generation sequencing of miRNA transcriptome and functional in vitro study: towards unravelling pathomechanisms and...

Call: OPUS 8 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Michał Witt

Instytut Genetyki Człowieka PAN

From junk to treasure - functional evolution of retrogenes

Call: OPUS 6 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Izabela Makałowska

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Targeted genomics of cardiovascular disease - multivariable genetic model of perioperative and long-term cardiovascular ...

Call: OPUS 5 , Panel: NZ5

Principal investigator: prof. Marek Sanak

Uniwersytet Jagielloński – Collegium Medicum, Collegium Medicum, Wydział Lekarski

Relationship between viral genome composition and virus-host interactions. Viral host prediction based on genomic sequen...

Call: PRELUDIUM 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: Wojciech Gałan

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

Bioinformatic analysis of GmrSD, a Type IV Modification-Dependent Restriction Systems

Call: PRELUDIUM 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: Magdalena Machnicka

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Analysis of the structure of regulatory sequences and prediction of gene expression dynamics.

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marta Iwanaszko

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Prediction of Cascade complex structure.

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Joanna Kasprzak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Bioinformatics and biophysical models of NF-kappaB binding sites in DNA: genome-wide prediction of binding sites, experi...

Call: OPUS 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Structural RNomics

Call: MAESTRO 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

New bioinformatics method for predicting ligand-binding sites in RNA structures

Call: PRELUDIUM 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Anna Philips

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

Comprehensive prediction of cooperative regulatory elements in eukaryotic genomes

Call: PRELUDIUM 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: Aleksander Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Conifers under pressure: genomic prediction of Juniperus communis L.vulnerability to ongoing climate change

Call: OPUS 26 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Monika Dering

Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu, Wydział Leśny i Technologii Drewna

Serum microRNAs as predictors for long-term type 2 diabetes remission after sleeve gastrectomy

Call: PRELUDIUM 21 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Gladys Wojciechowska

Uniwersytet Medyczny w Białymstoku

The use of genetic analysis of liquid biopsy for predicting and monitoring ofresponse to therapies and tumor evolution i...

Call: OPUS 22 , Panel: NZ7

Principal investigator: dr Magdalena Olbryt

Narodowy Instytut Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie - Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Gliwicach

Prediction-based normalization for developmental heterochrony in parallel molecular-level and phenomic studies in plants

Call: OPUS 22 (LAP) , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Paweł Krajewski

Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk

Multi-scale method for amyloid fibril assembly using protofilament structures predicted by coarse-grained docking simula...

Call: OPUS 22 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego Polskiej Akademii Nauk

Evolutionary genomics: Modeling and prediction of progression of breast and lung cancer

Call: OPUS 21 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Prediction and characterization of crossing-over landscape in oilseed rape (Brassica napus) using long-read sequencing a...

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: Piotr Kopeć

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Towards automatic derivation of geometry-based descriptors as surrogates for complex structural approaches in enzyme-sub...

Call: PRELUDIUM 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: Carlos Sequeiros Borja

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Identification and comprehensive classification of peptidases

Call: SONATA 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Kamil Steczkiewicz

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Predicting microbiome changes over time and upon perturbation: applications of machine learning to microbiome research a...

Call: SONATA 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Tomasz Kościółek

Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

Prediction of hosts from metagenomic viral sequences using alignment-free algorithms

Call: SONATA 14 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Andrzej Zieleziński

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Prediction and evolution of signal sequences in organelles of endosymbiotic origin.

Call: PRELUDIUM 16 , Panel: NZ2

Principal investigator: Katarzyna Sidorczuk

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

Using transcriptomic data for identification of new miRNAs and prediction of miRNA gene structures

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Szcześniak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

Correlation of the HPV infection and miRNA expression for early prediction of cervical cancer

Call: PRELUDIUM 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: Justyna Pisarska

Uniwersytet Zielonogórski, Collegium Medicum

Development and application of interacting molecules prediction methods based on sequence coevolution.

Call: PRELUDIUM 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksandra Jarmolińska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Prediction of protein and peptide isoelectric point based on sequence and structure features

Call: OPUS 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Łukasz Kozłowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

The role of retrogenes in splicing regulation

Call: PRELUDIUM 14 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Magdalena Kubiak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Developement of new methods for designing RNA molecules that fold into desired spatial structures and their use for deve...

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Pharmacogenetics in predicting metabolic ratio of tamoxifen; genome-wide association study linked to mass spectrometry-b...

Call: OPUS 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Ewa Hennig

Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie

Predicting synthetic lethality in cancer

Call: POLONEZ 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Ewa Szczurek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Modelling signal peptides based on hidden semi-Markov models for various taxonomic groups of organisms and peptide types

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Michał Burdukiewicz

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

RNA structure prediction based on modeling the target sequence and homologous sequences

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Marcin Magnus

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Development of a method for the structure prediction of GPCRs complexes with agonists and antagonists, including the lig...

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN